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棉花生殖发育相关基因簇的结构和功能分析

摘要第1-8页
Abstract第8-17页
第一章 前言第17-33页
   ·研究目的和意义第17页
   ·国内外研究现状第17-32页
     ·棉花生殖发育的分子生物学研究第18-24页
     ·肌醇半乳糖苷合酶的研究第24-26页
     ·网格蛋白关联接头蛋白(Clarthrin-associated adaptor protein,AP)复合体的研究第26-28页
     ·PsbP 基因的研究第28-30页
     ·β呋喃果糖苷酶的研究第30-32页
   ·本研究的研究内容和策略第32-33页
第二章 包含arf1和nodulin-like BAC克隆的筛选和全序列测序第33-45页
   ·材料第33-35页
     ·BAC 文库第33页
     ·试剂第33页
     ·菌株第33页
     ·载体及其特征第33-34页
     ·PCR 扩增引物第34-35页
   ·方法第35-41页
     ·PCR 池筛法筛选BAC 文库的基本原理第35-36页
     ·LB 培养基第36页
     ·BAC 文库混合池的构建第36页
     ·质粒DNA 的小量提取第36-37页
     ·棉花基因组DNA 的提取第37-38页
     ·PCR 反应第38-39页
     ·目的DNA 片段的电泳回收第39页
     ·连接第39-40页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第40页
     ·质粒DNA 转化大肠杆菌第40页
     ·BAC 阳性克隆插入片段大小的鉴定第40-41页
     ·BAC 阳性克隆插入片段的全序列测序第41页
   ·结果与分析第41-44页
     ·BAC 文库混合池的构建第41页
     ·包含arf1 和nodulin-like BAC 阳性克隆的筛选第41-42页
     ·G2-J-15 和G128-K-15 BAC 阳性克隆插入片段长度的鉴定第42页
     ·G2-J-15 BAC 阳性克隆插入片段的全序列测序第42-44页
   ·小结第44-45页
第三章 G2-J-15 BAC 克隆插入片段的生物信息学分析第45-70页
   ·方法第45-46页
     ·序列中基因及其结构的预测第45页
     ·序列中各基因的ORF BLAST第45页
     ·各基因编码的氨基酸序列的分析第45页
     ·蛋白质结构及功能预测第45-46页
   ·结果与分析第46-68页
     ·序列中新基因结构、cDNA 及编码蛋白的预测结果第46-53页
     ·各基因编码蛋白的基本性质、序列比对、分析和系统进化树的构建第53-63页
     ·各蛋白序列在TAIR 中的BLAST第63-64页
     ·各蛋白序列的疏水结构及信号肽预测分析第64-66页
     ·蛋白质结构及功能预测结果第66-68页
   ·小结第68-70页
第四章 各基因的时空表达研究第70-82页
   ·材料第70-71页
     ·植物材料第70页
     ·试剂第70页
     ·实时荧光定量PCR(Real-time PCR)扩增引物第70-71页
   ·方法第71-76页
     ·RNA 提取前仪器及耗材的预处理第71页
     ·试剂的准备第71页
     ·提取棉花RNA 的热硼酸方法(吴巧雯,2007)第71-73页
     ·植物RNAout 提取棉花RNA第73-74页
     ·RNA 反转录第74页
     ·反转录PCR第74-75页
     ·Real-time PCR第75-76页
   ·结果与分析第76-81页
     ·热硼酸法提取棉花RNA第76-77页
     ·反转录PCR 及Real-time PCR 熔解曲线分析第77-78页
     ·各基因的时空表达模型第78-81页
   ·小结第81-82页
第五章 GhGolS 和 GhAPm 的 cDNA 克隆第82-90页
   ·材料第82-83页
     ·植物材料第82页
     ·试剂第82页
     ·菌株第82页
     ·载体及其特征第82-83页
     ·相关引物第83页
   ·方法第83-85页
     ·仪器及耗材的预处理(详见4.2.1)第83页
     ·试剂的准备(详见4.2.2)第83页
     ·提取棉花RNA 的热硼酸方法(详见4.2.3)第83页
     ·RNA 反转录(详见4.2.5)第83页
     ·PCR第83-84页
     ·目的DNA 片段的电泳回收(详见2.2.6)第84页
     ·GATEWAY 克隆体系BP 重组反应第84-85页
     ·质粒DNA 转化大肠杆菌(详见2.2.9)第85页
     ·质粒DNA 的小量提取(详见2.2.4)第85页
   ·结果与分析第85-89页
     ·RNA 的提取和反转录第85页
     ·PCR第85页
     ·PCR 产物回收、BP 重组反应、转化、测序和序列拼接第85-89页
   ·小结第89-90页
第六章 相关基因过表达载体、RNAi 载体的构建、转化第90-108页
   ·材料第90-93页
     ·植物材料第90页
     ·试剂第90页
     ·菌株第90页
     ·载体及其特征第90页
     ·PCR 扩增引物第90-93页
   ·方法第93-101页
     ·PCR 扩增第93-95页
     ·PCR 及酶切产物回收第95-96页
     ·质粒DNA 的小量提取(详见2.2.4)第96页
     ·BamH I 和Sac I 双酶切反应第96页
     ·连接(详见2.2.7)第96页
     ·GATEWAY 克隆第96-97页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备(详见2.2.8)第97页
     ·根癌农杆菌LBA4404 感受态的制备第97页
     ·根癌农杆菌LBA4404 的转化第97页
     ·质粒的大量提取第97-99页
     ·花粉管通道法转化棉花第99页
     ·拟南芥的种植第99页
     ·根瘤农杆菌 LB4404 转化拟南芥第99-101页
     ·转基因植株的Kana 筛选第101页
     ·转基因植株的BASTA 筛选第101页
     ·DNA 提取(详见2.2.5)第101页
   ·结果与分析第101-107页
     ·PCR 反应第101-103页
     ·相关载体的构建和鉴定第103-105页
     ·拟南芥和棉花的转化第105-107页
   ·小结第107-108页
第七章 全文结论第108-111页
   ·阳性BAC 克隆的筛选、鉴定、全序列测序和生物信息学分析第108-109页
     ·包含arf1 和nodulin-like 基因阳性BAC 克隆的筛选、鉴定第108页
     ·G2-J-15 BAC 克隆全序列测序及生物信息学分析第108-109页
   ·各基因的时空表达研究第109页
   ·GhGolS 和 GhAPm 的 cDNA 克隆第109页
   ·相关基因过表达载体、RNAi 载体的构建、转化第109页
   ·创新点第109-111页
参考文献第111-125页
致谢第125-126页
作者简历第126页

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