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白菜三种雄性不育系与保持系花蕾转录组差异分析及三个花粉发育相关基因功能鉴定

缩写词第1-20页
摘要第20-24页
Abstract第24-30页
前言第30-34页
1 文献综述:十字花科植物花粉发育的分子生物学研究第34-60页
   ·植物花粉发育概述第34-36页
     ·花粉发育过程第35页
     ·花粉壁发育第35-36页
     ·花药绒毡层与花粉发育第36页
   ·十字花科植物花粉发育相关基因第36-43页
     ·与花粉发育起始相关的基因第36-37页
     ·与减数分裂相关的基因第37-42页
       ·减数分裂前期Ⅰ第38-40页
       ·减数分裂后期第40页
       ·胞质分裂第40页
       ·四分体阶段第40-41页
       ·绒毡层第41-42页
     ·与花粉有丝分裂Ⅰ相关的基因第42-43页
     ·生殖细胞有丝分裂相关基因第43页
   ·十字花科植物授粉过程中花粉表达基因第43-51页
     ·花粉黏附第44-45页
     ·花粉水合第45页
     ·花粉萌发和花粉管生长第45-51页
       ·花粉管生长的引导及控制花粉管生长的信号转导途径第46-50页
       ·影响花粉管萌发与生长的其他突变体第50-51页
   ·十字花科植物花粉表达基因的大规模分析第51-54页
     ·转录组分析鉴定花粉表达基因第51-52页
     ·花粉发育基因动态表达研究第52-53页
     ·花粉发育基因群体分析第53-54页
   ·花粉壁发育相关基因的研究第54-56页
     ·影响花粉外壁发育的基因第54-55页
     ·影响花粉内壁发育的基因第55页
     ·花粉壁中的蛋白质与花粉壁发育第55-56页
   ·多聚半乳糖醛酸酶在花粉发育中的研究第56-60页
     ·多聚半乳糖醛酸酶基因的分类、结构及表达调控第56-58页
     ·多聚半乳糖醛酸酶基因与花粉发育第58-60页
2 白菜ajhGMS两用系花粉败育原因分析与polG-CMS系、oguCMS系创建第60-72页
   ·材料与方法第61-62页
     ·植物材料第61页
     ·植株的形态观察与遗传分析第61页
     ·花蕾的细胞学观察第61-62页
       ·扫描电镜观察第61页
       ·石蜡切片制作第61-62页
       ·透射电镜观察第62页
       ·polG-CMS系和oguCMS系的创建第62页
   ·结果与分析第62-69页
     ·‘Bcajh97-01A’与‘Bcajh97-01B’的差异仅表现在花粉花药发育上第62-63页
     ·‘Bcajh97-01A’花粉败育源自小孢子减数分裂胞质分裂的异常第63-68页
     ·创建获得‘Bcpol97-05A’和‘Bcogu97-06A’第68-69页
   ·讨论第69-72页
     ·‘Bcajh97-01A’为雄性减数分裂的胞质分裂突变体mmc第69页
     ·mmc突变体花粉败育的可能原因和发育模型第69-71页
     ·共享保持系的多种雄性不育系是花粉发育研究的理想材料第71-72页
3 白菜三种雄性不育系及其保持系花蕾转录组差异的cDNA-AFLP分析第72-102页
   ·材料与方法第73-78页
     ·植物材料与主要试剂第73-74页
     ·总RNA的提取、检测与cDNA的合成第74-75页
     ·cDNA-AFLP分析第75-76页
       ·cDNA酶切、连接第75页
       ·模板的预扩增和选择性扩增第75页
       ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第75-76页
       ·银染第76页
     ·差异片段的检测、克隆和测序第76-77页
     ·RT-PCR第77页
     ·探针标记及Northern杂交第77-78页
   ·结果与分析第78-96页
     ·提取的白菜组织总RNA及合成的cDNA质量较高第78页
     ·‘Bcajh97-01A’与‘Bcajh97-01B’花蕾转录组差异的cDNA-AFLP分析第78-80页
     ·‘Bcajh97-01A’与‘Bcajh97-01B’花蕾差异表达基因的功能分类第80-83页
     ·‘Bcpol97-05A’、‘Bcogu97-06A’与‘Bcajh97-01B’花蕾转录组差异的cDNA-AFLP分析第83-84页
