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酵母转录因子Cdc73的结构生物学研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
目录第9-12页
第1篇 酵母转录因子Cdc73的结构与功能研究第12-72页
 第一章 综述:Paf1复合物在转录中的作用第12-28页
     ·转录概述第12-15页
     ·Paf1复合物的发现过程第15-16页
     ·Paf1复合物在转录中的作用第16-17页
     ·Paf1复合物在组蛋白修饰中的作用第17-20页
     ·Paf1C参与RNA 3’-端的形成第20-22页
     ·Paf1C与干细胞的发育第22页
     ·Paf1C与一些肿瘤的发生第22-24页
     ·RNAPII CTD的磷酸化状态与Paf1C的招募第24-28页
 第二章 实验结果和讨论第28-57页
     ·酵母Paf1C各亚基质粒的构建,表达和纯化第28-31页
     ·酵母Cdc73ΔN235的结晶第31-32页
     ·X射线数据的收集与数据处理第32-34页
     ·晶体数据相位确定和结构模型优第34-35页
     ·晶体结构模型的质量检验第35-38页
       ·Cdc73ΔN235结构模型的电子云密度吻合情况第35页
       ·Cdc73ΔN235结构模型的温度因子分布情况第35-37页
       ·Cdc73ΔN235结构模型立体化学相关参数分析第37-38页
     ·Cdc73ΔN235蛋白结构的空间构象第38-39页
     ·Cdc73ΔN235类似结构的搜索第39-40页
     ·Cdc73ΔN235与GTPase的结构比对分析第40-43页
     ·Cdc73ΔN235是否是一个GTPase第43-44页
     ·同源建模人源Cdc73 C端结构第44-48页
     ·Cdc73与RNAPII pCTD和Spt5 pCTR的结合检测第48-56页
     ·本章小节第56-57页
 第三章 实验材料、设备、实验方法以及实验补充数据第57-72页
     ·实验材料与设备第57-58页
       ·菌株、质粒、培养基和实验试剂第57-58页
       ·仪器设备第58页
     ·实验方法和实验补充数据第58-63页
       ·Cdc73的基因克隆与质粒构建第58-60页
       ·重组Cdc73各片段蛋白的表达、纯化第60-61页
       ·蛋白质浓度的测定第61页
       ·GTP酶活测定第61-62页
       ·等温量热滴定法(ITC)测定蛋白质与GTP的结合第62-63页
  参考文献第63-72页
第2篇 人源Sws1-Swsap1复合物的表达和纯化第72-102页
 第1章 综述:DNA损伤修复概述第72-90页
     ·DNA的损伤因素第72-73页
     ·DNA损伤反应的监测和应答(DNA Damage Response,DDR)第73-75页
     ·DNA损伤修复方式第75-82页
       ·错配修复(Mismatch repair,MMR)第75-77页
       ·碱基切除修复(Base excision repair,BER)第77-78页
       ·核苷酸切除修复(Nucleotide excision repair,NER)第78-80页
       ·DNA双链断裂修复(DNA double-strand breaks,DSBs)第80-82页
     ·Rad51和Srs2在HR中的作用第82-85页
     ·DNA损伤容限(DNA damage tolerance,DDT)第85-90页
       ·TLS途径第86页
       ·Error-free PRR第86-87页
       ·PCNA的不同修饰方式调控DDT第87-88页
       ·Shu复合物的作用第88-90页
 第2章 实验结果与讨论第90-102页
     ·人源Sws1和Swsap1质粒的构建第90-91页
     ·人源Sws1-Swsap1复合物的表达纯化第91-96页
     ·Sws1-Swsap1复合物晶体的筛选第96-98页
     ·后续的工作计划和希望解决的问题第98-101页
     ·本章小结和展望第101-102页
参考文献第102-114页
附录第114-116页
致谢第116-117页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第117页

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