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印度洋深海多环芳烃降解菌的多样性分析及降解菌新种的分类鉴定与降解机理初步研究

摘要第1-14页
Abstract第14-16页
1 前言第16-48页
   ·多环芳烃简介第18-21页
     ·多环芳烃的结构及特性第18页
     ·多环芳烃的来源第18-19页
     ·多环芳烃的毒性及危害第19-20页
     ·多环芳烃在环境中的归宿第20-21页
   ·PAHs降解菌多样性及群落结构分析方法第21-26页
     ·微生物多样性研究的传统方法第21页
     ·微生物多样性研究的现代方法第21-25页
     ·PAHs降解菌群研究第25-26页
   ·细菌的鉴定与分类第26-29页
     ·脂肪酸分析在细菌鉴定中的应用第27-28页
     ·DNA碱基比例(G+C mol%)第28页
     ·DNA-DNA杂交第28-29页
     ·rRNA序列分析第29页
   ·微生物对多环芳烃的降解第29-46页
     ·降解多环芳烃的微生物种类第29-31页
     ·PAHs代谢中的主要酶分类第31-35页
     ·PAHs的好氧代谢途径及相关酶系第35页
     ·PAHs的厌氧代谢途径第35-36页
     ·PAHs的微生物共代谢降解第36-37页
     ·主要多环芳烃的微生物代谢途径第37-46页
   ·本文的研究目的及技术路线第46-48页
     ·本文研究的目的意义第46-47页
     ·技术路线第47-48页
2 材料与方法第48-79页
   ·材料第48-60页
     ·环境样品第48-49页
     ·主要试剂第49-50页
     ·试剂盒第50-51页
     ·工具酶第51页
     ·菌株和质粒第51页
     ·主要仪器第51-52页
     ·寡核苷酸第52-53页
     ·常用溶液和培养基第53-60页
   ·基本方法第60-71页
   ·深海PAHs降解菌的富集、分离和菌群动态变化及优势菌分析第71-74页
     ·PAHs降解菌群的富集第71-72页
     ·PAHs降解菌群不同时期的生长曲线第72页
     ·PAHs降解菌群降解能力的测定第72页
     ·深海PAHs降解菌群中可培养菌的分离第72页
     ·可培养细菌 16S rRNA基因的鉴定与系统发育树的构建第72-73页
     ·可培养细菌PAHs降解能力的测定第73页
     ·PAHs降解菌群结构组成及富集过程动态变化的监测第73-74页
   ·深海PAHs降解细菌新种的分类第74-77页
     ·培养基第74页
     ·菌落形态观察第74页
     ·16S rRNA基因序列PCR扩增与分析第74页
     ·生理生化指标测定第74-75页
     ·PAHs利用范围和降解能力的确定第75-76页
     ·G+C mol%含量的测定第76页
     ·菌株脂肪酸成分的分析第76-77页
     ·DNA-DNA杂交分析第77页
   ·重要降解菌PAHs降解起始双加氧酶的研究第77-78页
     ·起始双加氧酶大亚基基因片段的克隆、比对分析第77页
     ·起始双加氧酶大亚基基因片段两侧翼序列的获得及分析第77-78页
   ·PAHs降解菌代谢途径研究第78-79页
     ·PAHs代谢产物的收集第78页
     ·PAHs代谢产物及代谢途径的分析第78-79页
3 结果与讨论第79-150页
   ·印度洋PAHs降解菌的富集、分离和菌群动态变化及优势菌研究第79-116页
     ·印度洋PAHs降解菌群的富集第79-80页
     ·PAHs降解菌群的生长曲线第80页
     ·PAHs降解菌群的降解能力第80-81页
     ·PAHs降解菌群中可培养细菌种类第81-85页
     ·可培养细菌基于16S rRNA基因的系统发育分析第85-89页
     ·可培养细菌PAHs降解能力第89-90页
     ·PAHs降解菌群结构组成及动态变化分析第90-114页
     ·讨论第114-116页
   ·一株新鞘鞍醇杆菌属深海PAHs降解细菌新种H25~T的研究第116-129页
     ·菌株H25~T的分离第116-117页
     ·菌落形态观察第117-118页
     ·16S rRNA基因序列分析第118-119页
     ·菌株H25~T生理生化特性第119-121页
     ·菌株H25~T对PAHs的利用范围和降解能力第121页
     ·菌株H25~T的G+C mol%含量第121-122页
     ·菌株脂肪酸组成成分的分析第122-124页
     ·DNA-DNA杂交结果第124页
     ·新鞘鞍醇杆菌新种的描述第124-125页
     ·Novosphingobium indicum H25~T的PAHs降解起始双加氧酶的研究第125-127页
     ·讨论第127-129页
   ·一株深海PAHs降解细菌新种PTG4-1~T的研究第129-150页
     ·菌株PTG4-1~T的分离第129页
     ·菌落形态观察第129-130页
     ·16S rRNA基因序列系统发育分析第130-131页
     ·生理生化特性研究第131-134页
     ·PAHs利用范围和降解能力第134-135页
     ·菌株PTG4-1~T中G+C mol%含量第135-136页
     ·菌株脂肪酸组成成分第136-138页
     ·Pseudoruegeria属新种的描述第138页
     ·PAHs降解菌Pseudoruegeria indicum PTG4-1~T降解途径的初步研究第138-147页
     ·讨论第147-150页
结论、创新点与展望第150-153页
 1 结论第150-151页
 2 本论文创新点第151页
 3 展望第151-153页
参考文献第153-163页
附录第163-165页
致谢第165页

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