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4个水稻恢复系品种全基因组SNP及主要农艺性状基因等位型分析

摘要第1-6页
Abstract第6-7页
第一章 文献综述第7-15页
 1 SNP 分子标记及其应用第7-12页
   ·SNP 的定义及特点第7-8页
     ·SNP 的定义第7页
     ·SNP 标记的特点第7-8页
   ·检测 SNP 的方法第8-10页
     ·低通量的 SNP 检测方法第8-9页
     ·中等通量的 SNP 分型方法第9页
       ·SNaPshot 法第9页
       ·生物质普法第9页
       ·高分辨溶解曲线分析法第9页
     ·高通量的 SNP 芯片第9-10页
   ·SNP 分子标记应用第10-12页
     ·Bin 图谱的开发与应用第10-11页
     ·DNA 指纹鉴定第11页
     ·全基因组关联分析(GWAS)及其验证第11页
     ·群体遗传学分析第11页
     ·全基因组的选择等方面第11页
     ·基于 SNP 技术的群体进化第11-12页
 2 SNP 标记在水稻中的研究进展及应用第12-14页
   ·水稻基因组 SNP 研究进展第12页
   ·利用 SNP 构建高密度的遗传连锁图第12-13页
   ·SNP 标记在水稻基因克隆和功能基因组学研究第13页
   ·利用 SNP 作标记辅助选择第13页
   ·SNP 在资源分配和物质进化中的应用第13-14页
 3 本试验的研究意义第14-15页
第二章 4个水稻恢复系品种间的 SNP 分析第15-23页
 1 材料与方法第15-16页
   ·供试材料第15-16页
     ·昌恢 891第15页
     ·昌恢 121第15页
     ·昌恢 T025第15页
     ·昌恢 0791第15-16页
   ·4个水稻恢复系品种的全基因组测序第16页
   ·SNP 标记分析第16页
 2 结果与分析第16-21页
   ·4个恢复系间及其与日本晴间的 SNP 标记数量和标记密度第16-18页
   ·4个恢复系间 12 条染色体 SNP 标记密度分布第18-21页
 3 小结与讨论第21-23页
第三章 4个水稻恢复系品种的主要农艺性状基因等位型分析第23-38页
 1 材料与方法第23-25页
   ·供试材料第23页
   ·主要农艺性状的等位型分析第23页
   ·Wx 基因第一个内含子 G/T 突变检测步骤第23-25页
     ·叶片总 DNA 的提取第23-25页
     ·PCR 反应第25页
     ·PCR 一步检测第25页
 2 结果与分析第25-36页
   ·GS3第25-26页
   ·Ghd7第26-27页
   ·Wx第27-29页
   ·ALK第29-30页
   ·Rf17第30-31页
   ·IPA1第31-32页
   ·EUI1第32-33页
   ·TAC1第33-34页
   ·GPA2第34页
   ·DTH2第34-35页
   ·OsCYT-INV1第35-36页
 3 小结与讨论第36-38页
   ·4个恢复系主要农艺性状基因育种中的应用第36-37页
   ·二代测序方法可靠性分析第37-38页
全文总结第38-39页
参考文献第39-45页
附录第45-46页
致谢第46页

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