     ·‘Bcpol97-05A’、‘Bcogu97-06A’与‘Bcajh97-01B’花蕾差异表达基因的功能分类第84-85页
     ·比较发现三种不同雄性不育系花蕾表达基因不尽相同第85-92页
     ·RT-PCR分析发现差异表达片段具不同的时空表达特性第92-96页
       ·‘Bcajh97-01A’和‘Bcajh97-01B’花蕾差异表达TDFs的时空表达特征分析第92-94页
       ·‘Bcpol97-05A’、‘Bcogu97-06A’与‘Bcajh97-01B’花蕾差异表达TDFs的时空表达特征分析第94-95页
       ·在‘Bcajh97-01B’花蕾中上调表达TDFs的聚类分析第95-96页
   ·讨论第96-102页
     ·转录组分析能够探讨基因突变引起的下游基因的表达变化第96-97页
     ·雄性不育系和保持系花蕾差异表达的片段可能代表花粉花药发育相关基因第97-99页
     ·不同不育基因作用引起不同的花粉败育第99-100页
     ·三种雄性不育系与其共同保持系花蕾差异表达的基因各具不同的表达动态第100-102页
4 白菜三种雄性不育系及其保持系花蕾转录组差异的基因芯片分析第102-120页
   ·材料与方法第103页
     ·植物材料第103页
     ·总RAN的分离及检测第103页
     ·与拟南芥基因芯片ATH1的杂交及数据处理第103页
   ·结果与分析第103-114页
     ·‘Bajh97-01A’与‘Bajh97-01B’花蕾转录组差异的基因芯片分析第103-104页
     ·‘Bcajh97-01A’与‘Bcajh97-01B’花蕾差异表达基因的功能分类第104-105页
     ·‘Bcpol97-05A’与‘Bcajh97-01B’花蕾转录组差异的基因芯片分析第105-106页
     ·‘Bcpol97-05A’与‘Bcajh97-01B’花蕾差异表达基因的功能分类第106-107页
     ·‘Bcogu97-06A’与‘Bcajh97-01B’花蕾转录组差异的基因芯片分析第107页
     ·‘Bcogu97-06A’与‘Bcajh97-01B’花蕾基因表达的功能分类第107-109页
     ·基因芯片分析三种雄性不育系花蕾转录组的异同第109-112页
     ·基因芯片结合cDNA-AFLP技术分析三种雄性不育系与其保持系花蕾转录组差异第112-114页
   ·讨论第114-120页
     ·利用拟南芥ATH1基因芯片分析白菜花蕾转录组是可行的第114-115页
     ·白菜不同雄性不育遗传模式花粉基因表达相似但不尽相同第115-120页
5 细胞壁合成与调控相关基因在花粉发育中的功能分析:多聚半乳糖醛酸酶基因BcMF2第120-142页
   ·材料与方法第121-128页
     ·植物材料与主要试剂第121页
     ·基因时空表达模式分析第121-122页
     ·反义表达载体的构建第122-124页
       ·反义基因片段的分离第122-123页
       ·反义表达载体的构建第123页
       ·pBI35S-BcMF2A及pBIBcA9-BcMF2A质粒直接转化农杆菌第123-124页
     ·反义表达载体对菜心的遗传转化第124-125页
       ·实验材料及菌株第124页
       ·菜心无菌苗的培养第124-125页
       ·菜心的遗传转化第125页
     ·转基因植株的分子检测第125-127页
       ·转基因植株基因组DNA和总RNA的提取第125-126页
       ·转基因植株的PCR检测第126页
       ·转基因植株的Southern和Northern印迹杂交检测第126-127页
     ·转基因植株的形态与细胞学观察第127-128页
       ·转基因植株的形态观察第127页
       ·转基因植株花粉生活力观察第127页
       ·花粉形态扫描电镜和花粉发育透射电镜观察第127页
       ·转基因植株的花粉萌发试验第127页
       ·转基因植株花粉在雌蕊中的生长观察第127-128页
   ·结果与分析第128-138页
     ·BcMF2在不同发育阶段有不同的表达特点第128-129页
     ·BcMF2反义表达载体的构建及对农杆菌的转化第129-130页
       ·反义BcMF2片段的获得第129页
