| 缩略词表 | 第1-14页 |
| 中文摘要 | 第14-16页 |
| ABSTRACT | 第16-18页 |
| 第一章 引言 | 第18-34页 |
| 一、马铃薯X 病毒的研究进展 | 第18-25页 |
| 1. 生物学和血清学 | 第18-19页 |
| ·病毒的发生与分布 | 第18页 |
| ·传播方式与寄主范围 | 第18页 |
| ·血清学 | 第18-19页 |
| 2. PVX 基因组结构与功能 | 第19-22页 |
| ·PVX 5′-末端非翻译区（Untranslational region，5′-UTR） | 第19页 |
| ·RNA 依赖的RNA 聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase，RdRp） | 第19-20页 |
| ·三基因块（Triple-gene block，TGB） | 第20-21页 |
| ·衣壳蛋白（Coat protein，CP） | 第21-22页 |
| ·3′-末端非翻译区（3′-UTR） | 第22页 |
| 3. 株系划分情况 | 第22-23页 |
| 4. PVX 作为表达载体的应用 | 第23-24页 |
| 5. PVX 与马铃薯Y 病毒属病毒的协生作用 | 第24-25页 |
| 二、植物病毒的遗传变异 | 第25-28页 |
| 1. 植物病毒变异机制 | 第26-27页 |
| 2. 植物病毒准种的遗传变异 | 第27-28页 |
| 三、植物根际促生菌的研究进展 | 第28-33页 |
| 1. 根际细菌 | 第29页 |
| 2. PGPR 的根部定殖 | 第29-30页 |
| 3. PGPR 的作用机理 | 第30-32页 |
| ·PGPR 的促生机制 | 第30-31页 |
| ·PGPR 的防病机制 | 第31-32页 |
| 4. PGPR 菌株对植物病毒病的防治作用 | 第32-33页 |
| 四、本研究的目的意义 | 第33-34页 |
| 第二章 马铃薯X 病毒2 个中国分离物全基因组序列测定及分析 | 第34-66页 |
| 1. 材料与方法 | 第34-44页 |
| ·实验材料 | 第34-35页 |
| ·鉴别寄主 | 第34-35页 |
| ·病毒的纯化 | 第35页 |
| ·菌株和质粒 | 第35页 |
| ·生化及分子生物学试剂 | 第35页 |
| ·寡聚核苷酸引物 | 第35页 |
| ·试验方法 | 第35-44页 |
| ·寄主范围测定 | 第35页 |
| ·PVX 分离物的全基因组序列测定及分析 | 第35-40页 |
| ·PVX-FX21 分离物CP 基因的克隆与原核表达 | 第40-44页 |
| 2. 结果与分析 | 第44-64页 |
| ·PVX-FX21 的生物学特性测定与全基因组序列分析 | 第44-47页 |
| ·生物学特性 | 第44-45页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第45-46页 |
| ·PVX-FX21 的基因组结构及保守基序 | 第46-47页 |
| ·马铃薯X 病毒的分子变异分析 | 第47-64页 |
| ·PVX-1985 与PVX-FX21 序列比较与分析 | 第47-51页 |
| ·马铃薯X 病毒基因组变异分析 | 第51-61页 |
| ·PVX 抗血清制备 | 第61-64页 |
| ·RT-PCR PVX CP 扩增基因 | 第61-62页 |
| ·外源DNA 与质粒载体的连接及重组质粒的转化 | 第62页 |
| ·大肠杆菌表达载体的构建 | 第62-63页 |
| ·SDS-PAGE 分析 | 第63页 |
| ·抗血清制备 | 第63页 |
| ·病毒样品的血清学检测 | 第63-64页 |
| 3. 结论与讨论 | 第64-66页 |
| 第三章 烟草脉带花叶病毒全基因组序列测定与结构分析 | 第66-97页 |
| 1. 材料与方法 | 第66-72页 |
| ·实验材料 | 第66-67页 |
| ·毒原的纯化与保存 | 第66页 |
| ·鉴别寄主 | 第66-67页 |
| ·蚜虫 | 第67页 |
| ·菌株和质粒 | 第67页 |
| ·生化及分子生物学试剂 | 第67页 |
| ·寡聚核苷酸引物 | 第67页 |
| ·实验方法 | 第67-72页 |
| ·毒原的纯化 | 第67页 |
| ·寄主范围测定 | 第67页 |
