摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-9页 |
英文缩略表 | 第14-15页 |
第一章 绪论 | 第15-24页 |
1.1 无量山乌骨鸡简介 | 第15-16页 |
1.2 肠道菌群的相关概念 | 第16页 |
1.3 抗生素对鸡肠道菌群的影响 | 第16-17页 |
1.4 益生菌在家禽生产中的的作用 | 第17页 |
1.5 研究鸡肠道菌群的意义 | 第17-19页 |
1.6 鸡肠道菌群的研究方法 | 第19-20页 |
1.6.1 培养方法 | 第19页 |
1.6.2 16SRNA基因分析 | 第19-20页 |
1.6.3 宏基因组分析 | 第20页 |
1.7 本实验中使用的测序平台简介 | 第20-21页 |
1.7.1 MiSeq测序平台简介及优势 | 第20-21页 |
1.7.2 MiSeq测序原理 | 第21页 |
1.8 关于恩诺沙星的背景知识 | 第21-22页 |
1.9 关于所用益生菌的背景知识 | 第22-23页 |
1.9.1 植物乳杆菌 | 第22页 |
1.9.2 枯草芽孢杆菌 | 第22页 |
1.9.3 产朊假丝酵母 | 第22-23页 |
1.10 项目研究的目的及意义 | 第23页 |
1.11 项目研究的技术路线 | 第23-24页 |
第二章 无量山乌骨鸡雏鸡生产性能的测定 | 第24-34页 |
2.1 材料与方法 | 第24-26页 |
2.1.1 试验仪器及材料 | 第24页 |
2.1.2 实验动物与设计 | 第24-25页 |
2.1.3 饲养管理及基础日粮组成 | 第25页 |
2.1.4 测定指标与方法 | 第25-26页 |
2.1.5 数据统计与处理 | 第26页 |
2.2 结果与分析 | 第26-31页 |
2.2.1 平均日采食量测定结果 | 第26-28页 |
2.2.2 平均日增重测定结果 | 第28-29页 |
2.2.3 耗料增重比测定结果 | 第29-31页 |
2.3 讨论 | 第31-32页 |
2.3.1 抗生素和抗生素替代品对平均日采食量的影响 | 第31页 |
2.3.2 抗生素和抗生素替代品对平均日增重的影响 | 第31-32页 |
2.3.3 抗生素和抗生素替代品对耗料增重比的影响 | 第32页 |
2.4 本章小结 | 第32-34页 |
第三章 无量山乌骨鸡雏鸡免疫器官指数的测定 | 第34-43页 |
3.1 材料与方法 | 第34-35页 |
3.1.1 试验仪器及材料 | 第34页 |
3.1.2 实验动物与设计 | 第34页 |
3.1.3 饲养管理及基础日粮组成 | 第34页 |
3.1.4 测定指标与方法 | 第34-35页 |
3.1.5 数据统计与处理 | 第35页 |
3.2 结果与分析 | 第35-41页 |
3.2.1 胸腺指数的测定测定结果 | 第35-37页 |
3.2.2 脾脏指数的测定测定结果 | 第37-39页 |
3.2.3 法氏囊指数的测定测定结果 | 第39-41页 |
3.3 讨论(抗生素和抗生素替代品对免疫器官指数的影响) | 第41-42页 |
3.4 本章小结 | 第42-43页 |
第四章 无量山乌骨鸡雏鸡抗氧化酶活的测定 | 第43-61页 |
4.1 材料与方法 | 第44-46页 |
4.1.1 试验仪器及材料 | 第44-45页 |
4.1.2 实验动物与设计 | 第45页 |
4.1.3 饲养管理及基础日粮组成 | 第45页 |
4.1.4 测定指标与方法 | 第45页 |
4.1.5 数据统计与处理 | 第45-46页 |
4.2 结果与分析 | 第46-57页 |
4.2.1 总超氧化物歧化酶(T-SOD)活性的测定结果 | 第46-49页 |
4.2.2 过氧化氢酶(CAT)活性的测定结果 | 第49-53页 |
4.2.3 谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-PX)活性的测定结果 | 第53-57页 |
4.3 讨论 | 第57-59页 |
4.3.1 抗生素和益生菌对总超氧化物歧化酶(T-SOD)活性的影响 | 第57-58页 |
4.3.2 抗生素和益生菌对过氧化氢酶(CAT)活性的影响 | 第58页 |
4.3.3 抗生素和益生菌对谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-PX)活性的影响 | 第58-59页 |
4.4 本章小结 | 第59-61页 |
第五章 无量山乌骨鸡雏鸡肠道微生物多样性分析 | 第61-133页 |
5.1 材料与方法 | 第61-70页 |
5.1.1 试验仪器及材料 | 第61-62页 |
5.1.2 实验动物与设计 | 第62页 |
5.1.3 饲养管理及基础日粮组成 | 第62页 |
5.1.4 实验方法与设计 | 第62-68页 |
5.1.5 测定指标与方法 | 第68-70页 |
5.1.6 数据统计与处理 | 第70页 |
5.2 结果与分析 | 第70-127页 |
5.2.1 对共有OTU的分析结果 | 第70-71页 |
5.2.2 对Rarefaction稀疏曲线的分析结果 | 第71-74页 |
5.2.3 对Specaccum物种累积曲线的分析结果 | 第74-75页 |
5.2.4 对Alpha多样性指数计算的分析结果 | 第75-78页 |
5.2.5 对各分类水平的微生物类群数的统计结果 | 第78-80页 |
5.2.6 对各分类水平的分类学组成的分析结果 | 第80-114页 |
5.2.7 关于组间分类学组成的差异分析结果 | 第114-116页 |
5.2.8 关于GraPhlAn分类学组成信息可视化的分析结果 | 第116-117页 |
5.2.9 对于PCA主成分的分析结果 | 第117-118页 |
5.2.10 对于UniFrac距离组间/组内差异比较的分析结果 | 第118-119页 |
5.2.11 关于PLS-DA偏最小二乘法的判别分析结果 | 第119-120页 |
5.2.12 关于Adonis/PERMANOVA多元方差分析和置换检验的结果 | 第120-121页 |
5.2.13 关于ANOSIM相似度的分析结果 | 第121-122页 |
5.2.14 关于功能类群分布的统计结果 | 第122-127页 |
5.3 讨论 | 第127-131页 |
5.3.1 不同部位的肠道菌群 | 第127-128页 |
5.3.2 不同时间的肠道菌群 | 第128-129页 |
5.3.3 肠道菌群与生长性能的关系 | 第129页 |
5.3.4 肠道菌群与免疫器官的关系 | 第129-130页 |
5.3.5 肠道菌群与抗氧化酶活的关系 | 第130页 |
5.3.6 不同处理组的肠道菌群区别 | 第130-131页 |
5.4 本章小结 | 第131-133页 |
第六章 总结与展望 | 第133-135页 |
致谢 | 第135-136页 |
参考文献 | 第136-145页 |
附录 A 读硕士学位期间学术成果 | 第145页 |