摘要 | 第1-4页 |
ABSTRACT | 第4-7页 |
第一章 文献综述 | 第7-22页 |
·前言 | 第7页 |
·人 P-糖蛋白 | 第7-14页 |
·人 P-糖蛋白的正常生理功能 | 第8页 |
·人 P-糖蛋白与多药耐药性之间的关系 | 第8-9页 |
·人 P-糖蛋白的结构 | 第9-12页 |
·人 P-gp 的构象转换 | 第12-14页 |
·同源建模 | 第14-17页 |
·同源建模的原理和方法 | 第15-16页 |
·P-糖蛋白的同源建模 | 第16-17页 |
·分子动力学模拟 | 第17-20页 |
·分子动力学模拟的原理及方法 | 第17-18页 |
·靶向分子动力学模拟 | 第18-19页 |
·分子动力学模拟在人 P-糖蛋白研究中的应用 | 第19-20页 |
·本文的研究目的和内容 | 第20-22页 |
第二章 人 P-糖蛋白的同源建模 | 第22-39页 |
·引言 | 第22-23页 |
·同源建模的基本过程 | 第23-28页 |
·选择模板 | 第23页 |
·序列比对 | 第23-24页 |
·模型初步构建及优化 | 第24-25页 |
·模型选择 | 第25页 |
·模型评估 | 第25-28页 |
·结果与讨论 | 第28-38页 |
·选择模板 | 第28-29页 |
·序列比对 | 第29-31页 |
·模板初步构建及优化 | 第31页 |
·模型选择 | 第31-34页 |
·模型评估 | 第34-38页 |
·小结 | 第38-39页 |
第三章 P-糖蛋白膜蛋白质复合体系的构建 | 第39-53页 |
·引言 | 第39-40页 |
·体系构建方法 | 第40-45页 |
·初步构建膜蛋白质复合体系 | 第40-43页 |
·能量最小化和平衡过程 | 第43页 |
·模拟参数设置 | 第43-44页 |
·分析方法 | 第44-45页 |
·结果与讨论 | 第45-52页 |
·初步构建的膜蛋白质复合体系 | 第45-46页 |
·能量最小化和平衡过程 | 第46-52页 |
·小结 | 第52-53页 |
第四章 人 P-糖蛋白构象转换的靶向分子动力学模拟 | 第53-79页 |
·引言 | 第53-54页 |
·模拟系统与方法 | 第54-56页 |
·分子动力学模拟过程 | 第54-55页 |
·模拟参数设置 | 第55页 |
·数据分析 | 第55-56页 |
·结果与讨论 | 第56-78页 |
·确定靶向 MD 模拟的最佳参数 | 第57-60页 |
·对比初始构象和靶向构象 | 第60-62页 |
·两个 NBD 之间的相对运动 | 第62-67页 |
·TMD 的细胞内末端的相对运动 | 第67-72页 |
·TMD 沿 y 方向打开 | 第72-74页 |
·NBD 与 TMD 的界面 | 第74-78页 |
·小结 | 第78-79页 |
第五章 结论与展望 | 第79-81页 |
·结论 | 第79-80页 |
·创新点 | 第80页 |
·展望 | 第80-81页 |
参考文献 | 第81-85页 |
致谢 | 第85页 |