| 摘要 | 第4-7页 |
| abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第13-29页 |
| 1.1 研究背景 | 第13-23页 |
| 1.1.1 表观遗传学与血液疾病 | 第13-16页 |
| 1.1.2 可变剪接 | 第16-19页 |
| 1.1.3 高通量测序技术 | 第19-21页 |
| 1.1.4 组蛋白修饰与可变剪接 | 第21-23页 |
| 1.2 主要研究内容和结构安排 | 第23-25页 |
| 1.3 研究意义 | 第25-29页 |
| 第二章 利用新一代测序技术创建数据集 | 第29-49页 |
| 2.1 引言 | 第29-32页 |
| 2.2 材料与方法 | 第32-40页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第32页 |
| 2.2.2 试剂和仪器 | 第32-33页 |
| 2.2.3 实验方法 | 第33-40页 |
| 2.3 结果与分析 | 第40-43页 |
| 2.3.1 ChIP-DNA文库评估 | 第40-42页 |
| 2.3.2 RNA文库质量评估 | 第42-43页 |
| 2.3.3 测序结果 | 第43页 |
| 2.4 讨论 | 第43-47页 |
| 2.5 小结 | 第47-49页 |
| 第三章 组蛋白修饰H3K79me2在剪接位点的富集特征 | 第49-75页 |
| 3.1 引言 | 第49-50页 |
| 3.2 实验环境与方法 | 第50-54页 |
| 3.2.1 实验环境 | 第50页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第50-54页 |
| 3.3 结果与分析 | 第54-70页 |
| 3.3.1 可变剪接类型的鉴定 | 第54-57页 |
| 3.3.2 可变剪接事件的细胞特异性和细胞聚类分析 | 第57-60页 |
| 3.3.3 H3K79me2在剪接位点的富集特征 | 第60-67页 |
| 3.3.4 H3K79me2在外显子跳读事件和3’端可变剪接事件位点的富集特征 | 第67-70页 |
| 3.4 讨论 | 第70-72页 |
| 3.5 小结 | 第72-75页 |
| 第四章 利用自组织神经网络映射分析外显子跳读事件细胞特异性 | 第75-89页 |
| 4.1 前言 | 第75-76页 |
| 4.2 实验方法 | 第76-78页 |
| 4.3 结果与分析 | 第78-84页 |
| 4.3.1 每千个碱基H3K79me2的富集水平细胞排名 | 第78-79页 |
| 4.3.2 SOM聚类 | 第79-82页 |
| 4.3.3 SOM聚类类别中的H3K79me2富集特征 | 第82-84页 |
| 4.4 讨论 | 第84-87页 |
| 4.5 小结 | 第87-89页 |
| 第五章 可变剪接基因表达和剪接因子结合位点图谱特征 | 第89-99页 |
| 5.1 前言 | 第89-90页 |
| 5.2 实验方法 | 第90-91页 |
| 5.3 结果与分析 | 第91-95页 |
| 5.3.1 H3K79me2富集度与基因表达 | 第91页 |
| 5.3.2 基因注释 | 第91-93页 |
| 5.3.3 通路富集分析 | 第93-94页 |
| 5.3.4 剪接因子调控图谱 | 第94-95页 |
| 5.4 讨论 | 第95-97页 |
| 5.5 小结 | 第97-99页 |
| 第六章 利用分子生物学实验分析白血病中DOT1L调控的可变剪接 | 第99-113页 |
| 6.1 前言 | 第99-100页 |
| 6.2 材料与方法 | 第100-104页 |
| 6.2.1 实验材料 | 第100页 |
| 6.2.2 试剂和仪器 | 第100-101页 |
| 6.2.3 实验方法 | 第101-104页 |
| 6.3 结果与分析 | 第104-110页 |
| 6.3.1 利用RT-PCR手段检测特定位点外显子跳读事件 | 第104-105页 |
| 6.3.2 外显子跳读事件的与H3K79me2的关联性 | 第105-106页 |
| 6.3.3 不同细胞中DOT1L表达水平降低抑制H3K79me2修饰水平 | 第106-107页 |
| 6.3.4 抑制DOT1L水平会导致特定可变剪接位点H3K79me2发生改变 | 第107-108页 |
| 6.3.5 在特定细胞中H3K79me2下调会导致可变剪接事件发生改变 | 第108-109页 |
| 6.3.6 抑制H3K79me2水平在特定细胞中会导致细胞增殖改变 | 第109-110页 |
| 6.4 讨论 | 第110-111页 |
| 6.5 小结 | 第111-113页 |
| 第七章 结论与展望 | 第113-119页 |
| 7.1 结论 | 第113-115页 |
| 7.2 本文创新点 | 第115-116页 |
| 7.3 展望 | 第116-119页 |
| 参考文献 | 第119-133页 |
| 博士期间发表的学术论文 | 第133-135页 |
| 致谢 | 第135页 |
