藓类植物羽藓科及其相关科属分子系统学研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 略语表 | 第7-9页 |
| 1 前言 | 第9-20页 |
| 1.1 羽藓科及其相关科属的分类简史 | 第11-14页 |
| 1.1.1 经典藓类植物的分类简介 | 第11-12页 |
| 1.1.2 广义羽藓科的分类地位 | 第12页 |
| 1.1.3 羽藓科内属界限的争议 | 第12-13页 |
| 1.1.4 羽藓科和相近科属的界定 | 第13-14页 |
| 1.2 分子系统学 | 第14-17页 |
| 1.2.1 分子系统学概述 | 第14-16页 |
| 1.2.2 ITS序列在植物分子系统学的应用 | 第16-17页 |
| 1.3 系统发育数据分析方法 | 第17-20页 |
| 1.3.1 序列比对 | 第17-18页 |
| 1.3.2 建立取代模型 | 第18页 |
| 1.3.3 系统树构建方法 | 第18-19页 |
| 1.3.4 系统树的检验与评估 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-24页 |
| 2.1 实验材料 | 第20-21页 |
| 2.1.1 标本材料 | 第20页 |
| 2.1.2 试剂 | 第20-21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-24页 |
| 2.2.1 总DNA提取 | 第21页 |
| 2.2.2 ITS序列扩增引物 | 第21-22页 |
| 2.2.3 PCR扩增 | 第22页 |
| 2.2.4 PCR产物纯化及测序 | 第22-23页 |
| 2.2.5 序列拼接 | 第23页 |
| 2.2.6 数据处理和分析 | 第23-24页 |
| 3 结果与分析 | 第24-33页 |
| 3.1 DNA提取与PCR扩增 | 第24页 |
| 3.2 ITS片断测序 | 第24页 |
| 3.3 ITS序列 | 第24页 |
| 3.4 GenBank相关序列 | 第24页 |
| 3.5 系统分析 | 第24-33页 |
| 3.5.1 外类群的选择 | 第24-25页 |
| 3.5.2 最大简约(MP)系统树 | 第25页 |
| 3.5.3 邻接法(NJ)构建系统数 | 第25页 |
| 3.5.4 系统分析结果 | 第25-33页 |
| 4 讨论 | 第33-39页 |
| 4.1 标本材料的DNA提取 | 第33页 |
| 4.2 ITS在藓类植物系统学的研究价值 | 第33-34页 |
| 4.3 不同系统树构建方法对结果的影响 | 第34-35页 |
| 4.4 羽藓科及其相关科属系统发育关系的探讨 | 第35-39页 |
| 4.4.1 羽藓科的系统位置 | 第35-37页 |
| 4.4.2 羽藓科与相近科间的关系 | 第37-39页 |
| 5 结论 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 附录1 ITS序列对比 | 第47-67页 |
| 附录2 HKY85距离矩阵 | 第67-69页 |
| 附录3 测序报告 | 第69-97页 |
