| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-25页 |
| 1.1 细菌抗药性 | 第12-19页 |
| 1.1.1 遗传学机制 | 第12页 |
| 1.1.2 生物化学机制 | 第12-19页 |
| 1.2 环境抗药性 | 第19-21页 |
| 1.3 抗药性动力学 | 第21-22页 |
| 1.4 粪菌移植与微生态体 | 第22-23页 |
| 1.5 肉鸡养殖业现状及克服抗药性的措施 | 第23-24页 |
| 1.6 本章研究思路与内容 | 第24-25页 |
| 第二章 大肠杆菌群体对抗生素MIC正态再分布研究 | 第25-36页 |
| 2.1 试验材料 | 第25-26页 |
| 2.1.1 试剂与培养基 | 第25-26页 |
| 2.1.2 仪器 | 第26页 |
| 2.2 试验方法 | 第26-28页 |
| 2.2.1 采集鸡粪 | 第26-27页 |
| 2.2.2 分离、鉴定大肠杆菌 | 第27页 |
| 2.2.3 差异分析设计 | 第27-28页 |
| 2.2.4 药物敏感性试验 | 第28页 |
| 2.3 结果与分析 | 第28-32页 |
| 2.3.1 SPF鸡与商品肉鸡大肠杆菌差异 | 第28页 |
| 2.3.2 鸡个体间差异 | 第28-29页 |
| 2.3.3 同一只鸡不同菌株差异 | 第29页 |
| 2.3.4 相同菌株的个体差异 | 第29-32页 |
| 2.3.5 抗生素诱导菌株的MIC分布差异 | 第32页 |
| 2.4 讨论与结论 | 第32-36页 |
| 2.4.1 讨论 | 第32-34页 |
| 2.4.2 结论 | 第34-36页 |
| 第三章 抗生素对SPF鸡肠道菌群的抗药性动力学 | 第36-53页 |
| 3.1 试验材料 | 第36-37页 |
| 3.1.1 试剂与培养基 | 第36页 |
| 3.1.2 仪器 | 第36页 |
| 3.1.3 试验动物 | 第36-37页 |
| 3.2 试验方法 | 第37-39页 |
| 3.2.1 动物分组与管理 | 第37页 |
| 3.2.2 SPF鸡粪采集 | 第37页 |
| 3.2.3 SPF鸡肠道大肠杆菌分离 | 第37页 |
| 3.2.4 接种物的获得 | 第37页 |
| 3.2.5 粪便总DNA提取 | 第37-38页 |
| 3.2.6 肠道菌群总DNA质量检测 | 第38页 |
| 3.2.7 肠道菌群多样性 | 第38页 |
| 3.2.8 粪样涂片 | 第38-39页 |
| 3.3 结果与分析 | 第39-45页 |
| 3.3.1 鸡粪形态记录 | 第39-40页 |
| 3.3.2 粪样涂片观察 | 第40-41页 |
| 3.3.3 基因组DNA质量 | 第41页 |
| 3.3.4 优化序列 | 第41-42页 |
| 3.3.5 稀释性曲线(Rarefaction curve)与Shannon-Wiener曲线 | 第42-43页 |
| 3.3.6 多样性指数(Alpha-diversity) | 第43页 |
| 3.3.7 基于UniFrac的Pcoa分析 | 第43-44页 |
| 3.3.8 样本聚类树与柱状图组合分析 | 第44-45页 |
| 3.3.9 大肠杆菌药敏试验结果 | 第45页 |
| 3.4 讨论与结论 | 第45-53页 |
| 3.4.1 讨论 | 第45-46页 |
| 3.4.2 结论 | 第46-53页 |
| 第四章 抗生素对SPF鸡血液生化和免疫指标的影响 | 第53-57页 |
| 4.1 试验材料 | 第53页 |
| 4.1.1 试剂与培养基 | 第53页 |
| 4.1.2 仪器 | 第53页 |
| 4.1.3 试验动物 | 第53页 |
| 4.2 试验方法 | 第53-54页 |
| 4.2.1 动物分组与管理 | 第53页 |
| 4.2.2 免疫器官生产发育情况的测定 | 第53页 |
| 4.2.3 IL-2,IL-4,IL-12和INF-γ的检测 | 第53-54页 |
| 4.2.4 全血生化检测和肾功能检测 | 第54页 |
| 4.3 结果与分析 | 第54-55页 |
| 4.3.1 免疫器官生产发育情况的测定 | 第54-55页 |
| 4.3.2 IL-2,IL-12和INF-γ的检测 | 第55页 |
| 4.3.3 全血生化检测和肾功能检测 | 第55页 |
| 4.4 讨论与结论 | 第55-57页 |
| 4.4.1 讨论 | 第55-56页 |
| 4.4.2 结论 | 第56-57页 |
| 第五章 孵化场微生物学背景与粪菌移植 | 第57-68页 |
| 5.1 试验材料 | 第57-58页 |
| 5.1.1 试剂与培养基 | 第57-58页 |
| 5.1.2 仪器 | 第58页 |
| 5.1.3 试验动物 | 第58页 |
| 5.2 试验方法 | 第58-60页 |
| 5.2.1 细菌分离 | 第58页 |
| 5.2.2 16S rDNA鉴定菌株 | 第58-59页 |
| 5.2.3 SPF鸡粪粪菌移植 | 第59页 |
| 5.2.4 SPF鸡粪粪菌移植抗药表型变化 | 第59-60页 |
| 5.3 结果与分析 | 第60-65页 |
| 5.3.1 细菌分离率 | 第60-64页 |
| 5.3.2 16S rDNA分析 | 第64页 |
| 5.3.3 粪菌移植后抗药表型 | 第64-65页 |
| 5.4 讨论与结论 | 第65-68页 |
| 5.4.1 讨论 | 第65-66页 |
| 5.4.2 结论 | 第66-68页 |
| 全文总结 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-75页 |
| 致谢 | 第75页 |
