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嗜热蛋白复合物热稳定性与其表达水平关系的研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-8页
缩略词表第8-9页
1 前言第9-18页
   ·蛋白复合物的研究进展第9-12页
     ·蛋白相互作用第9-10页
     ·蛋白复合物的分类第10-11页
     ·蛋白复合物的界面结构第11-12页
   ·嗜热蛋白热稳定性的研究进展第12-13页
     ·嗜热生物概述第12-13页
     ·嗜热蛋白的结构特点第13页
   ·蛋白复合物的模拟与计算第13-15页
     ·lattice模型简介第13-15页
     ·氨基酸作用势的计算第15页
   ·基因表达水平第15-17页
     ·基因表达水平的实验测量第15-16页
     ·基因表达水平的理论预测第16-17页
   ·研究的内容及目的第17-18页
2 材料与方法第18-28页
   ·实验数据和生物信息学工具第18-20页
     ·数据库及生物信息学工具第18-19页
     ·实验数据的筛选第19-20页
   ·计算蛋白复合物界面属性第20-22页
     ·相互作用界面的氨基酸接触对数第20-21页
     ·相互作用界面的接触面积第21页
     ·相互作用界面的结合能第21-22页
     ·相互作用界面的化学性质第22页
   ·获取蛋白对应的基因序列第22页
   ·分析基因的表达水平第22-23页
     ·基因转录组收据收集第22-23页
     ·蛋白表达量的预测第23页
   ·计算机模拟进化分析第23-28页
     ·确定蛋白构象第23-24页
     ·确定相互作用的蛋白配对第24页
     ·设定蛋白表达量第24-25页
     ·适应度的计算第25-26页
     ·模拟进化过程第26-28页
3 结果与分析第28-39页
   ·数据总体的分布情况第28页
   ·蛋白表达量与相互作用界面的大小的分析第28-30页
   ·蛋白表达量与相互作用界面结合能的分析第30-33页
   ·蛋白表达量与界面化学性质的分析第33-34页
   ·在不同温度下模拟进化的结果分析第34-39页
     ·不同温度下模拟进化时细胞适应度的变化第34-36页
     ·高温度压力胁迫下蛋白进化分析第36-37页
     ·常温下蛋白进化分析第37-39页
4 讨论第39-43页
   ·不同最适温度下基因表达水平对复合物界面性质的影响第39-41页
   ·温度对界面稳定性进化速率的影响第41页
   ·不同最适温度物种的蛋白进化策略第41-43页
参考文献第43-50页
附录第50-52页
硕士期间发表论文情况第52-53页
致谢第53页

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