首页--生物科学论文--微生物学论文

雄烯二酮生产菌耐底物及高产性的比较基因组学分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 前言第10-28页
    1.1 甾体类物质及甾药中间体第10-13页
        1.1.1 体类化合物第10-11页
        1.1.2 甾体类化合物的分类与生理功能第11-13页
    1.2 甾药中间体及其生物化学合成第13-14页
        1.2.1 甾体化合物的化学合成第14页
        1.2.2 甾体化合物的微生物转化第14页
    1.3 甾体微生物转化反应类型第14-18页
        1.3.1 微生物转化甾体化合物的位置及类型第15-16页
        1.3.2 几种重要的甾体微生物转化反应第16-18页
    1.4 微生物降解植物甾醇侧链制备AD第18-25页
        1.4.1 AD及植物甾醇简介第18-19页
        1.4.2 AD制备的途径与方法第19-20页
        1.4.3 微生物降解动物植物甾醇机理第20-23页
        1.4.4 微生物转化甾醇生成雄烯二酮的研究现状第23-25页
    1.5 高通量测序研究进展第25-26页
        1.5.1 第一代测序技术第25页
        1.5.2 第二代测序技术第25页
        1.5.3 第三代测序技术第25-26页
    1.6 本论文的研究目的和主要研究内容第26-28页
        1.6.1 研究背景第26-27页
        1.6.2 本研究主要内容第27-28页
第二章 Mycobacterium neoaurum MN2和MN4全基因组测序及初步分析第28-36页
    2.1 材料与方法第28-29页
        2.1.1 菌株第28页
        2.1.2 培养基和培养条件第28-29页
        2.1.3 主要试剂第29页
        2.1.4 主要实验仪器与设备第29页
    2.2 实验方法第29-31页
        2.2.1 新金分枝杆菌的培养与基因组DNA提取第29-30页
        2.2.2 基因组的文库构建与测序流程第30页
        2.2.3 基因组组装第30-31页
    2.3 结果与分析第31-34页
        2.3.1 基因组DNA的提取第31-32页
        2.3.2 基因组文库构建与测序结果第32-33页
        2.3.3 基因组组装结果第33-34页
    2.4 小结第34-36页
第三章 Mycobacterium neoaurum MN2和MN4比较基因组学分析第36-52页
    3.1 材料第36-37页
        3.1.1 主要分析的软件第36-37页
        3.1.2 主要使用的数据库第37页
    3.2 方法第37-39页
        3.2.1 基因组分析第37-38页
        3.2.2 重测序分析第38-39页
    3.3 结果与分析第39-50页
        3.3.1 基因组分析第39-46页
            3.3.1.1 基因组的基本特征第39-40页
            3.3.1.2 次级代谢基因簇分析第40-42页
            3.3.1.3 COG 注释及聚类分析第42-43页
            3.3.1.4 GO 功能注释分析第43-45页
            3.2.1.5 甾醇降解关键基因簇分析第45-46页
        3.3.2 重测序分析第46-50页
    3.4 讨论第50-52页
第四章 Mycobacterium neoaurum MN2和MN4比较转录组学分析第52-66页
    4.1 材料第52页
        4.1.1 实验菌株与培养第52页
    4.2 主要试剂与仪器第52-54页
        4.2.1 溶液配制第52页
        4.2.2 主要试剂第52-53页
        4.2.3 主要设备与仪器第53-54页
    4.3 实验方法第54-58页
        4.3.1 转化产物检测与分析第54页
        4.3.2 AD与的标准曲线与ADD的标准曲线第54-55页
        4.3.3 RNA的提取与检测第55-56页
        4.3.4 cDNA文库的构建及RNA-seq高通量测序第56页
        4.3.5 RNA-seq高通量测序原始数据的质控第56-57页
        4.3.6 表达差异基因分析第57-58页
    4.4 结果与分析第58-65页
        4.4.1 产物AD和ADD的HPLC检测第58-59页
        4.4.2 RNA-seq高通量测序结果的数据质控第59页
        4.4.3 表达差异分析第59-62页
        4.4.4 基因GO功能富集第62-64页
        4.4.5 KEGG pathway生物通路分析第64-65页
    4.5 小结第65-66页
第五章 结论与展望第66-68页
    5.1 结论第66-67页
    5.2 展望第67-68页
参考文献第68-76页
附录第76-80页
致谢第80-82页
在读期间公开发表论文(著)及科研情况第82页

论文共82页,点击 下载论文
上一篇:面向人体血流动力学数值模拟的高性能算法研究
下一篇:基于电场微生物群体刺激效应降解典型PPCPs类有机物的试验研究