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内生固氮菌DX120E与甘蔗互作的生理和分子生物学基础研究

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-10页
1 前言第16-28页
    1.1 甘蔗联合固氮菌的分离鉴定第16-18页
    1.2 联合固氮菌在甘蔗体内的定殖第18-20页
    1.3 联合固氮菌对甘蔗的促生作用第20页
    1.4 联合固氮菌对甘蔗生长生理的影响第20-21页
    1.5 甘蔗基因型和环境因子对甘蔗联合固氮的影响第21-22页
    1.6 甘蔗联合固氮的分子机理第22-26页
        1.6.1 固氮酶的结构和基因第22-23页
        1.6.2 固氮酶基因的检测第23-24页
        1.6.3 甘蔗与联合固氮菌互作的基因组学和蛋白质组学研究第24-26页
    1.7 研究的目的和意义第26-27页
    1.8 研究的技术路线第27-28页
2 固氮菌DX120E在甘蔗植株内的定殖第28-39页
    2.1 材料和方法第28-31页
        2.1.1 材料第28-29页
        2.1.2 甘蔗组培苗的培养第29页
        2.1.3 无菌条件下固氮菌DX120E的接种第29-30页
        2.1.4 荧光显微镜检测GFP标记的DX120E在甘蔗植株内的定殖第30页
        2.1.5 内生固氮菌DX120E重分离培养的平板实验第30-31页
    2.2 结果和分析第31-36页
        2.2.1 DX120E在甘蔗组培苗根和叶中的定殖第31-33页
        2.2.2 不同接菌水平下固氮菌DX120E在培养基中群体密度第33-34页
        2.2.3 不同接菌水平下DX120E在甘蔗组培苗植株内的群体数量第34-35页
        2.2.4 同一接菌水平下DX120E在甘蔗组培苗不同器官内的的群体动态第35-36页
    2.3 讨论第36-39页
3 固氮菌DX120E接种甘蔗后对甘蔗生长生理的影响第39-53页
    3.1 材料和方法第39-42页
        3.1.1 材料第39页
        3.1.2 盆栽试验设计第39-40页
        3.1.3 DX120E在甘蔗体内定殖量的检测第40页
        3.1.4 株高的测定第40-41页
        3.1.5 叶片叶绿素含量、氮代谢相关酶活性和硝态氮含量的测定第41页
        3.1.6 生物量和矿质元素含量的测定第41页
        3.1.7 光合生理参数的测定第41页
        3.1.8 接种处理后的甘蔗组培苗不同部位固氮基因nifH的扩增第41-42页
        3.1.9 数据处理第42页
    3.2 结果和分析第42-51页
        3.2.1 固氮菌DX120E在甘蔗植株体内的定殖数量第42-43页
        3.2.2 接种固氮菌DX120E对甘蔗株高的影响第43-44页
        3.2.3 接种固氮菌DX120E对甘蔗叶片叶绿素、硝态氮含量和氮代谢相关酶活性的影响第44-45页
        3.2.4 接种固氮菌DX120E对甘蔗植株生物量的影响第45-46页
        3.2.5 接种固氮菌DX120E对甘蔗植株矿质元素含量的影响第46-47页
        3.2.6 接种固氮菌DX120E对甘蔗植株矿质元素积累量的影响第47-48页
        3.2.7 接种固氮菌DX120E对甘蔗光合生理的影响第48-49页
        3.2.8 接种后两个甘蔗品种组培苗不同部位nifH基因片段扩增结果第49-51页
    3.3 讨论第51-53页
4 广西本地分离的内生固氮菌Klebsiella sp.DX120E与巴西分离的内生固氮模式菌株Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5的比较研究第53-68页
    4.1 材料与方法第53-55页
        4.1.1 材料第53-54页
        4.1.2 盆栽试验设计第54页
        4.1.3 株高的测定第54页
        4.1.4 生物量的测定第54-55页
        4.1.5 N含量和~(15)N原子百分超的测定第55页
