| 第一部分 前言 | 第1-30页 |
| 1 线粒体基因组研究进展 | 第10-17页 |
| ·线粒体及线粒体基因组的发现 | 第10页 |
| ·线粒体的形态及分布 | 第10-11页 |
| ·线粒体基因组测序进展 | 第11-12页 |
| ·动物线粒体基因组的特点 | 第12-15页 |
| ·结构特点 | 第12页 |
| ·线粒体基因组碱基不对称性 | 第12-13页 |
| ·线粒体基因组大小异质性 | 第13页 |
| ·线粒体基因组组分多样性 | 第13页 |
| ·线粒体基因组基因排序多样性 | 第13-15页 |
| ·线粒体基因组基因进化速率异质性 | 第15页 |
| ·线粒体基因组的起源及进化 | 第15-17页 |
| ·线粒体基因组的起源 | 第15-16页 |
| ·线粒体基因组的进化 | 第16-17页 |
| ·线粒体基因组的遗传 | 第17页 |
| 2 节肢动物线粒体基因组研究进展 | 第17-27页 |
| ·已测出全线粒体基因组的节肢动物 | 第17-18页 |
| ·节肢动物线粒体基因组结构 | 第18页 |
| ·节肢动物线粒体基因组组成 | 第18-20页 |
| ·节肢动物线粒体基因组排序 | 第20-27页 |
| ·甲壳动物线粒体基因组重排 | 第21-23页 |
| ·六足动物线粒体基因组重排 | 第23-25页 |
| ·螯肢动物线粒体基因组重排 | 第25-26页 |
| ·多足动物线粒体基因组重排 | 第26-27页 |
| 3 直翅目昆虫的线粒体基因组研究进展 | 第27-28页 |
| 4 课题来源及意义 | 第28-30页 |
| 第二部分 材料与方法 | 第30-44页 |
| 1 实验材料 | 第30-32页 |
| ·标本的选择 | 第30页 |
| ·实验仪器与试剂 | 第30-32页 |
| ·实验仪器 | 第30-31页 |
| ·实验试剂 | 第31-32页 |
| 2 实验方法 | 第32-44页 |
| ·取材及总DNA的提取 | 第33-34页 |
| ·总DNA提取试剂的配置 | 第34页 |
| ·提取步骤 | 第34页 |
| ·总DNA检测 | 第34页 |
| ·长PCR引物设计及长PCR扩增 | 第34-37页 |
| ·长PCR引物设计 | 第34-35页 |
| ·长PCR扩增步骤 | 第35-37页 |
| ·长 PCR产物检测及目的片段的回收纯化 | 第37页 |
| ·Sub-PCR引物设计及 Sub-PCR扩增 | 第37-40页 |
| ·Sub-PCR引物设计 | 第37-38页 |
| ·Sub-PCR扩增步骤 | 第38页 |
| ·Sub-PCR产物检测及目的片段的回收纯化 | 第38-40页 |
| ·PCR产物直接测序 | 第40页 |
| ·PCR产物克隆测序 | 第40-43页 |
| ·清洗器皿并灭菌 | 第40-41页 |
| ·克隆溶液的配置及所用试剂 | 第41页 |
| ·克隆步骤 | 第41-43页 |
| ·质粒测序 | 第43页 |
| ·序列拼接与注释 | 第43-44页 |
| 第三部分 实验结果与分析 | 第44-47页 |
| 1 总DNA抽提 | 第44页 |
| 2 长PCR | 第44-45页 |
| 3 Sub-PCR | 第45页 |
| 4 Sub-PCR产物克隆 | 第45-46页 |
| 5 直接测序和克隆测序 | 第46页 |
| 6 序列拼接组装 | 第46-47页 |
| 第四部分 笨蝗线粒体基因组注释结果与讨论 | 第47-64页 |
| 1 笨蝗全线粒体基因组结构及组成特点 | 第47-56页 |
| ·结构特点 | 第47-51页 |
| ·碱基组成特点 | 第51-53页 |
| ·密码子使用及编码氨基酸特点 | 第53-56页 |
| 2 蛋白质基因 | 第56-57页 |
| 3 tRNA基因 | 第57-58页 |
| 4 rRNA基因 | 第58页 |
| 5 (A+T)丰富区 | 第58-60页 |
| 6 笨蝗线粒体基因组酶切图谱分析 | 第60-61页 |
| 7 笨蝗线粒体基因组与其它昆虫线粒体基因组的比较分析 | 第61-64页 |
| 第五部分 利用线粒体基因组重排进行节肢动物系统发育分析 | 第64-77页 |
| 1 线粒体基因组重排在系统发育学研究上的应用 | 第64页 |
| 2 节肢动物内部类群系统发育研究进展 | 第64-67页 |
| 3 基因重排用于系统发育学研究的原理及基本算法 | 第67-68页 |
| ·基本原理 | 第67-68页 |
| ·基本算法 | 第68页 |
| 4 数据来源与分析方法 | 第68-70页 |
| ·数据来源 | 第68-69页 |
| ·分析方法 | 第69-70页 |
| 5 结果 | 第70-74页 |
| 6 分析与讨论 | 第74-77页 |
| ·节肢动物线粒体基因组排序规律 | 第74页 |
| ·节肢动物线粒体基因组基因重排系统发育分析 | 第74-75页 |
| ·线粒体基因组重排用于系统发育研究的优缺点 | 第75-77页 |
| 第六部分 总结 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-91页 |
| 附录一:108种节肢动物线粒体基因组排序 | 第91-93页 |
| 附录二:部分测序结果 | 第93-95页 |
| 附录三:34种节肢动物线粒体基因组排序数字编码 | 第95-98页 |
| 致谢 | 第98-99页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第99页 |