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基于CRISPR/Cas9技术构建基因敲减细胞系和小鼠

摘要第9-11页
Abstract第11-12页
Part Ⅰ MTMR14稳定敲减细胞株的建立及表型分析第13-62页
    第一章 绪论第13-26页
        1.1 早期基因编辑技术第13-16页
            1.1.1 RNAi技术第13-15页
            1.1.2 ZFN技术第15-16页
            1.1.3 TALEN技术第16页
        1.2 CRISPR/Cas9技术第16-21页
            1.2.1 CRISPR/Cas系统起源第17页
            1.2.2 CRISPR/Cas分类第17页
            1.2.3 CRISPR/Cas9作用机理第17-18页
            1.2.4 CRISPR/Cas9的应用第18-21页
                1.2.4.1 医学领域第19页
                1.2.4.2 动物科学领域第19-20页
                1.2.4.3 植物科学领域第20页
                1.2.4.4 微生物学领域第20-21页
        1.3 MTMR14研究进展第21-24页
            1.3.1 概述第21页
            1.3.2 MTMR14的发现第21页
            1.3.3 MTMR14的基因和蛋白第21-22页
            1.3.4 MTMR14的生物学功能第22-24页
                1.3.4.1 MTMR14与CNM第22页
                1.3.4.2 MTMR14与钙离子调节第22-23页
                1.3.4.3 MTMR14与自噬第23-24页
        1.4 本文构思第24-26页
            1.4.1 选题缘由第24-25页
            1.4.2 研究内容第25页
            1.4.3 研究目的及意义第25-26页
    第二章 实验材料、仪器和试剂第26-31页
        2.1 实验材料第26页
        2.2 实验仪器和耗材第26-27页
            2.2.1 实验仪器第26页
            2.2.2 实验耗材第26-27页
        2.3 实验试剂第27-28页
        2.4 溶液配制第28-31页
            2.4.1 构载体所需溶液第28-29页
            2.4.2 细胞培养所需溶液第29页
            2.4.3 WesternBlotting所需溶液第29-30页
            2.4.4 MTT所需溶液第30页
            2.4.5 流式细胞术所需溶液第30-31页
    第三章 实验方法第31-46页
        3.1 构建基因敲减细胞系第31-41页
            3.1.1 hMTMR14sgRNA序列的设计第31页
            3.1.2 PX458-sgRNA表达载体的构建和鉴定第31-35页
            3.1.3 细胞培养第35-36页
                3.1.3.1 细胞复苏第35页
                3.1.3.2 细胞换液与传代第35-36页
                3.1.3.3 细胞冻存第36页
            3.1.4 细胞转染第36-37页
                3.1.4.1 提质粒第36-37页
                3.1.4.2 Lipo-2000转染第37页
                3.1.4.3 Lipo-3000转染第37页
            3.1.5 流式细胞仪分选第37页
            3.1.6 单细胞培养第37-38页
            3.1.7 测序鉴定第38-39页
                3.1.7.1 提取细胞基因组第38页
                3.1.7.2 PCR扩增细胞基因组和测序第38-39页
            3.1.8 错配酶酶切鉴定第39-40页
            3.1.9 Western Blotting检测MTMR14的表达第40-41页
                3.1.9.1 细胞总蛋白的提取第40页
                3.1.9.2 Western Blotting第40-41页
        3.2 MTT检测细胞生长速率第41-42页
            3.2.1 细胞计数第41页
            3.2.2 测定标准曲线第41-42页
            3.2.3 测定细胞生长速率第42页
        3.3 流式细胞术检测细胞周期第42-43页
            3.3.1 细胞收集与固定第42页
            3.3.2 细胞染色及检测第42-43页
        3.4 Real-time PCR检测细胞周期调控因子转录水平第43-45页
            3.4.1 总RNA的提取第43页
            3.4.2 逆转录PCR第43-45页
            3.4.3 Real-time PCR第45页
        3.5 统计分析第45-46页
    第四章 MTMR14基因敲减细胞系的建立第46-56页
        4.1 构建MTMR14基因敲减的293T细胞第46-52页
            4.1.1 引言第46页
            4.1.2 分析PX458载体序列第46-48页
            4.1.3 构建PX458-sgRNA表达载体第48-50页
            4.1.4 细胞转染以及流式细胞分选第50页
            4.1.5 PCR和测序分析流式分选细胞基因组序列第50-52页
            4.1.6 PX458-sgRNA表达载体的靶向敲除效果检测第52页
        4.2 构建基因敲减的A549细胞第52-55页
            4.2.1 引言第52-53页
            4.2.2 细胞转染第53页
            4.2.3 分选细胞的基因组测序分析第53-54页
            4.2.4 PX458-sgRNA表达载体的靶向敲除效果检测第54-55页
        4.3 小结第55-56页
    第五章 MTMR14基因敲减的A549细胞系表型分析第56-60页
        5.1 引言第56页
        5.2 实验结果与分析第56-58页
            5.2.1 MTT检测MTMR14表达的减少对细胞增殖的影响第56-57页
            5.2.2 流式细胞术检测细胞周期第57-58页
            5.2.3 Real-timePCR检测细胞周期调控因子转录水平第58页
        5.3 小结第58-60页
    第六章 讨论与展望第60-62页
Part Ⅱ 基于CRISPR/Cas9技术建立RhoA基因敲除小鼠第62-78页
    第一章 前言第62-64页
        1.1 CRISPR/Cas9建立基因敲除小鼠概述第62页
        1.2 RhoA概述第62-63页
        1.3 本文构想第63-64页
    第二章 实验材料、仪器和试剂第64-65页
        2.1 实验材料第64页
        2.2 实验仪器第64页
        2.3 实验试剂第64-65页
    第三章 实验方法第65-72页
        3.1 sgRNA和检测引物的设计第65-66页
        3.2 sgRNA体外活性检测第66-70页
            3.2.1 PCR扩增反应第66-67页
            3.2.2 检测和回收PCR产物第67页
            3.2.3 gRNA转录第67-68页
            3.2.4 回收和提取gRNA第68页
            3.2.5 用于酶切的dsDNA扩增和切胶回收第68-69页
            3.2.6 spCas9/gRNA体外酶切反应第69-70页
        3.3 体外转录sgRNA/Cas9mRNA第70页
        3.4 超排卵与小鼠受精卵的获取第70页
        3.5 小鼠受精卵显微注射sgRNA/Cas9mRNA第70-71页
        3.6 胚胎移植第71页
        3.7 利用PCR和测序对F0代小鼠进行基因型鉴定第71-72页
    第四章 实验结果第72-76页
        4.1 体外sgRNA活性检测第72-73页
        4.2 体外转录sgRNA/Cas9mRNA第73页
        4.3 显微注射第73-74页
        4.4 胚胎移植第74页
        4.5 基因型鉴定第74-75页
        4.6 小结第75-76页
    第五章 讨论与展望第76-78页
参考文献第78-83页
致谢第83-84页
附录A 攻读学位期间所发表的学术论文目录第84页

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