摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-9页 |
目录 | 第9-12页 |
第1篇 酵母转录因子Cdc73的结构与功能研究 | 第12-72页 |
第一章 综述:Paf1复合物在转录中的作用 | 第12-28页 |
·转录概述 | 第12-15页 |
·Paf1复合物的发现过程 | 第15-16页 |
·Paf1复合物在转录中的作用 | 第16-17页 |
·Paf1复合物在组蛋白修饰中的作用 | 第17-20页 |
·Paf1C参与RNA 3’-端的形成 | 第20-22页 |
·Paf1C与干细胞的发育 | 第22页 |
·Paf1C与一些肿瘤的发生 | 第22-24页 |
·RNAPII CTD的磷酸化状态与Paf1C的招募 | 第24-28页 |
第二章 实验结果和讨论 | 第28-57页 |
·酵母Paf1C各亚基质粒的构建,表达和纯化 | 第28-31页 |
·酵母Cdc73ΔN235的结晶 | 第31-32页 |
·X射线数据的收集与数据处理 | 第32-34页 |
·晶体数据相位确定和结构模型优 | 第34-35页 |
·晶体结构模型的质量检验 | 第35-38页 |
·Cdc73ΔN235结构模型的电子云密度吻合情况 | 第35页 |
·Cdc73ΔN235结构模型的温度因子分布情况 | 第35-37页 |
·Cdc73ΔN235结构模型立体化学相关参数分析 | 第37-38页 |
·Cdc73ΔN235蛋白结构的空间构象 | 第38-39页 |
·Cdc73ΔN235类似结构的搜索 | 第39-40页 |
·Cdc73ΔN235与GTPase的结构比对分析 | 第40-43页 |
·Cdc73ΔN235是否是一个GTPase | 第43-44页 |
·同源建模人源Cdc73 C端结构 | 第44-48页 |
·Cdc73与RNAPII pCTD和Spt5 pCTR的结合检测 | 第48-56页 |
·本章小节 | 第56-57页 |
第三章 实验材料、设备、实验方法以及实验补充数据 | 第57-72页 |
·实验材料与设备 | 第57-58页 |
·菌株、质粒、培养基和实验试剂 | 第57-58页 |
·仪器设备 | 第58页 |
·实验方法和实验补充数据 | 第58-63页 |
·Cdc73的基因克隆与质粒构建 | 第58-60页 |
·重组Cdc73各片段蛋白的表达、纯化 | 第60-61页 |
·蛋白质浓度的测定 | 第61页 |
·GTP酶活测定 | 第61-62页 |
·等温量热滴定法(ITC)测定蛋白质与GTP的结合 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-72页 |
第2篇 人源Sws1-Swsap1复合物的表达和纯化 | 第72-102页 |
第1章 综述:DNA损伤修复概述 | 第72-90页 |
·DNA的损伤因素 | 第72-73页 |
·DNA损伤反应的监测和应答(DNA Damage Response,DDR) | 第73-75页 |
·DNA损伤修复方式 | 第75-82页 |
·错配修复(Mismatch repair,MMR) | 第75-77页 |
·碱基切除修复(Base excision repair,BER) | 第77-78页 |
·核苷酸切除修复(Nucleotide excision repair,NER) | 第78-80页 |
·DNA双链断裂修复(DNA double-strand breaks,DSBs) | 第80-82页 |
·Rad51和Srs2在HR中的作用 | 第82-85页 |
·DNA损伤容限(DNA damage tolerance,DDT) | 第85-90页 |
·TLS途径 | 第86页 |
·Error-free PRR | 第86-87页 |
·PCNA的不同修饰方式调控DDT | 第87-88页 |
·Shu复合物的作用 | 第88-90页 |
第2章 实验结果与讨论 | 第90-102页 |
·人源Sws1和Swsap1质粒的构建 | 第90-91页 |
·人源Sws1-Swsap1复合物的表达纯化 | 第91-96页 |
·Sws1-Swsap1复合物晶体的筛选 | 第96-98页 |
·后续的工作计划和希望解决的问题 | 第98-101页 |
·本章小结和展望 | 第101-102页 |
参考文献 | 第102-114页 |
附录 | 第114-116页 |
致谢 | 第116-117页 |
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果 | 第117页 |