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布尼亚病毒转录复制复合体结构生物学研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
目录第5-8页
主要符号对照表第8-11页
第1章 引言第11-38页
    1.1 选题背景和意义第11-13页
    1.2 布尼亚病毒的特征,基因组结构,生命活动周期和相关疾病第13-22页
        1.2.1 布尼亚病毒的特征第13页
        1.2.2 布尼亚病毒基因组结构第13-14页
        1.2.3 布尼亚病毒生活周期第14-20页
            1.2.3.1 布尼亚病毒 RNA 的转录第14-17页
            1.2.3.2 病毒基因组的复制第17-19页
            1.2.3.3 病毒基因组的翻译第19-20页
        1.2.4 布尼亚病毒相关疾病第20-22页
    1.3 正布尼亚病毒的研究简史第22-26页
        1.3.1 正布尼亚病毒研究简史第22页
        1.3.2 正布尼亚病毒特点第22-26页
    1.4 内罗病毒的研究简史第26-27页
    1.5 几种典型的负链 RNA 病毒 NP 结构生物学研究概况第27-36页
        1.5.1 博尔纳病毒(Borna disease virus)核蛋白研究概况第28-29页
        1.5.2 水疱性口炎病毒(Vesicular stomatitis virus)和狂犬病毒(Rabies virus)核蛋白研究概况第29-30页
        1.5.3 呼吸道合胞体病毒(Respiratory syncytial virus)核蛋白研究概况第30-31页
        1.5.4 拉萨热病毒(Lassa Fever virus)核蛋白的研究概况第31-34页
        1.5.5 裂谷热病毒(Rift Valley Fever virus)核蛋白结构研究第34-35页
        1.5.6 甲型流感病毒(InfluenzaAvirus)核蛋白研究现状第35-36页
    1.6 本课题研究的内容和意义第36-37页
    1.7 论文结构安排第37-38页
第2章 正布尼亚病毒属布尼韦尔病毒核蛋白复合物的结构研究第38-80页
    2.1 实验方法第38-53页
        2.1.1 布尼韦尔病毒(Bunyamwera virus,BUNV)核蛋白的表达纯化第38-44页
            2.1.1.1 BUNV NP 蛋白的基本生化性质分析第38-40页
            2.1.1.2 BUNV NP 蛋白表达载体的构建第40-41页
            2.1.1.3 BUNV NP 蛋白的表达纯化第41-44页
        2.1.2 BUNV NP 蛋白负染电镜(negative stain electron microscopy)研究第44-48页
            2.1.2.1 电镜样品制备第44-45页
            2.1.2.2 高质量电镜数据的收集第45-46页
            2.1.2.3 负染数据处理第46页
            2.1.2.4 BUNV NP 电镜数据结果和分析第46-48页
        2.1.3 BUNV NP 蛋白母体晶体的生长和优化第48-53页
            2.1.3.1 蛋白质结晶的基本原理第48页
            2.1.3.2 BUNV NP 蛋白质结晶条件的初步筛选第48-49页
            2.1.3.3 BUNV NP 蛋白质晶体的优化第49-50页
            2.1.3.4 BUNV NP 蛋白硒代甲硫氨酸晶体衍生物的制备第50-53页
    2.2 BUNV NP 蛋白质晶体数据的收集、处理第53-55页
        2.2.1 BUNV NP 母体蛋白晶体的数据收集第53-54页
        2.2.2 BUNV NP 蛋白晶体的数据处理第54页
        2.2.3 BUNV NP 蛋白硒代甲硫氨酸晶体衍生物数据的收集和处理第54-55页
    2.3 BUNV NP 蛋白质晶体相位确定及结构解析第55-62页
    2.4 BUNV NP-RNA 复合物三维结构分析第62-80页
        2.4.1 BUNV NP-RNA 复合物总体结构描述第62-64页
        2.4.2 BUNV NP-RNA 复合物拓扑结构分析第64-65页
        2.4.3 BUNV NP 与 RNA 相互作用分析第65-71页
            2.4.3.1 BUNV NP 与 RNA5’端相互作用分析第67-68页
            2.4.3.2 BUNV NP 与 RNA 中段相互作用分析第68-69页
            2.4.3.3 BUNV NP 与 RNA3’端相互作用分析第69-71页
        2.4.4 BUNV NP 蛋白之间相互作用分析第71-76页
            2.4.4.1 BUNV NP 蛋白 N-arm 与相邻 NP 分子 N lobe 的相互作用第73-74页
            2.4.4.2 BUNV NP 蛋白 C-tail 与相邻 NP 分子 C lobe 的相互作用第74-76页
        2.4.5 与同属其他成员 NP 序列及结构的比较第76-77页
        2.4.6 BUNV 天然 RNP 的电镜研究第77-80页
第3章 内罗病毒属克里米亚-刚果出血热病毒核蛋白寡聚体结构研究第80-94页
    3.1 实验方法第80-84页
        3.1.1 CCHFV NP 蛋白的表达和纯化第80-83页
        3.1.2 电镜样品的制备、数据收集以及数据处理第83-84页
    3.2 CCHFV NP 电镜数据结果和分析第84-94页
        3.2.1 CCHFV NP-RNA 寡聚体的负染电镜结果第84-86页
        3.2.2 CCHFV NP 蛋白的寡聚形式第86-90页
        3.2.3 CCHFV NP 蛋白之间的相互作用第90-91页
        3.2.4 CCHFV NP-RNA 的相互作用第91-92页
        3.2.5 CCHFV 天然 RNP 电镜研究第92-94页
第4章 讨论和展望第94-101页
    4.1 基于 BUNV NP-RNP 复合物结构的讨论和展望第96-98页
    4.2 基于 CCHFV NP 五聚体模型的讨论与展望第98-101页
参考文献第101-109页
致谢第109-111页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第111页

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