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青藏高原高寒草甸厌氧氨氧化菌群群落结构及丰度的研究

中文摘要第3-4页
Abstract第4页
1 绪论第8-15页
    1.1 厌氧氨氧化及其菌群的研究进展第8-13页
        1.1.1 厌氧氨氧化过程的发现第8-9页
        1.1.2 Anammox过程第9-10页
        1.1.3 Anammox过程的影响因素第10-11页
        1.1.4 厌氧氨氧化菌的分布及生理特性第11-12页
        1.1.5 Anammox的研究方法第12-13页
    1.2 Anammox国内研究进展第13-14页
    1.3 本研究的目的及意义第14-15页
2 材料与方法第15-20页
    2.1 研究位点及样品采集第15-16页
    2.2 青藏高原高寒草甸土壤厌氧氨氧化菌有效引物的筛选第16-18页
        2.2.1 土壤宏基因组提取第16页
        2.2.2 厌氧氨氧化菌16S rDNA的PCR扩增第16-17页
        2.2.3 PCR产物的纯化及重组载体的连接转化第17页
        2.2.4 克隆文库的构建及序列分析第17-18页
    2.3 实时-荧光定量PCR第18-19页
        2.3.1 荧光嵌合法第18页
        2.3.2 标准品的制备第18页
        2.3.3 荧光定量PCR第18-19页
    2.4 厌氧氨氧化菌群的Mi-Seq高通量测序分析第19-20页
3 结果第20-44页
    3.1 青藏高原高寒草甸土壤厌氧氨氧化菌有效引物的分析第20-27页
        3.1.1 厌氧氨氧化菌的群落组成第20-24页
        3.1.2 厌氧氨氧化菌特异引物对不同样品中厌氧氨氧化菌群的分析第24-27页
    3.2 Anammox、AOA、AOB菌群的丰度及其与土壤理化因子的相关性第27-35页
        3.2.1 Anammox、AOA及AOB菌群的丰度第27-33页
        3.2.2 不同类别细菌丰度与土壤理化之间的关性分析第33-35页
    3.3 Mi-seq高通量测序对厌氧氨氧化菌群结构的分析第35-44页
        3.3.1 高通量测序原始数据质量评估第35-37页
        3.3.2 厌氧氨氧化菌群的稀缺性曲线第37页
        3.3.3 厌氧氨氧化菌群组成及分布特征第37-44页
4 讨论第44-47页
    4.1 引物的有效性第44页
    4.2 青藏高原厌氧氨氧化菌群丰度及其与环境的关系第44-45页
    4.3 青藏高原高寒草甸厌氧氨氧化菌的多样性及分布特征第45-47页
5 结论第47-48页
参考文献第48-54页
基金资助惰况第54-55页
致谢第55页

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