       ·CaMV35S组成型启动子表达载体的成功构建第129页
       ·BcA9启动子组织特异型表达载体的成功构建第129-130页
       ·pBI35S-BcMF2A及pBIBcA9-BcMF2A质粒成功转入农杆菌第130页
     ·获得反义BcMF2表达载体转化菜心植株第130-131页
     ·转基因植株35S-bcmf2和A9-bcmf2的分子检测第131-133页
       ·PCR检测初步证明反义BcMF2表达载体成功转入菜心植株第131-132页
       ·Southern印迹杂交显示反义BcMF2片段整合入受体细胞第132页
       ·Northern印迹杂交表明BcMF2在转基因植株中的表达受到明显抑制第132-133页
     ·转基因植株35S-bcmf2和A9-bcmf2的形态与细胞学观察第133-138页
       ·35S-bcmf2和A9-bcmf2的花药发育异常,花粉不能正常萌发第133-135页
       ·35S-bcmf2和A9-bcmf2的花粉管不能在花柱中生长第135页
       ·35S-bcmf2和A9-bcmf2的花粉畸形,花粉壁发育异常第135-136页
       ·35S-bcmf2和A9-bcmf2花药绒毡层提早降解第136-138页
   ·讨论第138-142页
     ·BcMF2是一个在花粉发育"早期"表达的PG基因第138-139页
     ·BcMF2表达受抑制导致花粉管顶端膨大第139-140页
     ·BcMF2表达受抑制影响花粉壁的发育第140-142页
6 细胞壁合成与调控相关基因在花粉发育中的功能分析:多聚半乳糖醛酸酶基因BcMF9第142-166页
   ·材料与方法第143-146页
     ·植物材料与主要试剂第143页
     ·差异片段cDNA和DNA全氏的分离第143-144页
     ·核苷酸序列分析第144页
     ·基因的时空表达模式分析第144-145页
       ·RT-PCR和Northern杂交分析基因的时空表达第144页
       ·原位杂交分析基因的时空表达第144-145页
     ·反义表达载体的构建第145页
       ·反义基因片段分离第145页
       ·反义表达载体的构建第145页
       ·pBI35S-BcMF9A及pBIBcA9-BcMF9A质粒直接转化农杆菌第145页
     ·反义表达载体对菜心的遗传转化第145-146页
     ·转基因植株的分子检测第146页
     ·转基因植株的形态与细胞学观察第146页
   ·结果与分析第146-160页
     ·获得BcMF9的cDNA和DNA全长序列第146页
     ·序列特征分析表明BcMF9是一个典型的PG基因第146-150页
     ·BcMF9在发育中的绒毡层和小孢子中表达第150-152页
     ·BcMF9反义表达载体的成功构建及对农杆菌的转化第152-153页
       ·反义BcMF9片段的获得第152页
       ·CaMV35S组成型启动子的表达载体的成功构建第152页
       ·BcA9启动子组织特异型表达载体的成功构建第152-153页
       ·pBI35S-BcMF2A及pBIBcA9-BcMF2A质粒成功转化农杆菌第153页
     ·获得BcMF9反义表达载体转化菜心植株第153页
     ·转基因植株35S-bcmf9和A9-bcmf9的分子检测第153-155页
       ·PCR检测初步表明BcMF9反义表达载体成功导入菜心植株第153-154页
       ·Southern印迹杂交表明反义BcMF9片段整合入受体细胞第154页
       ·Northern印迹杂交显示BcMF9在转基因植株中的表达受到明显抑制第154-155页
     ·转基因植株35S-bcmf9和A9-bcmf9的形态与细胞学观察第155-160页
       ·35S-bcmf9和A9-bcmf9自交结实率下降第155-156页
       ·35S-bcmf9和A9-bcmf9花粉萌发时花粉管爆裂第156-157页
       ·35S-bcmf9和A9-bcmf9的花粉管未穿过花柱生长第157-158页
       ·35S-bcmf9和A9-bcmf9花粉畸形第158-159页
       ·35S-bcmf9和A9-bcmf9花粉壁发育异常,绒毡层降解过程加快第159-160页
   ·讨论第160-166页
     ·BcMF9是一个典型的PG基因第160-161页
