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桉树EST-SSR标记开发及其遗传图谱构建

致谢第1-4页
摘要第4-5页
Abstract第5-10页
一 文献综述第10-29页
 1 桉树及其用途第10-12页
   ·桉树的分类第10页
   ·桉树的分布第10-11页
   ·桉树的利用第11-12页
     ·木材的利用第11页
     ·叶的利用第11-12页
     ·其他用途第12页
 2 分子标记及其研究进展第12-23页
   ·常用的分子标记及其特点第13-15页
     ·常用的基因组分子标记第13-15页
     ·常用的功能标记第15页
   ·SSR 分子标记及其在林木中的应用第15-23页
     ·SSR 标记及其特点第15-16页
     ·SSR 的分布及其功能第16-17页
     ·SSR 的类型第17页
     ·SSR 标记的开发第17-19页
     ·SSR 标记的通用性第19页
     ·SSR 标记的局限性第19-20页
     ·林木中的SSR 及其应用第20-23页
 3 遗传图谱的构建及其进展第23-27页
   ·林木遗传图谱构建的现状第23-24页
   ·遗传图谱在林木上的应用第24-25页
     ·进行数量性状位点(QTL)定位的研究第24页
     ·分子标记辅助育种研究第24页
     ·利用连锁图谱进行目的基因的克隆第24-25页
     ·比较基因组研究第25页
   ·桉属遗传图谱的构建第25-27页
 4 本研究目标与研究内容第27-28页
   ·研究目标第27页
   ·研究内容第27-28页
 5 研究技术路线第28-29页
二 桉树 EST-SSR 标记的开发第29-43页
 1 研究材料第29页
   ·引物来源与试剂第29页
     ·引物来源第29页
     ·实验试剂第29页
   ·仪器第29页
   ·实验材料第29页
 2 实验方法第29-33页
   ·DNA 提取及检测第29-31页
     ·DNA 提取方法第29-30页
     ·DNA 检测第30-31页
   ·EST 序列下载拼接及引物设计第31页
     ·EST 序列下载拼接第31页
     ·引物设计第31页
   ·PCR 条件优化与引物筛选第31-32页
   ·用较好的引物对P1 和/或 P2 再测序第32-33页
     ·常规 PCR第32页
     ·PCR 产物纯化及纯化后产物浓度确定第32-33页
     ·测序 PCR 及其纯化第33页
     ·测序结果统计与分析第33页
 3 结果与分析第33-43页
   ·DNA 提取与检测第33-34页
     ·DNA 提取第33页
     ·DNA 检测与比较第33-34页
   ·EST 序列下载拼接及引物设计第34-36页
     ·EST 序列下载及拼接第34-36页
     ·引物设计第36页
   ·PCR 产物检测与引物筛选第36-37页
     ·PCR 产物检测第36页
     ·引物筛选结果第36-37页
   ·P_1 和/或 P_2 再测序第37-43页
     ·测序前纯化及 DNA 浓度确定第37-38页
     ·SSR 区域序列分析第38-39页
     ·与源 EST 序列比对第39-43页
三 遗传图谱的构建第43-54页
 1 研究材料第43页
   ·实验试剂第43页
   ·仪器第43页
   ·材料第43页
 2 实验方法第43-44页
   ·作图初筛第43-44页
   ·作图群体 SSR 片段分析第44页
   ·遗传图谱的构建第44页
 3 结果与分析第44-54页
   ·基因分型检测第44-48页
     ·EST-SSR 引物的多态性筛选第44页
     ·标记分离分析第44-48页
   ·遗传连锁图谱的构建第48-54页
     ·尾叶桉连锁图谱的构建第48页
     ·细叶桉连锁图谱的构建第48-49页
     ·整合图谱的构建第49页
     ·标记的偏分离第49页
     ·图谱比较第49-52页
     ·图谱中eSSR 标记分析第52-54页
四 讨论第54-60页
 1 桉树 EST 中SSR 分布及其特点第54页
 2 引物设计第54-55页
 3 影响 PCR 反应的关键因素第55页
 4 eSSR 标记特点第55-57页
   ·测序验证 SSR第55-56页
   ·同源性比较第56页
   ·测序开发eSSR 标记的优劣第56-57页
 5 图谱构建第57-60页
   ·作图群体的选择第57页
   ·SSR 片段分析的精确性第57-58页
   ·标记偏分离现象第58页
   ·连锁图谱的质量第58页
   ·图谱比较第58-60页
附录A 实验中所用试剂以及溶液的配方第60-62页
附录B 尾叶桉和细叶桉中开发的 EST-SSR 标记第62-78页
附录C 用于作图的标记列表第78-80页
参考文献第80-89页
详细摘要第89-92页

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