台西南海盆深海沉积物的微生物多样性分析和元基因组学研究
| 中文摘要 | 第1-3页 |
| Abstract | 第3-4页 |
| 中文文摘 | 第4-7页 |
| 目录 | 第7-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-24页 |
| ·课题背景 | 第10-16页 |
| ·深海微生物概况 | 第10-14页 |
| ·深海沉积物中的生物资源 | 第14-16页 |
| ·微生物多样性的研究方法 | 第16-17页 |
| ·核酸为基础的微生物多样性研究方法 | 第16-17页 |
| ·磷脂脂肪酸为基础的微生物多样性研究方法 | 第17页 |
| ·环境元基因组技术 | 第17-22页 |
| ·元基因组文库技术 | 第18-21页 |
| ·大规模测序技术为基础的元基因技术 | 第21-22页 |
| ·研究思路、目的和意义 | 第22-24页 |
| 第2章 深海沉积物总DNA的提取与纯化 | 第24-32页 |
| ·材料与方法 | 第24-27页 |
| ·材料 | 第24-25页 |
| ·基本方法 | 第25-27页 |
| ·结果与分析 | 第27-30页 |
| ·土壤DNA提取效果 | 第27-28页 |
| ·PFGE对沉积物DNA片段分离 | 第28-29页 |
| ·电洗涤纯化的效果 | 第29-30页 |
| ·讨论 | 第30-32页 |
| 第3章 沉积物中细菌和古菌菌群多样性研究 | 第32-56页 |
| ·材料与方法 | 第32-38页 |
| ·材料 | 第32-33页 |
| ·方法 | 第33-38页 |
| ·结果与分析 | 第38-52页 |
| ·16S rDNA片段的PCR扩增 | 第38-39页 |
| ·克隆文库的建立 | 第39-40页 |
| ·文库的PCR-RFLP分析 | 第40页 |
| ·16S rDNA基因的测序和文库多样性分析 | 第40-41页 |
| ·细菌和古菌群体的系统发育分析 | 第41-51页 |
| ·南海沉积物中微生物群体多样性的比较分析 | 第51-52页 |
| ·讨论 | 第52-56页 |
| 第4章 元基因组文库的构建与末端测序分析 | 第56-78页 |
| ·材料与方法 | 第56-59页 |
| ·材料 | 第56-57页 |
| ·实验方法 | 第57-59页 |
| ·结果与分析 | 第59-73页 |
| ·Fosmid元基因组文库的构建 | 第59-60页 |
| ·末端测序与分析 | 第60-73页 |
| ·讨论 | 第73-78页 |
| 第5章 酯裂解活性克隆的筛选、亚克隆及表达 | 第78-96页 |
| ·材料与方法 | 第78-80页 |
| ·材料 | 第78-79页 |
| ·方法 | 第79-80页 |
| ·结果与分析 | 第80-92页 |
| ·酯裂解活性克隆的筛选 | 第80-81页 |
| ·Fosmid克隆的亚克隆 | 第81页 |
| ·亚克隆的测序与分析 | 第81-90页 |
| ·酯裂解活性基因Lip_Y1的克隆与表达 | 第90-91页 |
| ·酯裂解活性基因Lip_Y18的克隆与表达 | 第91-92页 |
| ·讨论 | 第92-96页 |
| 第6章 结论 | 第96-98页 |
| 附录1 部分16S序列 | 第98-100页 |
| 附录2 Fos文库末端序列的BlastX分析结果 | 第100-110页 |
| 附录3 酯裂解活性基因序列 | 第110-114页 |
| 参考文献 | 第114-124页 |
| 攻读学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第124-126页 |
| 致谢 | 第126-128页 |
| 个人简历 | 第128页 |