     ·BcMF9作用于花粉发育晚期第161页
     ·BcMF9表达受抑制导致花粉管不能正常生长第161-162页
     ·BcMF9与花粉壁的发育相关第162-163页
     ·BcMF9可能通过作用于绒毡层PCD而调控花粉壁发育第163页
     ·BcMF9可能从绒毡层分泌而来直接作用于花粉壁发育第163-166页
7 三个与花粉发育相关的多聚半乳糖醛酸酶基因的结构、表达及功能比较第166-188页
   ·材料与方法第166-168页
     ·试验材料第166-167页
     ·基因时空表达模式分析第167页
     ·同源基因的克隆和测序第167-168页
     ·基因序列分析第168页
     ·分子进化树构建第168页
   ·结果与分析第168-185页
     ·BcMF2、BcMF6和BcMF9是不同的PG基因第168-170页
     ·BcMF2、BcMF6和BcMF9具有不同的时空表达特点第170页
     ·BcMF2、BcMF6和BcMF9在十字花科植物中的进化第170-185页
       ·克隆获得十字花科植物BcMF2、BcM-F6和BcMF9的同源基因第170-171页
       ·BcMF2、BcMF6和BcMF9同源基因的序列差异在一定程度上体现了十字花科植物物种亲缘关系的远近第171-182页
       ·BcMF2、BcMF6和BcMF9的分子进化与十字花科植物的物种进化第182-185页
   ·讨论第185-188页
     ·BcMF2、BcMF6和BcMF9可能在花粉发育中扮演不同的角色第185-188页
8 新基因BcMF10在花粉发育中的功能分析第188-206页
   ·材料与方法第188-191页
     ·植物材料与主要试剂第188页
     ·差异片段cDNA和DNA全长的分离第188-189页
     ·核苷酸序列分析第189页
     ·基因时空表达模式分析第189页
     ·RNAi表达载体的构建第189-190页
       ·正义及反义片段的分离第189页
       ·BcA9启动子组织特异型表达载体的构建第189-190页
     ·RNAi表达载体对菜心的遗传转化第190页
     ·转基因植株的X-Gluc组织化学染色检测第190页
     ·转基因植株的分子检测第190页
     ·转基因植株的形态与细胞学观察第190-191页
   ·结果与分析第191-203页
     ·分离获得BcMF10的cDNA和DNA全长第191页
     ·BcMF10为具3个内含子和4个外显子的功能未知新基因第191-194页
     ·BcMF10是一个在花粉和绒毡层表达的基因第194-196页
     ·构建获得BcMF10干涉基因表达载体并导入农杆菌第196-197页
       ·获得正义和反义BcMF10基因片段第196-197页
       ·构建获得BcA9启动子组织特异型RNAi表达载体第197页
       ·pBIBcA9-BcMF10i质粒直接转化农杆菌第197页
     ·获得BcMF10 RNAi表达载体转化菜心植株第197页
     ·GUS活性仅在转基因植株的花药中检测到第197-199页
     ·转基因植株A9-bcmf10的分子检测第199-200页
       ·PCR检测初步证明BcMF10干涉基因成功导入菜心植株第199页
       ·Southern印迹杂交进一步证明BcMF10干涉基因整合入受体细胞第199-200页
       ·Northern印迹杂交表明在转基因植株花蕾和花中BcMF10的表达受到明显抑制第200页
     ·转基因植株A9-bcmf10的形态与细胞学观察第200-203页
       ·A9-bcmf10的花粉体外萌发率降低,花粉管顶端爆裂第200-201页
       ·A9-bcmf10的花粉畸形第201-203页
   ·讨论第203-206页
     ·BcMF10可能与信号转导途径相关第203页
     ·BcMF10在‘Bcajh97-01B’和‘Bcpol97-05A’中具不同表达模式第203-204页
     ·BcMF10在花粉发育早期表达第204页
     ·BcMF10表达受抑制导致花粉萌发异常第204-206页
结论第206-212页
参考文献第212-234页
博士在读期间发表的论文第234页

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