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油茶种子EST文库构建及油脂合成关键酶基因的分离鉴定

摘要第1-10页
缩略词第10-11页
第一部分 文献综述第11-40页
 1 油茶栽培利用现状第11-12页
 2 植物cDNA文库构建第12-19页
   ·基因组文库和cDNA文库第12-13页
   ·cDNA文库构建的方法进展第13-16页
     ·标准化cDNA文库第13-14页
     ·差减cDNA文库第14-16页
   ·cDNA文库特点与作用第16-18页
     ·用于筛选与性状相关的重要基因第16-17页
     ·cDNA文库是EST的研究基础和材料第17页
     ·cDNA文库作为SSR引物开发的材料与平台第17页
     ·结合DNA芯片技术对植物基因表达谱进行研究第17-18页
   ·国内植物cDNA文库构建情况第18-19页
 3 植物EST的研究第19-26页
   ·表达序列标签(EST)的产生第19-20页
   ·EST的概念第20页
   ·EST数据库的构建流程第20-21页
   ·EST的特点第21-24页
     ·EST优点和作用第21-22页
     ·EST缺点与克服第22-24页
   ·动、植物EST的构建与基因分离情况第24-25页
   ·EST数据库发展迅速第25页
   ·EST应用前景第25-26页
 4 植物脂肪酸生物合成关键基因研究第26-37页
   ·脂肪酸特点第27页
   ·饱和脂肪酸的生物合成酶与基因第27-30页
     ·乙酰-CoA羧化酶(ACC)第28-29页
     ·植物脂肪酸合成酶(FAS)第29-30页
   ·不饱和脂肪酸的生物合成酶与基因第30-37页
     ·脂肪酸的种类和分布第31-32页
     ·脂肪酸脱饱和酶基因的克隆第32-34页
       ·植物脂酰ACP脱饱和酶与基因第32页
       ·植物脂酰-脂脱饱和酶与基因第32-33页
       ·脂酰CoA脱饱和酶与基因第33-34页
     ·脂肪酸脱饱和酶序列与基因序列分析第34-35页
     ·脂肪酸脱饱和的生物学作用第35-37页
   ·油酯(TAGs)合成及改良脂肪酸的基因工程第37页
 5 本项研究的目的意义和技术路线第37-40页
   ·目的、意义第38页
   ·技术路线第38-40页
第二部分 论文正文第40-119页
 1 油茶种子cDNA文库构建第40-60页
   ·实验材料、试剂与设备第40-41页
     ·材料第40-41页
     ·仪器设备和试剂第41页
       ·主要仪器设备第41页
       ·试剂与器皿第41页
   ·实验方法第41-51页
     ·总RNA的提取第41-43页
       ·变性裂解液法提取总RNA第41-42页
       ·CTAB法提取总RNA第42-43页
     ·RNA浓度及纯度测定第43页
     ·RNA尿素变性琼脂糖凝胶电泳第43页
     ·mRNA的分离纯化第43-44页
     ·mRNA浓度、纯度及电泳测定第44页
     ·cDNA的合成第44-49页
       ·SuperScriptⅡ-RT合成第一链第44-45页
       ·第二链cDNA的合成第45页
       ·双链cDNA末端补平:第45-46页
       ·加接头:第46页
       ·双链cDNA末端的磷酸化及XhoⅠ酶切:第46-47页
       ·cDNA回收第47页
       ·cDNA与质粒载体的连接第47-48页
       ·感受态细胞的制备第48页
       ·向E.coli中导入重组的cDNA第48-49页
       ·cDNA文库的保存第49页
     ·cDNA文库质量测定第49页
       ·库容量测定第49页
       ·计算重组子的百分比第49页
     ·cDNA文库重组克隆插入片段的大小测定第49-51页
       ·DH10B菌液培养第49-50页
       ·质粒DNA的制备第50-51页
       ·菌落PCR扩增鉴定第51页
   ·结果与分析第51-56页
     ·油茶种子总RNA和mRNA提取浓度和纯度检测第51-52页
     ·cDNA回收与连接结果第52页
     ·cDNA文库库容量测定结果第52-53页
     ·油茶种子cDNA文库中插入片段的大小检测第53-55页
     ·cDNA文库的重组率第55页
     ·cDNA克隆片段长度第55-56页
   ·小结与讨论第56-60页
     ·关于油茶种子总RNA的提取与mRNA的分离第56-57页
     ·cDNA文库构建应注意的几个问题第57-58页
     ·构建油茶种子cDNA文库的载体选择第58页
     ·油茶种子cDNA文库的作用第58-60页
 2 油茶EST数据生物信息学分析第60-84页
   ·实验材料和方法第60-62页
     ·实验材料第60页
     ·油茶种子cDNA文库构建第60页