| ·蚜虫传毒试验 | 第67-68页 |
| ·植物总RNA 的提取 | 第68页 |
| ·反转录聚合酶链式反应（RT-PCR） | 第68-71页 |
| ·PCR 产物的纯化 | 第71页 |
| ·连接反应 | 第71页 |
| ·连接产物转化大肠杆菌感受态细胞 | 第71-72页 |
| ·碱裂解法提取质粒DNA | 第72页 |
| ·PCR 鉴定 | 第72页 |
| ·序列测定、拼接及系统分析 | 第72页 |
| 2. 结果与分析 | 第72-76页 |
| ·生物学特性 | 第72页 |
| ·蚜虫传毒 | 第72页 |
| ·TVBMV-YND 基因组结构及序列分析 | 第72-75页 |
| ·一致率分析 | 第75-76页 |
| ·系统进化分析 | 第76页 |
| 3. 结论与讨论 | 第76-97页 |
| 第四章 马铃薯X 病毒与烟草脉带花叶病毒协生作用研究 | 第97-113页 |
| 1. 材料与方法 | 第98-103页 |
| ·实验材料 | 第98页 |
| ·实验方法 | 第98-103页 |
| ·病毒的接种与叶片中病毒浓度的检测 | 第98页 |
| ·烟株生长情况测定 | 第98页 |
| ·烟草光合参数测定 | 第98-99页 |
| ·HC-Pro 中参与协生的氨基酸位点分析 | 第99-103页 |
| 2. 结果与分析 | 第103-110页 |
| ·PVX 和TVBMV 单独侵染和复合侵染在不同烟草品种上的症状 | 第103-104页 |
| ·病毒复合侵染对烟草株高和叶面积的影响 | 第104-105页 |
| ·受两种病毒复合侵染的烟草叶片中病毒浓度的变化 | 第105-106页 |
| ·病毒复合侵染对烟草叶片光合作用的影响 | 第106-108页 |
| ·病毒复合侵染对烟草叶片光合速率的影响 | 第106页 |
| ·病毒复合侵染对烟草叶片蒸腾速率的影响 | 第106页 |
| ·病毒复合侵染对烟草叶片气孔导度的影响 | 第106页 |
| ·病毒复合侵染对烟草叶片胞间 CO_2 浓度的影响 | 第106-108页 |
| ·HC-Pro 定点突变对协生作用的影响 | 第108-110页 |
| 3. 结论与讨论 | 第110-113页 |
| 第五章 PGPR 菌株的筛选、鉴定及生防作用 | 第113-127页 |
| 1. 材料和方法 | 第114-118页 |
| ·实验材料 | 第114页 |
| ·供试病原菌 | 第114页 |
| ·供试植株 | 第114页 |
| ·分离和培养用培养基 | 第114页 |
| ·实验方法 | 第114-118页 |
| ·根际细菌的分离、筛选 | 第114-115页 |
| ·菌株Lyc2 对棉花立枯病的防病效果 | 第115页 |
| ·菌株Lyc2 对棉苗的促生作用 | 第115-116页 |
| ·致病性测定 | 第116页 |
| ·菌株Lyc2 对烟草病毒病的室内及田间抑制作用 | 第116-117页 |
| ·菌株Lyc2 的生理生化及分子鉴定 | 第117-118页 |
| 2. 结果与分析 | 第118-124页 |
| ·根际细菌的分离和筛选 | 第118页 |
| ·对5 个菌株的抑菌谱测定 | 第118页 |
| ·致病性测定 | 第118-120页 |
| ·菌株Lyc2 对棉花立枯病的盆栽防病效果 | 第120页 |
| ·菌株Lyc2 对棉苗的促生作用 | 第120-121页 |
| ·菌株Lyc2 对烟草病毒病的防治效果 | 第121页 |
| ·PGPR 菌悬液喷施处理对三生烟上TMV 枯斑数量的影响 | 第121页 |
| ·PGPR 菌株对田间烟草病毒病的防病效果 | 第121页 |
| ·PGPR 处理对烟草植株生长的影响 | 第121页 |
| ·菌株Lyc2 的鉴定 | 第121-124页 |
| ·形态和培养特征 | 第121-122页 |
| ·生理生化特征 | 第122-123页 |
| ·16S rDNA 及 16S-23S rDNA ITS PCR 扩增、序列测定和分析 | 第123-124页 |
| ·基于recA 基因的PCR 扩增和序列分析 | 第124页 |
| 3. 结论与讨论 | 第124-127页 |
| 全文结论 | 第127-128页 |
| 参考文献 | 第128-152页 |
| 致谢 | 第152-153页 |
| 攻读博士期间发表论文情况 | 第153页 |
