| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-7页 |
| 绪论 | 第7-14页 |
| 第一章 分子作用网络通路数据库HBVPathDB的构建 | 第14-21页 |
| §1.1 HBVPathDB的设计目标 | 第14-15页 |
| §1.2 HBVPathDB体系结构 | 第15-17页 |
| ·通路数据来源 | 第15-16页 |
| ·通路图的绘制 | 第16页 |
| ·数据库选型与构建 | 第16-17页 |
| ·基于PHP实现Web查询界面 | 第17页 |
| §1.3 HBVPathDB实现的主要功能 | 第17-21页 |
| ·四种检索方式的实现 | 第18-19页 |
| ·基于web交互式访问 | 第19页 |
| ·HBV相关的分子相互作用网络 | 第19-21页 |
| 第二章 宿主信号的选择与统计建模 | 第21-32页 |
| §2.1 表达谱数据的获取 | 第21-22页 |
| ·病毒感染相关基因芯片的制备 | 第22页 |
| ·表达谱数据介绍 | 第22页 |
| §2.2 差异表达基因的确定与分析 | 第22-32页 |
| ·感染前后差异表达基因的确定 | 第22-25页 |
| ·差异表达基因功能分析 | 第25-32页 |
| 第三章 基于相关分子相互作用网络的通路辨识 | 第32-39页 |
| §3.1 基于相关分子相互作用网络通路辨识的技术路线 | 第32页 |
| §3.2 药物干预下基因共转录模块的发现 | 第32-35页 |
| ·材料与方法 | 第33-34页 |
| ·药物干预后关键基因的共转录模块 | 第34-35页 |
| §3.3 基于共转录模块的通路辨识 | 第35-39页 |
| ·材料与方法 | 第35-36页 |
| ·通过递推相关发现药物作用下的关键通路与基因 | 第36-39页 |
| 第四章 HBV感染后关键分子的体外验证 | 第39-51页 |
| §4.1 HBV感染后关键分子及其相互关系的体外验证 | 第39-43页 |
| ·DAD1与Fn在HepG2与HepG2.2.15两个细胞系的表达差异 | 第39-41页 |
| ·DAD1与Fn在HepG2.2.15细胞系中的相互关系 | 第41-43页 |
| §4.2 HBV感染宿主细胞关键分子的可药性体外验证 | 第43-51页 |
| ·通过反义寡核酸技术验证DAD1的可药性 | 第43-47页 |
| ·通过小分子化合物0412验证Fn的可药性 | 第47-51页 |
| 第五章 总结 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 附录1-234个基因在HepG2.2.15细胞系与HepG2细胞系中表达量比值的数据 | 第57-67页 |
| 附录2-95个差异基因在拉米夫丁处理后的表达谱数据 | 第67-70页 |
| 附录3-95个差异基因在阿地福韦处理后的表达谱数据 | 第70-73页 |
| 附录4-95个差异基因在IBe5处理后的表达谱数据 | 第73-76页 |
| 论文列表 | 第76-77页 |
| 发表文章 | 第77-79页 |
