摘要 | 第3-4页 |
abstract | 第4-5页 |
缩略语表 | 第9-10页 |
1 引言 | 第10-15页 |
1.1 绒山羊概述 | 第10页 |
1.2 绒山羊毛囊概述 | 第10-11页 |
1.2.1 绒山羊毛囊基本结构 | 第10-11页 |
1.2.2 绒山羊毛囊的形态发生过程 | 第11页 |
1.2.3 绒山羊毛囊周期性生长规律 | 第11页 |
1.3 绒山羊毛囊生长发育的分子调控 | 第11-12页 |
1.4 高通量测序技术 | 第12-13页 |
1.4.1 高通量测序技术发展历程 | 第12-13页 |
1.4.2 转录组测序技术(RNA-Seq)与应用 | 第13页 |
1.5 SNP检测技术与研究进展 | 第13-14页 |
1.6 研究的目的与意义 | 第14-15页 |
2 研究一基于绒山羊皮肤转录组测序对SNP的挖掘 | 第15-31页 |
2.1 材料与方法 | 第15-16页 |
2.1.1 实验材料 | 第15页 |
2.1.2 主要试剂和仪器 | 第15-16页 |
2.2 实验方法 | 第16-23页 |
2.2.1 RNA的提取 | 第16-17页 |
2.2.2 RNA的质量检测 | 第17页 |
2.2.3 磁珠法获取mRNA | 第17页 |
2.2.4 样品打断 | 第17-18页 |
2.2.5 cDNA的合成 | 第18-19页 |
2.2.6 PCR扩增 | 第19-20页 |
2.2.7 RNA测序 | 第20-21页 |
2.2.8 数据质控和序列比对 | 第21页 |
2.2.9 SNP信息统计 | 第21页 |
2.2.10 SNP的功能注释 | 第21页 |
2.2.11 SNP的验证 | 第21-23页 |
2.3 结果与分析 | 第23-30页 |
2.3.1 总RNA的提取 | 第23页 |
2.3.2 测序数据质控 | 第23-30页 |
2.4 讨论 | 第30-31页 |
3 研究二候选SNP位点与绒毛性状关联分析 | 第31-45页 |
3.1 材料与方法 | 第31-35页 |
3.1.1 实验材料 | 第31页 |
3.1.2 实验试剂 | 第31页 |
3.1.3 实验仪器 | 第31页 |
3.1.4 实验方法 | 第31-35页 |
3.2 结果与分析 | 第35-42页 |
3.2.1 DNA质检结果 | 第35-36页 |
3.2.2 引物设计 | 第36页 |
3.2.3 Sequenom的整理结果 | 第36-37页 |
3.2.4 结果统计 | 第37页 |
3.2.5 统计分析结果 | 第37-42页 |
3.3 讨论 | 第42-45页 |
4 结论 | 第45-46页 |
致谢 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-51页 |
附表 个体SNP分型结果 | 第51-69页 |
作者简介 | 第69页 |