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太湖地区水稻地方品种品质基因多样性及部分淀粉品质性状与SSR标记的关联研究

中文摘要第1-6页
ABSTRACT第6-8页
1 前言第8-18页
   ·遗传多样性概述第8-11页
     ·遗传多样性研究常用的遗传标记第8-10页
     ·SSR标记在水稻遗传多样性研究中的应用第10-11页
   ·太湖地区水稻资源遗传多样性研究概况第11-12页
     ·太湖地区水稻品种的表型多样性研究第11-12页
     ·太湖地区水稻品种在DNA分子水平的多样性研究第12页
   ·水稻淀粉合成过程中的关键酶第12-15页
     ·ADP-葡萄糖焦磷酸化酶第13-14页
     ·颗粒结合淀粉合成酶第14页
     ·可溶性淀粉合成酶第14页
     ·淀粉分支酶第14-15页
     ·淀粉去分支酶第15页
   ·关联分析第15-18页
     ·关联分析的基础第15-16页
     ·关联分析的基本策略第16-17页
     ·关联分析在水稻研究中的应用第17-18页
2 研究目的和意义第18-19页
3 材料与方法第19-25页
   ·供试材料第19页
   ·分子标记的选择第19页
   ·分子标记的检测第19-22页
     ·水稻叶片总DNA的提取第19-21页
     ·PCR扩增及酶切第21-22页
     ·电泳与读数第22页
   ·淀粉品质性状的测定第22-23页
     ·糊化温度(gelatinization temperature,GT)的测定第22-23页
     ·胶稠度(gel consistency,GC)的测定第23页
   ·数据分析第23-25页
     ·遗传多样性分析第23-24页
     ·群体结构分析第24页
     ·关联分析第24页
     ·淀粉品质性状分析第24-25页
4 结果与分析第25-40页
   ·与淀粉合成相关基因的多样性研究第25-33页
     ·与淀粉合成相关基因的多样性分析第25-27页
     ·基于遗传距离的聚类分析第27页
     ·基于淀粉合成相关基因的基因型分类第27-32页
     ·基于淀粉品质性状的基因型分类第32-33页
     ·不同基因型间淀粉品质性状的差异分析第33页
   ·淀粉品质性状与SSR标记的关联分析第33-40页
     ·SSR多态性分析第33-35页
     ·群体结构分析第35-37页
     ·连锁不平衡分析第37-39页
     ·淀粉品质性状与SSR标记的关联分析第39-40页
5 小结与讨论第40-43页
   ·与淀粉合成相关基因内部分子标记的选择第40页
   ·与淀粉合成相关基因的多样性分析第40-41页
   ·SSR多态性分析第41页
   ·群体结构及LD分析第41-42页
   ·淀粉品质性状与SSR标记的关联分析第42-43页
参考文献第43-48页
附录1 材料名称及来源第48-54页
附录2 等位基因编码表第54-55页
附录3 各基因型所对应的地方品种名称第55-58页
致谢第58-59页

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