| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第13-23页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第13-15页 |
| 1.2 研究现状 | 第15-19页 |
| 1.2.1 水产生物抗性基因的研究现状 | 第15-16页 |
| 1.2.2 水产生物抗菌肽的研究现状 | 第16-19页 |
| 1.3 本文的研究内容及创新点 | 第19-20页 |
| 1.4 本文的结构及内容 | 第20-23页 |
| 第二章 抗性基因与抗菌肽的特征提取方法 | 第23-31页 |
| 2.1 基于氨基酸组成和其理化特性的188维特征 | 第23-25页 |
| 2.2 两亲性伪氨基酸组成特征Am-Pse-AAC | 第25-27页 |
| 2.3 基于位置特异性得分矩阵(PSSM)的PFPA特征 | 第27-28页 |
| 2.4 基于五种理化性质的系列相关型伪氨基酸组成特征Co-Pse-AAC | 第28-31页 |
| 第三章 大黄鱼抗性基因预测模型的构建及预测 | 第31-53页 |
| 3.1 抗性基因基准数据集的获取及构建 | 第32-33页 |
| 3.1.1 抗性基因相关数据库 | 第32页 |
| 3.1.2 正样本及待测样本的构建 | 第32页 |
| 3.1.3 负样本的构建 | 第32-33页 |
| 3.1.4 数据预处理 | 第33页 |
| 3.2 特征提取及数据集平衡 | 第33-35页 |
| 3.2.1 抗性基因特征提取 | 第34-35页 |
| 3.2.2 平衡基准数据集 | 第35页 |
| 3.3 分类器构建 | 第35-38页 |
| 3.4 模型评价标准 | 第38-40页 |
| 3.5 实验结果及分析 | 第40-46页 |
| 3.5.1 不同特征提取方法比较分析 | 第40-42页 |
| 3.5.2 采样方法实验结果 | 第42-43页 |
| 3.5.3 不同分类算法的比较分析 | 第43-46页 |
| 3.6 大黄鱼抗性基因和类抗性基因片段的预测 | 第46-48页 |
| 3.7 大黄鱼R-gene预测系统 | 第48-51页 |
| 3.8 本章小结 | 第51-53页 |
| 第四章 对虾抗菌肽及抗菌功能分类模型的构建及预测 | 第53-75页 |
| 4.1 抗菌肽基准数据集的获取及构建 | 第54-58页 |
| 4.1.1 抗菌肽相关数据库 | 第54页 |
| 4.1.2 正样本的构建 | 第54-55页 |
| 4.1.3 负样本的构建 | 第55-57页 |
| 4.1.4 数据预处理 | 第57-58页 |
| 4.2 特征提取及平衡数据集 | 第58-60页 |
| 4.2.1 特征提取 | 第58-60页 |
| 4.2.2 平衡基准数据集 | 第60页 |
| 4.3 基于多标签分类的两级分类器构建 | 第60-63页 |
| 4.4 模型评价标准 | 第63-64页 |
| 4.5 实验结果及分析 | 第64-71页 |
| 4.5.1 从序列中区分抗菌肽 | 第64-66页 |
| 4.5.2 多功能抗菌肽类别识别 | 第66-70页 |
| 4.5.3 与其他方法的比较 | 第70-71页 |
| 4.6 对虾抗菌肽及其所属抗菌功能的预测 | 第71-72页 |
| 4.7 本章小结 | 第72-75页 |
| 第五章 总结与展望 | 第75-77页 |
| 5.1 总结 | 第75-76页 |
| 5.2 展望 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-81页 |
| 攻读硕士学位期间发表论文及科研情况 | 第81-83页 |
| 致谢 | 第83页 |
