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板栗疫病菌菌株EP155和EP713在线粒体上的差异蛋白质组学研究

摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
1 前言第10-21页
    1.1 板栗疫病菌与低毒病毒第10-14页
        1.1.1 板栗疫病与板栗疫病菌的发现第10页
        1.1.2 板栗疫病菌慨况第10-11页
        1.1.3 低毒力现象与低毒病毒的发现第11页
        1.1.4 低毒病毒的分子生物学第11-12页
        1.1.5 低毒病毒和板栗疫病菌系统第12-13页
        1.1.6 板栗疫病菌线粒体低毒力现象第13-14页
    1.2 蛋白质组学研究方法第14-20页
        1.2.1 蛋白质组学技术概况第14-15页
        1.2.2 二维凝胶电泳技术第15-16页
        1.2.3 双向荧光差异凝胶电泳(2D-DIGE)技术第16-19页
        1.2.4 生物质谱技术第19-20页
    1.3 本研究目的和意义第20-21页
2 材料与方法第21-33页
    2.1 板栗疫病菌菌种和培养方法第21页
        2.1.1 板栗疫病菌菌种第21页
        2.1.2 板栗疫病菌菌种短期保存第21页
        2.1.3 板栗疫病菌菌体培养条件与收集第21页
    2.2 板栗疫病菌线粒体的制备第21-23页
        2.2.1 线粒体的粗提第22页
        2.2.2 粗制线粒体的纯化第22页
        2.2.3 纯化线粒体的透射电子显微镜观察第22-23页
    2.3 板栗疫病菌线粒体蛋白的纯化第23-24页
        2.3.1 线粒体蛋白的提取第23页
        2.3.2 线粒体蛋白的纯化第23-24页
    2.4 板栗疫病菌线粒体蛋白质定量第24-26页
        2.4.1 Bradford溶液的配制第24页
        2.4.2 标准曲线的绘制第24页
        2.4.3 使用Bradford法定量未知样品第24-26页
    2.5 双向电泳(双向电泳所用试剂配方参见附录)第26-29页
        2.5.1 双向电泳第一向等电聚焦第26页
        2.5.2 双向电泳第二向垂直SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳第26-28页
        2.5.3 硝酸银染色第28页
        2.5.4 胶体考马斯亮蓝染色第28页
        2.5.5 图像扫描第28-29页
        2.5.6 软件分析第29页
    2.6 荧光差异凝胶电泳(2D-DIGE)第29-31页
        2.6.1 样品的制备与纯化第29页
        2.6.2 蛋白质样品的pH调节第29页
        2.6.3 蛋白质样品的定量第29页
        2.6.4 蛋白质样品的标记第29-30页
        2.6.5 配制用于标记的CyDye DIGE Flour储存液第30页
        2.6.6 配制CyDye DIGE Flour工作液第30页
        2.6.7 使用CyDye DIGE Flour工作液对样品进行标记第30-31页
        2.6.8 避光条件下进行双向电泳第31页
        2.6.9 激光扫描第31页
        2.6.10 凝胶图像差异分析第31页
    2.7 蛋白质点的质谱鉴定第31-32页
        2.7.1 银染蛋白质点的酶解处理第32页
        2.7.2 样品的质谱鉴别第32页
    2.8 线粒体蛋白的western blot检验第32-33页
3 实验结果第33-50页
    3.1 板栗疫病菌线粒体提取方法的建立以及双向电泳条件的优化第33-38页
        3.1.1 板栗疫病菌线粒体提取方法的建立第33页
        3.1.2 板栗疫病菌线粒体蛋白双向电泳条件优化第33-36页
        3.1.3 质谱鉴定验证线粒体纯度第36-38页
    3.2 板栗疫病菌线粒体差异蛋白质组学研究第38-50页
        3.2.1 传双向电泳初步检测差异第38-41页
        3.2.2 板栗疫病菌线粒体蛋白的荧光差异凝胶电泳(2D-DIGE)第41页
        3.2.3 差异表达蛋白点的软件分析第41-46页
        3.2.4 差异表达蛋白点的质谱鉴定第46-50页
4 讨论与结论第50-61页
    4.1 板栗疫病菌线粒体提取条件的优化第50-51页
    4.2 差异表达蛋白质的功能分类第51-52页
    4.3 P5CDH显著下调可导致细胞处于异常的凋亡状态第52-55页
    4.4 低毒病毒侵染对氨基酸代谢途径的调控第55-57页
    4.5 低毒病毒侵染对真菌能量代谢途径的调控第57-58页
    4.6 低毒病毒侵染对板栗疫病菌产生综合影响第58-59页
    4.7 低毒病毒感染与板栗疫病菌线粒体机能障碍第59页
    4.8 结论第59-61页
参考文献第61-68页
附录第68-71页
致谢第71-72页
攻读学位期间发表论文情况第72页

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