| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-25页 |
| ·水稻土与Fe(Ⅲ)还原 | 第11-12页 |
| ·异化 Fe( Ⅲ )还原微生物及其多样性 | 第12-14页 |
| ·异化Fe(Ⅲ)还原 | 第12-13页 |
| ·异化Fe(Ⅲ)还原菌多样性 | 第13-14页 |
| ·异化Fe(Ⅲ)还原菌生理学多样性 | 第14-18页 |
| ·电子受体 | 第15-17页 |
| ·电子供体和氢气 | 第17-18页 |
| ·微生物群落结构的分子生物学技术 | 第18-22页 |
| ·限制性片段长度多态性分析 | 第19-20页 |
| ·末端标记限制性片段长度多态性分析 | 第20页 |
| ·变性梯度凝胶电泳 | 第20-21页 |
| ·单链构象多态性分析 | 第21页 |
| ·实时定量PCR | 第21-22页 |
| ·16S rDNA 在地杆菌科群落分析中的应用 | 第22页 |
| ·地杆菌科的研究进展 | 第22-23页 |
| ·研究的目的意义、主要内容与技术路线 | 第23-25页 |
| ·研究的目的意义 | 第23页 |
| ·研究内容 | 第23-24页 |
| ·技术路线 | 第24-25页 |
| 第二章 材料与方法 | 第25-32页 |
| ·材料 | 第25-27页 |
| ·供试土壤 | 第25页 |
| ·试剂 | 第25-26页 |
| ·主要仪器设备 | 第26页 |
| ·引物和菌种 | 第26页 |
| ·主要应用软件 | 第26-27页 |
| ·试验方法 | 第27-32页 |
| ·供试土样的采集 | 第27页 |
| ·厌氧恒温培养及土样中Fe(Ⅲ)还原量测定 | 第27页 |
| ·上游引物设计 | 第27-28页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第28页 |
| ·土壤中总DNA 的提取 | 第28页 |
| ·总DNA 的纯化 | 第28页 |
| ·地杆菌科16S rDNA 片段的PCR 扩增与纯化 | 第28-29页 |
| ·地杆菌科16S rDNA 克隆文库的构建 | 第29页 |
| ·地杆菌科16S rDNA 的RFLP 分型 | 第29-30页 |
| ·地杆菌科16S rDNA 系统发育分析 | 第30页 |
| ·实时定量PCR | 第30页 |
| ·多样性指数计算 | 第30-32页 |
| 第三章 结果与分析 | 第32-47页 |
| ·淹水过程中Fe(Ⅱ)的动态变化 | 第32-33页 |
| ·土壤中总DNA 的提取 | 第33页 |
| ·地杆菌科16S rDNA 的PCR 扩增 | 第33-34页 |
| ·地杆菌科16S rDNA 克隆文库中菌落PCR | 第34页 |
| ·16S rDNA 克隆文库酶切聚类分析 | 第34-36页 |
| ·RFLP 类型统计 | 第36-38页 |
| ·地杆菌科16S rDNA 克隆文库多样性分析 | 第38-40页 |
| ·优势菌类型的演替变化 | 第40-42页 |
| ·淹水条件下水稻土中优势地杆菌科的系统发育树 | 第42-44页 |
| ·水稻土中地杆菌科及细菌丰度的动态变化 | 第44-45页 |
| ·本章小结 | 第45-47页 |
| 第四章 讨论 | 第47-50页 |
| ·淹水培养时间与土壤中地杆菌科多样性的关系 | 第47-48页 |
| ·淹水培养时间与土壤中地杆菌科优势类型演替的关系 | 第48页 |
| ·土壤中地杆菌科丰度变化与Fe(Ⅲ)还原能力的关系 | 第48-49页 |
| ·上游引物的特异性 | 第49-50页 |
| 第五章 结论和展望 | 第50-52页 |
| ·结论 | 第50页 |
| ·展望 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 附录 | 第58-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |