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猪脂肪沉积候选基因PTP-1B和AQP7的分离和初步研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
资源家系测定性状的英文缩写第12-13页
第一章 文献综述第13-28页
 1 引言第13页
 2 动物脂肪代谢机制第13-19页
   ·脂肪细胞的形成及脂肪合成途径第13-17页
     ·脂肪细胞的分化第13-14页
     ·脂肪细胞分化的分子机制第14页
     ·分化转录因子对脂肪细胞分化的影响第14-15页
     ·其他对脂肪细胞分化可能有影响的基因第15-16页
     ·脂肪合成的分子机制第16-17页
   ·脂肪降解途径第17-18页
   ·脂肪组织的其他功能第18-19页
 3 拟分离基因的研究现状第19-22页
   ·PTP-1B(protein tyrosine phosphatese 1B)第19-21页
   ·AQP7(Aquaporin 7)第21-22页
 4 本研究所使用的分子标记PCR-RFLP方法研究进展第22-24页
   ·RFLP分子标记的介绍第22-24页
     ·PCR-RFLP基本原理及优缺点第22-23页
     ·几种改进的RFLP方法第23-24页
   ·PCR-RFLP在猪育种中的应用及展望第24页
 5 Real-time quantitative PCR第24-26页
   ·实时荧光定量PCR技术原理第25页
   ·两个重要概念第25-26页
   ·应用第26页
 6 研究目的与意义第26-28页
第二章 材料与试验方法第28-58页
 1 试验材料第28-29页
   ·试验动物DNA样品第28页
   ·试验动物组织样品第28页
   ·主要仪器和设备第28页
   ·主要药品及试剂第28-29页
   ·缓冲液和常用试剂的配置第29页
 2 试验方法第29-37页
   ·猪基因组DNA的提取第29-30页
   ·基因组DNA浓度的测定和质量检测第30页
   ·猪脂肪沉积候选基因PTP-1B和AQP7基因cDNA序列的克隆、测序第30-34页
     ·引物设计及合成第30-31页
     ·猪各组织RNA的提取及cDNA第一链的合成第31-32页
       ·总RNA的提取第31页
       ·RNA完整性的检测第31页
       ·cDNA第一链的合成第31-32页
     ·RT-PCR方法扩增cDNA第32页
       ·RT-PCR反应第32页
       ·RT-PCR反应产物的检测第32页
     ·PCR产物回收、可隆、测序和生物信息学分析第32-34页
       ·PCR产物的回收第32-33页
       ·载体连接第33页
       ·感受态细胞的制备(CaC12法制备感受态)第33页
       ·连接产物的转化第33页
       ·阳性克隆子的鉴定及测序第33-34页
     ·生物信息学分析及相应软件第34页
   ·猪脂肪沉积候选基因PTP-1B和AQP7基因组序列的克隆、测序第34-36页
     ·引物设计第34-35页
     ·PCR反应体系及条件第35页
     ·基因多态性扫描和遗传方式分析第35-36页
     ·多态性与性状的关联统计分析第36页
   ·基因的组织表达研究第36-37页
 3 结果与分析第37-53页
   ·猪PTP-1B基因cDNA及部分基因组分离和克隆测序结果第37-41页
     ·猪PTP-1B基因cDNA序列的克隆、测序第37-41页
       ·RT-PCR扩增结果第37页
       ·PTP-1B部分基因组PCR结果第37页
       ·大白、长白和梅山三个猪种基因组PCR产物克隆测序结果第37-38页
       ·PTP-1B基因大白、长白和梅山三个猪种cDNA克隆和测序分析第38-41页
   ·猪AQP7基因部分cDNA及部分基因组分离和克隆测序结果第41-43页
     ·猪AQP7基因部分cDNAPCR扩增结果第41页
     ·AQP7部分基因组PCR扩增结果第41-42页
     ·AQP7基因大白、长白和梅山三个猪种cDNA克隆和测序分析第42页
     ·AQP7基因不同品种猪基因组序列测序结果分析第42-43页
   ·猪PTP-1B和AQP7基因多态性与猪脂肪沉积性状关联分析结果第43-48页
     ·PTP-1B基因多态性与猪脂肪沉积性状关联分析结果第43-46页
       ·PTP-1B基因酶切第43-44页
       ·PCR—RFLP结果及基因型和等位基因频率第44页
       ·猪PTP-1B基因PCR-Eco88I-RFLP基因型与性状的关联分析第44-46页
     ·AQP7基因多态性与猪脂肪沉积性状关联分析结果第46-48页
       ·AQP7基因酶切结果第46-47页
       ·PCR—RFLP结果及基因型和等位基因频率第47-48页
       ·猪AQP7基因PCR-PstI-RFLP基因型与性状的关联分析第48页
   ·SYBR green Real-time PCR结果第48-53页
     ·PTP-1B基因的表达第48页
     ·AQP7基因的表达第48-53页
 4 讨论第53-57页
   ·关于基因的SNPs检测及多态性与性状的关联分析第53-54页
     ·基因SNPs的检测第53页
     ·性状关联分析第53-54页
       ·AQP7基因第4内含子的多态性第53页
       ·PTP-1B基因第7内含子的多态性第53-54页
   ·关于使用降落PCR(touchdown PCR,TD-PCR)扩增目的序列第54-55页
   ·关于Real-time PCR第55-57页
 5 小结第57页
 6 下一步工作第57-58页
参考文献第58-64页
致谢第64页

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