| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-23页 |
| 1 连锁作图 | 第8-13页 |
| ·分子标记技术 | 第8-9页 |
| ·QTL 定位的原理及方法 | 第9-12页 |
| ·QTL 定位的步骤和原理 | 第9页 |
| ·QTL 定位群体 | 第9-10页 |
| ·QTL 定位方法 | 第10-12页 |
| ·单标记均值差检验法 | 第10-11页 |
| ·区间作图法(Interval Mapping, IM ) | 第11页 |
| ·复合区间作图法(Composite Interval Mapping, CIM) | 第11-12页 |
| ·基于混合线性模型的复合区间作图法(mixed-model-basedcomposite intervamapping, MCIM ) | 第12页 |
| ·QTL 定位软件以及阈值的确定 | 第12页 |
| ·QTL 定位的可靠性以及解决方法 | 第12-13页 |
| 2 水稻抽穗期研究进展 | 第13-19页 |
| ·水稻抽穗期的遗传 | 第13页 |
| ·水稻抽穗期的遗传分析 | 第13-14页 |
| ·水稻抽穗期基因定位 | 第14-15页 |
| ·感光性基因及其修饰基因的定位与基因间的互作分析 | 第14-15页 |
| ·基本营养生长性基因及其修饰基因的定位 | 第15页 |
| ·基本营养生长基因之间及其与感光基因和修饰基因的互作 | 第15页 |
| ·水稻抽穗期的 QTL 定位 | 第15-16页 |
| ·水稻抽穗期 QTL 位点间的互作 | 第16-17页 |
| ·水稻抽穗期 QTL 与质量性状基因间的等位性 | 第17页 |
| ·Hd1 与 Se-1 的等位性 | 第17页 |
| ·Hd3a 与 En-se-1 的等位性 | 第17页 |
| ·Hd4 与 E1 的等位性 | 第17页 |
| ·Ehd1 与 Ef-1 的等位性 | 第17页 |
| ·水稻抽穗期基因/QTL 的克隆 | 第17-19页 |
| 3 关联分析 | 第19-22页 |
| ·连锁不平衡的影响因素 | 第19-20页 |
| ·关联分析的基本方法 | 第20-21页 |
| ·水稻关联分析研究进展 | 第21页 |
| ·连锁作图和关联作图的整合 | 第21-22页 |
| 4 本试验研究的目的及意义 | 第22-23页 |
| 第二章 香丰 A 早熟性基因的定位分析 | 第23-38页 |
| 1 材料与方法 | 第23-27页 |
| ·试验材料 | 第23页 |
| ·试验方法 | 第23-27页 |
| ·试验材料的种植 | 第23页 |
| ·抽穗期的调查 | 第23页 |
| ·农艺性状分析 | 第23页 |
| ·DNA 提取 | 第23-25页 |
| ·SSR 反应体系和程序 | 第25页 |
| ·电泳检测和照相 | 第25-26页 |
| ·数据的处理和分析 | 第26页 |
| ·偏分离标记以及相似性位点和单株的剔除 | 第26页 |
| ·遗传图谱的构建和 QTL 定位 | 第26-27页 |
| 2 结果与分析 | 第27-35页 |
| ·香丰 A 所配组合的抽穗天数、株高和产量性状表现 | 第27-28页 |
| ·香丰 B 所配组合 F2群体的抽穗表现 | 第28-30页 |
| ·多态性引物的筛选和 F2单株基因型的检测 | 第30-31页 |
| ·偏分离标记，相似性位点和相似性单株的剔除 | 第31页 |
| ·遗传连锁图谱的构建 | 第31-34页 |
| ·抽穗期 QTL 的检测 | 第34-35页 |
| 3 小结与讨论 | 第35-36页 |
| ·qHd3 与前人的对比 | 第35-36页 |
| ·qHd5 与前人的对比 | 第36页 |
| ·qHd6 与前人的对比 | 第36页 |
| ·qHd10 与前人的对比 | 第36页 |
| 4 本试验存在的不足以及下一步工作 | 第36-38页 |
| 第三章 水稻抽穗期基因的关联分析 | 第38-51页 |
| 1 材料与方法 | 第38-39页 |
| ·试验材料 | 第38页 |
| ·材料种植和抽穗期调查 | 第38页 |
| ·SSR 分析 | 第38页 |
| ·数据处理 | 第38-39页 |
| ·数据的读取和转换 | 第38页 |
| ·遗传多样性分析 | 第38页 |
| ·基于遗传距离的聚类分析 | 第38页 |
| ·群体结构分析 | 第38页 |
| ·亲缘关系分析 | 第38页 |
| ·关联分析 | 第38-39页 |
| 2 结果与分析 | 第39-48页 |
| ·184 份水稻品种的表型多样性 | 第39页 |
| ·遗传多样性分析 | 第39-41页 |
| ·聚类分析和群体结构分析 | 第41-46页 |
| ·亲缘关系 | 第46页 |
| ·水稻抽穗期的关联分析 | 第46-48页 |
| ·2013 年南昌关联到的位点 | 第46-47页 |
| ·利用 MLM 关联到的位点 | 第46页 |
| ·利用 GLM 关联到的位点 | 第46-47页 |
| ·利用 MLM 和 GLM 关联分析结果的比较 | 第47页 |
| ·2014 年海南关联到的位点 | 第47-48页 |
| ·MLM 关联到的位点 | 第47页 |
| ·GLM 关联到的位点 | 第47-48页 |
| ·MLM 和 GLM 关联的结果比较 | 第48页 |
| ·南昌和海南调查的抽穗期关联结果比较 | 第48页 |
| ·MLM 模型的关联结果比较 | 第48页 |
| ·GLM 模型的关联结果比较 | 第48页 |
| 3 讨论 | 第48-51页 |
| ·群体结构 | 第48-49页 |
| ·不同模型进行的关联分析 | 第49页 |
| ·不同日照条件关联到的位点的差异 | 第49页 |
| ·关联分析结果与前人的比较 | 第49-51页 |
| 第四章 全文结论 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-60页 |
| 附录 | 第60-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
