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基于高通量测序对内蒙古绒山羊SNP的挖掘与鉴定

摘要第3-4页
abstract第4-5页
缩略语表第9-10页
1 引言第10-15页
    1.1 绒山羊概述第10页
    1.2 绒山羊毛囊概述第10-11页
        1.2.1 绒山羊毛囊基本结构第10-11页
        1.2.2 绒山羊毛囊的形态发生过程第11页
        1.2.3 绒山羊毛囊周期性生长规律第11页
    1.3 绒山羊毛囊生长发育的分子调控第11-12页
    1.4 高通量测序技术第12-13页
        1.4.1 高通量测序技术发展历程第12-13页
        1.4.2 转录组测序技术(RNA-Seq)与应用第13页
    1.5 SNP检测技术与研究进展第13-14页
    1.6 研究的目的与意义第14-15页
2 研究一基于绒山羊皮肤转录组测序对SNP的挖掘第15-31页
    2.1 材料与方法第15-16页
        2.1.1 实验材料第15页
        2.1.2 主要试剂和仪器第15-16页
    2.2 实验方法第16-23页
        2.2.1 RNA的提取第16-17页
        2.2.2 RNA的质量检测第17页
        2.2.3 磁珠法获取mRNA第17页
        2.2.4 样品打断第17-18页
        2.2.5 cDNA的合成第18-19页
        2.2.6 PCR扩增第19-20页
        2.2.7 RNA测序第20-21页
        2.2.8 数据质控和序列比对第21页
        2.2.9 SNP信息统计第21页
        2.2.10 SNP的功能注释第21页
        2.2.11 SNP的验证第21-23页
    2.3 结果与分析第23-30页
        2.3.1 总RNA的提取第23页
        2.3.2 测序数据质控第23-30页
    2.4 讨论第30-31页
3 研究二候选SNP位点与绒毛性状关联分析第31-45页
    3.1 材料与方法第31-35页
        3.1.1 实验材料第31页
        3.1.2 实验试剂第31页
        3.1.3 实验仪器第31页
        3.1.4 实验方法第31-35页
    3.2 结果与分析第35-42页
        3.2.1 DNA质检结果第35-36页
        3.2.2 引物设计第36页
        3.2.3 Sequenom的整理结果第36-37页
        3.2.4 结果统计第37页
        3.2.5 统计分析结果第37-42页
    3.3 讨论第42-45页
4 结论第45-46页
致谢第46-47页
参考文献第47-51页
附表 个体SNP分型结果第51-69页
作者简介第69页

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