摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
缩略词表 | 第8-9页 |
1 前言 | 第9-18页 |
·蛋白复合物的研究进展 | 第9-12页 |
·蛋白相互作用 | 第9-10页 |
·蛋白复合物的分类 | 第10-11页 |
·蛋白复合物的界面结构 | 第11-12页 |
·嗜热蛋白热稳定性的研究进展 | 第12-13页 |
·嗜热生物概述 | 第12-13页 |
·嗜热蛋白的结构特点 | 第13页 |
·蛋白复合物的模拟与计算 | 第13-15页 |
·lattice模型简介 | 第13-15页 |
·氨基酸作用势的计算 | 第15页 |
·基因表达水平 | 第15-17页 |
·基因表达水平的实验测量 | 第15-16页 |
·基因表达水平的理论预测 | 第16-17页 |
·研究的内容及目的 | 第17-18页 |
2 材料与方法 | 第18-28页 |
·实验数据和生物信息学工具 | 第18-20页 |
·数据库及生物信息学工具 | 第18-19页 |
·实验数据的筛选 | 第19-20页 |
·计算蛋白复合物界面属性 | 第20-22页 |
·相互作用界面的氨基酸接触对数 | 第20-21页 |
·相互作用界面的接触面积 | 第21页 |
·相互作用界面的结合能 | 第21-22页 |
·相互作用界面的化学性质 | 第22页 |
·获取蛋白对应的基因序列 | 第22页 |
·分析基因的表达水平 | 第22-23页 |
·基因转录组收据收集 | 第22-23页 |
·蛋白表达量的预测 | 第23页 |
·计算机模拟进化分析 | 第23-28页 |
·确定蛋白构象 | 第23-24页 |
·确定相互作用的蛋白配对 | 第24页 |
·设定蛋白表达量 | 第24-25页 |
·适应度的计算 | 第25-26页 |
·模拟进化过程 | 第26-28页 |
3 结果与分析 | 第28-39页 |
·数据总体的分布情况 | 第28页 |
·蛋白表达量与相互作用界面的大小的分析 | 第28-30页 |
·蛋白表达量与相互作用界面结合能的分析 | 第30-33页 |
·蛋白表达量与界面化学性质的分析 | 第33-34页 |
·在不同温度下模拟进化的结果分析 | 第34-39页 |
·不同温度下模拟进化时细胞适应度的变化 | 第34-36页 |
·高温度压力胁迫下蛋白进化分析 | 第36-37页 |
·常温下蛋白进化分析 | 第37-39页 |
4 讨论 | 第39-43页 |
·不同最适温度下基因表达水平对复合物界面性质的影响 | 第39-41页 |
·温度对界面稳定性进化速率的影响 | 第41页 |
·不同最适温度物种的蛋白进化策略 | 第41-43页 |
参考文献 | 第43-50页 |
附录 | 第50-52页 |
硕士期间发表论文情况 | 第52-53页 |
致谢 | 第53页 |