摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-12页 |
第一章 背景介绍 | 第12-38页 |
1. 原核生物质粒主动分配机制基本介绍 | 第12-13页 |
2. 原核生物质粒主动分配系统分类 | 第13-15页 |
3. 着丝粒结合蛋白以及着丝粒结合蛋白和着丝粒形成的分配亚复合体的结构研究进展 | 第15-35页 |
·Ⅰa型着丝粒结合蛋白的结构 | 第16-25页 |
·Ⅰb型着丝粒结合蛋白的结构 | 第25-28页 |
·Ⅱ型着丝粒结合蛋白的结构 | 第28-34页 |
·总结 | 第34-35页 |
4. 本论文的研究基础和内容 | 第35-38页 |
·本论文的研究基础 | 第35-37页 |
·本论文的研究内容 | 第37-38页 |
第二章 材料和方法 | 第38-52页 |
1. 实验材料 | 第38-39页 |
·液体试剂与常用实验溶液 | 第38页 |
·蛋白质纯化缓冲溶液 | 第38-39页 |
2. 克隆的构建 | 第39-40页 |
3. 蛋白表达 | 第40-41页 |
·ParB(1-139)蛋白表达纯化 | 第40页 |
·ParB(60-139),ParB(65-139),和ParB(65-135)蛋白表达纯化 | 第40-41页 |
4. 限制性蛋白酶水解实验 | 第41页 |
5. 晶体的生长和优化 | 第41-45页 |
·晶体初筛 | 第41-43页 |
·晶体优化 | 第43-45页 |
6. 羟自由基足迹实验 | 第45-47页 |
·正反链3'末端标记 | 第45页 |
·双脱氧终止法制ladder | 第45-46页 |
·羟自由基足迹反应 | 第46-47页 |
7. 凝胶阻滞实验 | 第47-49页 |
·凝胶阻滞实验 | 第47-49页 |
·凝胶阻滞实验结果的分析 | 第49页 |
8. 等温滴定量热法 | 第49-50页 |
9. 电镜 | 第50-52页 |
第三章 结果和讨论 | 第52-92页 |
1. ParB的DNA结合结构域 | 第52-61页 |
·ParB的C端含有一个DNA结合结构域 | 第52-53页 |
·ParB C端DNA结合结构域晶体的生长和结构的解析 | 第53-55页 |
·ParB C端DNA结合结构域的RHH(Ribbon Helix Helix)结构 | 第55-57页 |
·ParB的同源蛋白 | 第57-59页 |
·讨论 | 第59-61页 |
2. ParB识别的着丝粒结合位点和ParB识别着丝粒的方式(生化) | 第61-74页 |
·ParB在着丝粒上有九个连续的没有间隔的结合位点 | 第61-64页 |
·ParB和不同的结合位点有不同的亲和力 | 第64-69页 |
·ParB对两个连续相同结合位点的结合协同性 | 第69-73页 |
·讨论 | 第73-74页 |
3. ParB识别着丝粒的方式(晶体结构) | 第74-86页 |
·ParB-DNA复合物晶体的生长与结构的解析 | 第74-78页 |
·非特异性结合ParB-DNA的晶体结构 | 第78-80页 |
·特异性结合的ParB-DNA晶体结构 | 第80-85页 |
·讨论 | 第85-86页 |
4. ParB和着丝粒形成的分配亚复合体 | 第86-92页 |
·晶体显示的分配亚复合体的高级螺旋结构 | 第86-87页 |
·电镜显示的分配亚复合体的高级螺旋结构 | 第87-89页 |
·讨论(分配亚复合体间的对比) | 第89-92页 |
第四章 研究工作总结与展望 | 第92-94页 |
参考文献 | 第94-102页 |
研究生期间发表或待发表论文 | 第102-103页 |
附录 部分英文缩写释义 | 第103-104页 |
致谢 | 第104-105页 |