初情期雌性山羊lncRNA的筛选与鉴定
| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩写和符号清单 | 第13-14页 |
| lncRNA与生殖 | 第14-23页 |
| 1 lncRNA概述 | 第14页 |
| 2 lncRNA生物学特点与作用机制 | 第14-15页 |
| 3 lncRNA的生物学功能 | 第15-17页 |
| 3.1 lncRNA与表观调控 | 第16页 |
| 3.2 lncRNA与转录调控 | 第16-17页 |
| 3.3 lncRNA与转录后调控 | 第17页 |
| 4 lncRNA与生殖 | 第17-20页 |
| 4.1 lncRNA对泌乳的影响 | 第17-18页 |
| 4.2 lncRNA对卵母细胞发育的影响 | 第18-19页 |
| 4.3 lncRNA对精子发育的影响 | 第19页 |
| 4.4 lncRNA对胚胎发育的影响 | 第19-20页 |
| 5 lncRNA与初情期启动 | 第20-21页 |
| 5.1 初情期启动的调控机制 | 第20页 |
| 5.2 lncRNA与初情期启动 | 第20-21页 |
| 6 lncRNA对生殖系统疾病的影响 | 第21页 |
| 7 本研究的目的与意义 | 第21-23页 |
| 引言 | 第23-25页 |
| 1 材料与方法 | 第25-36页 |
| 1.1 试验材料 | 第25-27页 |
| 1.1.1 试验动物及样品采集 | 第25页 |
| 1.1.2 主要试剂 | 第25-26页 |
| 1.1.3 主要仪器设备 | 第26页 |
| 1.1.4 参考数据库及分析软件 | 第26-27页 |
| 1.2 lncRNA测序 | 第27-29页 |
| 1.2.1 组织RNA提取与建库 | 第27页 |
| 1.2.2 文库质检及测序 | 第27-28页 |
| 1.2.3 原始序列数据 | 第28-29页 |
| 1.2.4 测序数据质量评估 | 第29页 |
| 1.3 生物信息学分析 | 第29-31页 |
| 1.3.1 参考基因组比对 | 第29页 |
| 1.3.2 转录本表达水平和编码潜能分析 | 第29-31页 |
| 1.3.3 靶基因预测和功能富集分析 | 第31页 |
| 1.4 靶基因功能验证 | 第31-36页 |
| 1.4.1 下丘脑神经元分离培养 | 第31-32页 |
| 1.4.2 siRNA干扰试验 | 第32-33页 |
| 1.4.3 细胞RNA提取,反转与荧光定量PCR | 第33-36页 |
| 2 结果 | 第36-48页 |
| 2.1 雌性山羊初情期鉴定与总RNA质控 | 第36-37页 |
| 2.2 测序数据质量评估 | 第37-38页 |
| 2.3 lncRNA筛选 | 第38-39页 |
| 2.4 lncRNA结构分析 | 第39-40页 |
| 2.5 差异表达分析 | 第40-41页 |
| 2.6 Cis和trans作用靶基因预测 | 第41-42页 |
| 2.7 GO和KEGG富集分析 | 第42-43页 |
| 2.8 特异性表达lncRNAs分析 | 第43-44页 |
| 2.9 候选lncRNA的筛选 | 第44-45页 |
| 2.10 候选lncRNA功能验证 | 第45-48页 |
| 2.10.1 大鼠下丘脑神经元培养 | 第45-46页 |
| 2.10.2 siRNA干扰试验 | 第46-48页 |
| 3 讨论 | 第48-52页 |
| 3.1 山羊初情期的确定 | 第48页 |
| 3.2 lncRNA结构特点分析 | 第48页 |
| 3.3 lncRNA靶基因预测分析 | 第48-49页 |
| 3.4 lncRNA靶基因富集分析 | 第49-50页 |
| 3.5 候选lncRNA筛选 | 第50-51页 |
| 3.6 侯选lncRNA的体外功能验证 | 第51-52页 |
| 4 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-61页 |
| 附录 | 第61-87页 |
| 个人简介 | 第87-88页 |
