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144份玉米自交系纹枯病抗性相关性状的关联分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
1 文献综述第11-35页
   ·玉米纹枯病第11-21页
     ·玉米纹枯病危害第11页
     ·玉米纹枯病病源学特征和发病症状第11-14页
       ·病菌分类第11-12页
       ·病菌侵染机制第12页
       ·玉米纹枯病发病症状第12-13页
       ·纹枯病鉴定方法第13-14页
         ·玉米纹枯病的接种方法第13页
         ·玉米纹枯病的分级第13-14页
         ·玉米纹枯病的抗性评价第14页
     ·玉米纹枯病的防治第14-17页
       ·鉴定,培育抗病资源第14页
       ·利用植物诱导抗性防治玉米纹枯病第14-15页
       ·利用拮抗微生物防治玉米纹枯病第15-17页
     ·纹枯病抗性QTL定位进展第17-21页
       ·玉米抗纹枯病QTL定位进展第17-18页
       ·其他作物抗纹枯病QTL研究进展第18-20页
       ·目前玉米纹枯病研究中存在的问题及展望第20-21页
   ·关联分析在玉米研究中的应用第21-33页
     ·单核苷酸多态性第21-24页
     ·连锁不平衡第24-28页
       ·连锁不平衡的定义第24页
       ·连锁不平衡的度量第24-25页
       ·影响LD的因素以及连锁不平衡的衰减第25-27页
       ·不同分子标记对LD估算的差异第27-28页
     ·关联分析的策略第28-29页
     ·关联分析的应用与发展第29-33页
   ·目的与意义第33-34页
   ·技术路线第34-35页
2 材料与方法第35-44页
   ·玉米供试材料第35-38页
   ·实验病菌第38页
   ·材料处理第38-44页
     ·基因型数据获得第38-40页
       ·DNA提取第38-39页
       ·SNP基因型分析第39-40页
     ·纹枯病菌培养第40页
     ·田间种植第40页
     ·纹枯病病菌田间接种第40页
     ·抗纹枯病相关性状收集第40页
     ·纹枯病抗性评价第40-41页
     ·遗传多样性和群体结构分析第41-42页
       ·遗传多样性分析第41-42页
       ·基于遗传距离的聚类分析第42页
       ·群体结构分析第42页
     ·SNP标记间及纹枯病相关性状的全基因组关联分析第42-43页
     ·关联SNP标记与已知玉米纹枯病抗性QTL比较分析第43-44页
3 结果与分析第44-75页
   ·自交系纹对枯病的抗性评价第44-48页
   ·SNP标记的分子特征第48-51页
   ·144个自交系的遗传结构及种质类群划分第51-53页
   ·144份玉米自交系的关联分析第53-72页
     ·全基因组SNP-性状关联第53-58页
     ·SNP-性状发掘序列功能比对分析第58-72页
   ·关联SNP标记与已知玉米纹枯病病抗性QTL比较分析第72-75页
4 讨论第75-88页
   ·玉米纹枯病抗性筛选第75-76页
     ·玉米纹枯病抗源鉴定第75页
     ·玉米纹枯病抗性鉴定第75-76页
   ·不同抗性评价指标的比较分析第76-77页
   ·SNP芯片在遗传多样性分析中的应用第77-78页
   ·供试玉米自交系群体的结构与遗传组成第78页
   ·SNP-QTL整合信息揭示的候选基因第78-81页
   ·关联SNP所揭示的抗病网络第81-88页
     ·玉米纹枯病诱导的信号传导第81-82页
     ·玉米纹枯病胁迫下的激素调控第82-83页
     ·玉米纹枯病胁迫下的细胞程序化死亡第83-86页
     ·纹枯病诱导下的玉米抗病机制第86-88页
5 结论第88-89页
参考文献第89-101页
附表第101-103页
 附表1 144份自交系群体类群划分第101-103页
附图第103-106页
致谢第106页

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