| 摘要 | 第1-13页 |
| ABSTRACT | 第13-17页 |
| 第一章 绪论 | 第17-24页 |
| §1.1 酶与环境 | 第17-19页 |
| §1.1.1 酶的概述 | 第17页 |
| §1.1.2 酶催化反应机理 | 第17-18页 |
| §1.1.3 酶与环境污染物 | 第18页 |
| §1.1.4 酶与清洁生产 | 第18-19页 |
| §1.2 研究酶催化反应的实验与理论手段 | 第19-20页 |
| §1.3 论文课题的选择、研究目的和研究内容 | 第20-24页 |
| §1.3.1 乙酰胆碱酯酶体系 | 第20-21页 |
| §1.3.1.1 乙酰胆碱酯酶与塔崩相互作用体系 | 第20-21页 |
| §1.3.1.2 乙酰胆碱酯酶与甲胺磷相互作用体系 | 第21页 |
| §1.3.2 黄素腺嘌呤二核甘酸依赖性亚硝基合酶体系 | 第21-22页 |
| §1.3.3 联苯间位分裂产物水解酶体系 | 第22页 |
| §1.3.4 谷胱甘肽转移酶体系 | 第22-23页 |
| §1.3.5 氟乙酸盐脱卤素酶体系 | 第23-24页 |
| 第二章 基本理论和计算方法 | 第24-31页 |
| §2.1 量子力学与量子化学方法 | 第24-26页 |
| §2.1.1 Born-Oppenhemer近似 | 第24-25页 |
| §2.1.2 量子化学方法 | 第25-26页 |
| §2.2 分子力学与分子动力学方法 | 第26-28页 |
| §2.3 量子力学分子力学联用方法 | 第28-31页 |
| 第三章 有机磷化合物与乙酰胆碱酯酶的相互作用机理 | 第31-51页 |
| §3.1 塔崩抑制的乙酰胆碱酯酶的老化与肟类解毒剂的活化机理 | 第32-40页 |
| §3.1.1 前言 | 第32页 |
| §3.1.2. 计算方法 | 第32-35页 |
| §3.1.2.1 晶体结构的预处理与分子动力学方法 | 第32-33页 |
| §3.1.2.2 QM/MM计算方法 | 第33-35页 |
| §3.1.3 结果与讨论 | 第35-39页 |
| §3.1.3.1 一分子水参与的老化反应 | 第35-36页 |
| §3.1.3.2 肟类解毒剂诱导的活化反应 | 第36-38页 |
| §3.1.3.3 比较老化反应与肟类解毒剂诱导的活化反应 | 第38-39页 |
| §3.1.4 本节小结 | 第39-40页 |
| §3.2 甲胺磷抑制的乙酰胆碱酯酶的自发活化机理 | 第40-50页 |
| §3.2.1 前言 | 第40页 |
| §3.2.2 计算方法 | 第40-42页 |
| §3.2.3 结果与讨论 | 第42-49页 |
| §3.2.3.1 (-)-甲胺磷抑制的乙酰胆碱酯酶的自发活化机理 | 第42-44页 |
| §3.2.3.2 (+)-甲胺磷抑制的乙酰胆碱酯酶的自发活化机理 | 第44-47页 |
| §3.2.3.3 自发活化反应过程中关键氨基酸的运动 | 第47-48页 |
| §3.2.3.4 自发活化反应的能垒 | 第48-49页 |
| §3.2.4 本节小结 | 第49-50页 |
| §3.3 本章小结 | 第50-51页 |
| 第四章 黄素腺嘌呤二核甘酸依赖性亚硝基合酶的催化机理 | 第51-60页 |
| §4.1 前言 | 第51-52页 |
| §4.2 计算方法 | 第52-55页 |
| §4.3 结果与讨论 | 第55-59页 |
| §4.3.1 催化反应过程及势能剖面 | 第55-58页 |
| §4.3.2 活性中心部位重要氨基酸的静电影响 | 第58-59页 |
| §4.4 本章小结 | 第59-60页 |
| 第五章 联苯间位分裂产物水解酶的催化反应机理研究 | 第60-71页 |
| §5.1 前言 | 第60-61页 |
| §5.2 计算方法 | 第61-62页 |
| §5.3 结果与讨论 | 第62-70页 |
| §5.3.1 底物协助的亲核反应进攻机理不适用于野生酶BphD | 第62-63页 |
| §5.3.2 确定野生型BphD的酰化机理 | 第63-66页 |
| §5.3.3 野生型BphD的脱酰化反应机理 | 第66-67页 |
| §5.3.4 野生型BphD的酰化、脱酰化反应路径 | 第67-70页 |
| §5.4 本章小结 | 第70-71页 |
| 第六章 蚊虫体内谷胱甘肽转移酶催化滴滴涕的机理研究 | 第71-85页 |
| §6.1. 前言 | 第71-72页 |
| §6.2 计算方法 | 第72-73页 |
| §6.3 结果与讨论 | 第73-84页 |
| §6.3.1 反应机理 | 第74-79页 |
| §6.3.2 质子转移机理的具体反应过程 | 第79-81页 |
| §6.3.3 氢键网络和氨基酸的影响 | 第81-83页 |
| §6.3.4 构效关系以及酶AgGSTe2、AgGSTl-6催化能力对比 | 第83-84页 |
| §6.4 本章小结 | 第84-85页 |
| 第七章 氟乙酸盐脱卤素酶催化反应机理 | 第85-91页 |
| §7.1 前言 | 第85-86页 |
| §7.2 计算方法 | 第86-87页 |
| §7.3 结果与讨论 | 第87-90页 |
| §7.3.1 体系Hsd-S与Hse-S | 第87-89页 |
| §7.3.2 体系Hsd-B与Hse-B | 第89页 |
| §7.3.3 构建大小体系反应能垒之间的关系 | 第89-90页 |
| §7.4 本章小结 | 第90-91页 |
| 第八章 创新之处和工作展望 | 第91-92页 |
| §8.1 创新之处 | 第91页 |
| §8.2 工作展望 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-107页 |
| 致谢 | 第107-108页 |
| 发表论文 | 第108-110页 |
| 附件 | 第110-142页 |
| 学位论文评阋及答辩情况表 | 第142页 |
