| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第11-27页 |
| 1.1 海绵共生微生物：海洋生态学与生物技术的热点 | 第11-16页 |
| 1.1.1 海绵：微生物滤器 | 第11-12页 |
| 1.1.2 快速增长的文献与序列库 | 第12-13页 |
| 1.1.3 驱动研究的动力：新药前景 | 第13-16页 |
| 1.2 海绵共生微生物：多样与独特 | 第16-24页 |
| 1.2.1 分子技术：剑指微生物多样性 | 第16-20页 |
| 1.2.2 海绵共生微生物：多样性与特异性 | 第20-23页 |
| 1.2.3 海绵共生微生物：群落建立与延续 | 第23-24页 |
| 1.3 海绵--共生微生物研究：瓶颈与新方向 | 第24-25页 |
| 1.4 研究目的、意义、内容 | 第25-27页 |
| 1.4.1 研究目的与意义 | 第25-26页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第26页 |
| 1.4.3 创新点 | 第26-27页 |
| 第二章 Holoxea sp.原核共生体的种群多样性和空间分布 | 第27-50页 |
| 2.1 实验材料 | 第27-28页 |
| 2.2 实验方法 | 第28-33页 |
| 2.2.1 海绵组织解离与细胞分选 | 第28-29页 |
| 2.2.2 总DNA 提取 | 第29页 |
| 2.2.3 基因克隆与测序 | 第29-32页 |
| 2.2.4 核酸序列的生物信息学分析 | 第32-33页 |
| 2.3 实验结果 | 第33-47页 |
| 2.3.1 海绵单细胞的分离 | 第33-34页 |
| 2.3.2 基因组DNA 提取 | 第34页 |
| 2.3.3 基因克隆 | 第34页 |
| 2.3.4 Holoxea sp. 原核共附体种属多样性分析 | 第34-47页 |
| 2.4 讨论 | 第47-49页 |
| 2.5 本章小结 | 第49-50页 |
| 第三章 Holoxea sp.原核共生体的定量分析 | 第50-55页 |
| 3.1 实验材料 | 第50页 |
| 3.2 实验方法 | 第50-52页 |
| 3.2.1 RTQ-PCR 反应体系配制 | 第50-51页 |
| 3.2.2 荧光定量PCR 引物 | 第51页 |
| 3.2.3 标准曲线制作与融变曲线分析 | 第51-52页 |
| 3.3 实验结果 | 第52-53页 |
| 3.4 讨论 | 第53-54页 |
| 3.5 本章小结 | 第54-55页 |
| 第四章 结语 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-62页 |
| 附录1 溶液试剂及培养基 | 第62-65页 |
| 附录2 实验所用仪器设备 | 第65-66页 |
| 附录3 海绵共生放线菌的165 rRNA 基因序列 | 第66-82页 |
| 附录4 海绵共生细菌的165 rRNA 基因序列 | 第82-116页 |
| 附录5 海绵共生古菌的165 rRNA 基因序列 | 第116-118页 |
| 附录6 海绵共生氨氧化古菌的amoA 基因序列 | 第118-123页 |
| 待发表论文 | 第123-124页 |
| 致谢 | 第124-126页 |
