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丁香假单胞菌MB03冰核蛋白基因低温依赖型启动子转录活性的研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
缩略语表第11-12页
1 前言第12-31页
    1.1 启动子概述第12-15页
        1.1.1 启动子结构第12-15页
            1.1.1.1 原核生物启动子第12-14页
            1.1.1.2 真核生物启动子第14-15页
    1.2 启动子分类第15-18页
        1.2.1 组成型启动子第15-16页
        1.2.2 诱导型启动子第16-18页
    1.3 启动子的研究手段第18-23页
        1.3.1 软件预测启动子第18页
        1.3.2 利用算法识别原核生物启动子第18-19页
        1.3.3 启动子捕获方法分离和鉴别启动子第19-23页
            1.3.3.1 基因组文库筛选第19页
            1.3.3.2 利用启动子探针质粒载体筛选启动子第19-20页
            1.3.3.3 常规PCR法第20页
            1.3.3.4 反向PCR第20-21页
            1.3.3.5 锅柄PCR第21页
            1.3.3.6 热不对称PCR法第21-22页
            1.3.3.7 Y型接头扩增法第22-23页
    1.4 冰核活性细菌(INA细菌)第23-28页
        1.4.1 冰核活性细菌简介第23-24页
        1.4.2 已报道冰核细菌分布第24-26页
        1.4.3 冰核活性基因在假单胞菌中的分布第26页
        1.4.4 我国冰核细菌的研究概况第26-27页
        1.4.5 存在问题第27-28页
    1.5 低温酶第28-29页
        1.5.1 低温脂肪酶第28-29页
        1.5.2 低温蛋白酶第29页
        1.5.3 低温纤维素酶第29页
    1.6 研究的目的和意义第29-31页
2 材料与方法第31-41页
    2.1 实验材料第31-34页
        2.1.1 菌株和质粒第31-32页
        2.1.2 培养基第32页
        2.1.3 实验所需试剂第32-34页
            2.1.3.1 质粒、总DNA提取,质粒转化,质粒快检所需试剂第32-33页
            2.1.3.2 大肠杆菌和假单胞菌感受态制备所需试剂第33页
            2.1.3.3 SDS-PAGE所需试剂第33页
            2.1.3.4 Western Blot所需试剂第33页
            2.1.3.5 GFP荧光强度所需试剂第33-34页
            2.1.3.6 琼脂糖凝胶电泳所需试剂第34页
            2.1.3.7 高效液相所用试剂第34页
        2.1.4 实验所用仪器第34页
    2.2 实验方法第34-41页
        2.2.1 大肠杆菌和假单胞菌基因组的提取第34-35页
        2.2.2 大肠杆菌和假单胞菌质粒的提取第35页
        2.2.3 DNA体外重组第35页
        2.2.4 恶臭假单胞菌的电转化法第35-36页
        2.2.5 大肠杆菌转化子和恶臭假单胞菌转化子的筛选鉴定第36页
        2.2.6 绿色荧光蛋白(GFP)荧光活性的测定第36页
        2.2.7 SDS-PAGE样品制备和电泳第36-37页
        2.2.8 Western Blot实验第37页
        2.2.9 芥菜籽沸水抽提物的制备第37页
        2.2.10 高效液相色谱样品的制备及运行条件第37-38页
        2.2.11 RNA的提取第38页
        2.2.12 PCR扩增第38-41页
3 结果与分析第41-63页
    3.1 冰晶核蛋白基因启动子的序列分析第41-44页
        3.1.1 冰晶核蛋白基因启动子的序列比对第41-44页
        3.1.2 冰核基因启动子结构预测第44页
    3.2 启动子活性分析第44-54页
        3.2.1 RT-qPCR确定冰核基因的相对表达量第44-46页
        3.2.2 启动子序列的克隆第46-47页
        3.2.3 重组菌的启动活性验证第47-50页
            3.2.3.1 转化丁香假单胞菌第47-49页
            3.2.3.2 转化大肠杆菌验证活性第49页
            3.2.3.3 转化恶臭假单胞菌验证活性第49-50页
        3.2.4 比较P522和poprL的启动活性第50-52页
        3.2.5 比较不同长度启动子在大肠杆菌中的启动活性第52-54页
    3.3 冰核基因启动子的表达条件第54-63页
        3.3.1 培养基对启动子性能的影响第54-55页
        3.3.2 温度对启动子性能的影响第55-59页
            3.3.2.1 恒温培养第55-57页
            3.3.2.2 变温培养第57-59页
        3.3.3 化学诱导物对启动子性能的影响第59-63页
4. 小结与讨论第63-68页
    4.1 讨论第63-67页
        4.1.1 启动子性能分析第63-65页
        4.1.2 启动子表达条件初探第65-66页
        4.1.3 启动子展望第66-67页
    4.2 小结第67-68页
参考文献第68-76页
致谢第76页

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