     ·油茶种子EST文库构建第60-62页
       ·试剂与培养基第60-61页
       ·质粒DNA提取第61-62页
       ·EST序列的分析方法第62页
   ·结果与分析第62-80页
     ·克隆测序与EST功能分类第62-64页
     ·油茶种子EST文库与贮藏蛋白有关的基因第64-69页
       ·油茶种子的贮藏蛋白基因第64页
       ·油体蛋白(Oleosin)基因表达第64-66页
       ·油茶种子EST文库中的遍在蛋白基因第66-69页
     ·与蛋白降解有关的基因第69页
     ·与抗病有关的基因第69-70页
     ·与脂肪酸、蜡代谢有关的基因第70-72页
       ·脂酰ACP硫酯酶基因第70页
       ·硬脂酰-ACP脱饱和酶基因第70-71页
       ·油酸脱饱和酶等基因第71页
       ·酰基载体蛋白基因第71-72页
       ·蜡质合成代谢基因第72页
     ·油茶种子EST文库中的重金属解毒蛋白基因第72-73页
     ·油茶种子EST文库中的组蛋白基因第73-74页
     ·油茶表达的适应温度逆境的基因第74页
     ·参与肽链折叠的蛋白因子基因第74-75页
     ·油茶种子EST中植物肌动蛋白基因第75-77页
     ·油茶种子胚胎发育和基因表达第77-78页
     ·油茶种子EST中的脱落酸应答蛋白基因第78页
     ·与次生代谢物质的防卫反应有关的基因第78-79页
     ·油茶种子ACS基因第79-80页
     ·油茶种子EST库中的其它基因第80页
   ·小结与讨论第80-84页
     ·首次成功地构建了油茶种子的EST文库第81页
     ·首次获得了油茶种子中大量特异性表达的新基因与表达分析第81-82页
     ·关于油茶种子EST文库构建的讨论第82-84页
 3 脂肪酸合成基因的分离和鉴定第84-116页
   ·材料与方法第84-86页
     ·材料第84页
     ·方法第84-86页
   ·结果与分析第86-116页
     ·油茶SAD脱饱和酶基因分离和鉴定第86-95页
       ·生物信息学分析第86-95页
         ·与GenBank其它物种比对结果第86-87页
         ·SAD基因相似性比较及聚类分析第87-89页
         ·SAD脱饱和酶氨基酸序列比较第89-93页
         ·SAD基因的DNA扩增第93-95页
     ·油茶FAD2基因的基因组分离鉴定第95-107页
       ·油茶种子FAD2基因cDNA序列第95页
       ·不同油茶基因组材料的PCR结果第95-96页
       ·油茶与其它物种的FAD2基因cDNA序列比较第96-107页
         ·保守区比较第100页
         ·FAD2基因相似性表比较第100页
         ·油茶种子FAD2基因推导转录的氨基酸序列与其它物种的比较第100-107页
       ·油茶种子FAD2基因cDNA的酶切位点第107页
     ·与油脂贮藏有关基因oleosin分离和鉴定第107-110页
       ·Oleosin基因的cDNA序列第107页
       ·Oleosin基因与其它物种的Oleosin基因序列比较结果第107-110页
     ·油茶种子ACP基因分离鉴定第110-116页
       ·油茶种子ACP基因的cDNA序列第110-111页
       ·油茶种子ACP基因与其它物种的ACP基因的聚类与相似性比较第111-113页
       ·小结与讨论第113-116页
         ·分离鉴定了油茶种子硬脂酰ACP脱饱和酶(SAD)基因第113-114页
         ·分离鉴定了油茶种子油酸脱氢酶(FAD2)基因第114页
         ·分离并鉴定了油茶种子的Oleosin基因第114-115页
         ·分离鉴定了油茶种子ACP基因。第115-116页
 4 结论与创新点第116-119页
   ·结论第116-118页
     ·成功地构建了油茶种子cDNA文库第116页
     ·成功地构建立了油茶种子EST文库第116页
     ·对近成熟种子EST文库的基因表达分析第116-117页
     ·从油茶种子中分离鉴定了脂肪酸合成关键基因SAD第117页
     ·成功地分离鉴定了油茶种子中脂肪酸合成关键基因FAD2基因第117页
     ·成功地分离鉴定了油茶油体蛋白基因第117页
     ·成功地分离鉴定了油茶种子ACP基因第117-118页
   ·创新点第118-119页
参考文献第119-134页
ABSTRACT第134-137页
附录第137-151页
 附录A 试剂和配方第137-139页
 附录B 作者简介第139-141页
 附录C 油茶种子脂肪酸、油脂合成的部分基因测序图第141-151页
致谢第151页

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