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水稻抽穗期的全基因组关联分析和叶色突变体pgl3的基因克隆

摘要第10-12页
Abstract第12-13页
第一章 前言第14-23页
    1.1 东北粳稻的概况第14-16页
    1.2 全基因组关联分析第16-18页
    1.3 抽穗期基因研究进展第18-20页
    1.4 叶色突变体研究进展第20-22页
    1.5 本研究的目的与意义第22-23页
第二章 水稻抽穗期的全基因组关联分析第23-51页
    2.1 材料与方法第23-27页
        2.1.1 试验材料第23页
        2.1.2 表型调查第23-24页
        2.1.3 基因分型第24页
        2.1.4 群体结构第24页
        2.1.5 全基因组关联分析第24-25页
        2.1.6 序列分析第25-27页
    2.2 结果与分析第27-48页
        2.2.1 材料分布第27-28页
        2.2.2 SNP分布第28-29页
        2.2.3 群体结构分析第29-30页
        2.2.4 亲缘关系分析第30-31页
        2.2.5 抽穗期表型分析第31-34页
        2.2.6 混合线性模型第34-35页
        2.2.7 Hd1的间接关联第35-37页
        2.2.8 Ghd7的间接关联第37-39页
        2.2.9 一般线性模型第39-42页
        2.2.10 Hd1,Ghd7和DTH7基因的多样性分析第42-43页
        2.2.11 Hd1,Ghd7和DTH7单倍型功能分析第43-44页
        2.2.12 三种基因组合的地区适应性分析第44-48页
    2.3 结论与讨论第48-51页
        2.3.1 东北粳稻亲缘关系较近第48-49页
        2.3.2 Hd1,Ghd7和DTH7组合决定的水稻生长区域第49-50页
        2.3.3 抽穗期基因的选择可以指导育种第50-51页
第三章 叶色突变体pgl3的克隆及功能分析第51-66页
    3.1 材料与方法第51-57页
        3.1.1 试验材料和环境条件第51页
        3.1.2 定位群体的构建和遗传分析第51-52页
        3.1.3 DNA提取第52页
        3.1.4 PCR扩增第52-53页
        3.1.5 电泳检测第53页
        3.1.6 PGL3图位克隆和功能互补验证第53-55页
        3.1.7 RNA的提取和Real-timePCR分析第55页
        3.1.8 测定内容及方法第55-56页
        3.1.9 数据处理第56-57页
    3.2 结果分析第57-64页
        3.2.1 表型分析第57-58页
        3.2.2 PGL3的图位克隆第58-60页
        3.2.3 PGL3是叶绿素合成所必须的第60页
        3.2.4 pgl3加速叶片衰老第60-62页
        3.2.5 pgl3对高温敏感第62-64页
    3.3 结论与讨论第64-66页
参考文献第66-79页
附录第79-107页
致谢第107-108页
攻读博士学位论文期间发表论文第108-109页

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