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人P-糖蛋白构象转换的靶向分子动力学模拟

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-7页
第一章 文献综述第7-22页
   ·前言第7页
   ·人 P-糖蛋白第7-14页
     ·人 P-糖蛋白的正常生理功能第8页
     ·人 P-糖蛋白与多药耐药性之间的关系第8-9页
     ·人 P-糖蛋白的结构第9-12页
     ·人 P-gp 的构象转换第12-14页
   ·同源建模第14-17页
     ·同源建模的原理和方法第15-16页
     ·P-糖蛋白的同源建模第16-17页
   ·分子动力学模拟第17-20页
     ·分子动力学模拟的原理及方法第17-18页
     ·靶向分子动力学模拟第18-19页
     ·分子动力学模拟在人 P-糖蛋白研究中的应用第19-20页
   ·本文的研究目的和内容第20-22页
第二章 人 P-糖蛋白的同源建模第22-39页
   ·引言第22-23页
   ·同源建模的基本过程第23-28页
     ·选择模板第23页
     ·序列比对第23-24页
     ·模型初步构建及优化第24-25页
     ·模型选择第25页
     ·模型评估第25-28页
   ·结果与讨论第28-38页
     ·选择模板第28-29页
     ·序列比对第29-31页
     ·模板初步构建及优化第31页
     ·模型选择第31-34页
     ·模型评估第34-38页
   ·小结第38-39页
第三章 P-糖蛋白膜蛋白质复合体系的构建第39-53页
   ·引言第39-40页
   ·体系构建方法第40-45页
     ·初步构建膜蛋白质复合体系第40-43页
     ·能量最小化和平衡过程第43页
     ·模拟参数设置第43-44页
     ·分析方法第44-45页
   ·结果与讨论第45-52页
     ·初步构建的膜蛋白质复合体系第45-46页
     ·能量最小化和平衡过程第46-52页
   ·小结第52-53页
第四章 人 P-糖蛋白构象转换的靶向分子动力学模拟第53-79页
   ·引言第53-54页
   ·模拟系统与方法第54-56页
     ·分子动力学模拟过程第54-55页
     ·模拟参数设置第55页
     ·数据分析第55-56页
   ·结果与讨论第56-78页
     ·确定靶向 MD 模拟的最佳参数第57-60页
     ·对比初始构象和靶向构象第60-62页
     ·两个 NBD 之间的相对运动第62-67页
     ·TMD 的细胞内末端的相对运动第67-72页
     ·TMD 沿 y 方向打开第72-74页
     ·NBD 与 TMD 的界面第74-78页
   ·小结第78-79页
第五章 结论与展望第79-81页
   ·结论第79-80页
   ·创新点第80页
   ·展望第80-81页
参考文献第81-85页
致谢第85页

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