        4.1.6 光合生理参数的测定第55页
        4.1.7 数据处理第55页
    4.2 结果与分析第55-66页
        4.2.1 接种固氮菌DX120E和PAL5对两个甘蔗品种株高的影响第55-56页
        4.2.2 接种固氮菌DX120E和PAL5对两个甘蔗品种苗期生物量的影响第56-58页
        4.2.3 接种固氮菌DX120E和PAL5对两个甘蔗品种苗期氮含量的影响第58页
        4.2.4 接种固氮菌DX120E和PAL5对两个甘蔗品种苗期~(15)N原子百分超、固氮百分率和固氮量的影响第58-60页
        4.2.5 接种固氮菌DX120E和PAL5对两个甘蔗品种伸长期生物量的影响第60-61页
        4.2.6 接种固氮菌DX120E和PAL5对两个甘蔗品种伸长期氮含量的影响第61-62页
        4.2.7 接种固氮菌DX120E和PAL5对两个甘蔗品种伸长期~(15)N原子百分超、固氮百分率和固氮量的影响第62-64页
        4.2.8 接种固氮菌DX120E和PAL5对两个甘蔗品种伸长期光合生理参数的影响第64-66页
    4.3 讨论第66-68页
5 内生固氮菌DX120E的鉴定和全基因组测序第68-80页
    5.1 材料和方法第68-72页
        5.1.1 试验材料第68-69页
        5.1.2 试剂和仪器第69页
        5.1.3 细菌DNA的提取第69页
        5.1.4 细菌单菌落裂解液的制备第69页
        5.1.5 16S rRNA、rpoB和gyrA基因的克隆和测序第69-70页
        5.1.6 系统进化树的构建第70-71页
        5.1.7 基因组测序第71页
        5.1.8 基因预测及注释第71-72页
    5.2 结果和分析第72-78页
        5.2.1 16S rRNA、rpoB和gyrA基因的PCR扩增结果第72-73页
        5.2.2 16S rRNA、rpoB和gyrA基因的系统进化树分析第73-74页
        5.2.3 DX120E基因组的组装第74页
        5.2.4 DX120E基因组的概况第74-77页
        5.2.5 基因组的COG功能分类第77-78页
    5.3 讨论第78-80页
6 固氮菌DX120E与甘蔗组培苗互作的蛋白质组学研究第80-104页
    6.1 材料与方法第80-87页
        6.1.1 植物材料和菌种第80页
        6.1.2 材料处理和取样第80-81页
        6.1.3 主要仪器设备和生化试剂第81页
        6.1.4 细菌总蛋白的双向凝胶电泳第81-84页
        6.1.5 甘蔗组培苗接种固氮菌DX120E后的蛋白质组分析第84-87页
    6.2 结果与分析第87-101页
        6.2.1 固氮菌DX120E菌体总蛋白的SDS-PAGE第87-88页
        6.2.2 固氮菌DX120E菌体总蛋白的双向电泳条件的筛选第88-89页
        6.2.3 固氮菌DX120E的菌体总蛋白与甘蔗组培苗共培养后的双向电泳分析第89-90页
        6.2.4 固氮菌DX120E与甘蔗组培苗共培养后的差异蛋白点的质谱鉴定第90-93页
        6.2.5 鉴定的固氮菌DX120E的差异表达蛋白质的功能分类第93-94页
        6.2.6 与固氮菌DX120E共培养后的甘蔗组培苗根以上部分的蛋白组鉴定结果第94-100页
        6.2.7 甘蔗组培苗与固氮菌DX120E共培养后根以上部分差异表达蛋白功能分类第100-101页
    6.3 讨论第101-104页
        6.3.1 甘蔗组培苗对固氮菌DX120E蛋白质的影响第101-102页
        6.3.2 固氮菌DX120E对甘蔗组培苗根以上部分蛋白质的影响第102-104页
7 结论第104-108页
    7.1 全文总结第104-106页
    7.2 本论文的创新点第106页
    7.3 问题与展望第106-108页
致谢第108-109页
参考文献第109-124页
附录第124-125页

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