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酿酒酵母异源戊糖转运蛋白的筛选及功能研究,酿酒酵母L-阿拉伯糖代谢途径的构建与优化

摘要第7-12页
ABSTRACT第12-18页
缩略符号表第19-21页
第一章 绪论第21-34页
    1.1 利用酿酒酵母进行木质纤维素原料乙醇生产的意义第21-22页
    1.2 酿酒酵母戊糖转运蛋白的研究进展第22-27页
        1.2.1 戊糖转运蛋白的类型第22-23页
        1.2.2 酿酒酵母木糖转运蛋白的研究第23-26页
        1.2.3 酿酒酵母L-阿拉伯糖转运蛋白的研究第26-27页
    1.3 酿酒酵母代谢L-阿拉伯糖生产乙醇的研究进展第27-32页
        1.3.1 真菌L-阿拉伯糖代谢途径的研究第28-29页
        1.3.2 细菌L-阿拉伯糖代谢途径的研究第29-31页
        1.3.3 葡萄糖、木糖和L-阿拉伯糖混糖代谢重组菌株的研究第31-32页
    1.4 本论文研究意义及主要内容第32-34页
第二章 材料与方法第34-43页
    2.1 材料第34-35页
        2.1.1 实验用到的酶和试剂第34页
        2.1.2 培养基第34-35页
    2.2 普通微生物学技术第35-36页
        2.2.1 菌体的生长第35页
        2.2.2 菌种的保存第35页
        2.2.3 酿酒酵母菌株的生长曲线测定第35-36页
        2.2.4 平板梯度生长实验第36页
    2.3 分子生物学方法第36-40页
        2.3.1 DNA的合成和序列测定第36页
        2.3.2 PCR反应和琼脂糖凝胶电泳第36页
        2.3.3 DNA纯化和浓度的测定第36页
        2.3.4 限制性核酸内切酶的酶切反应第36页
        2.3.5 质粒构建与大肠杆菌转化第36页
        2.3.6 大肠杆菌中质粒的提取第36-37页
        2.3.7 酿酒酵母LiAc完整细胞转化法第37页
        2.3.8 酿酒酵母染色体的提取第37页
        2.3.9 酿酒酵母质粒的提取第37页
        2.3.10 酿酒酵母总RNA的提取和cDNA的制备第37-38页
        2.3.11 实时荧光定量PCR第38页
        2.3.12 G418抗性筛选标记(KanMX4)的去除第38页
        2.3.13 定点突变第38-39页
        2.3.14 木糖苷酶的酶活测定第39页
        2.3.15 荧光显微图片第39-40页
    2.4 菌株代谢能力测试第40-41页
        2.4.1 高密度分批摇瓶培养第40页
        2.4.2 L-阿拉伯糖分批摇瓶培养和厌氧发酵罐培养第40-41页
        2.4.3 代谢产物分析第41页
    2.5 驯化培养第41页
    2.6 木糖和L-阿拉伯糖胞内积累量的测试第41-42页
    2.7 木糖质子同向型转运蛋白的检测第42页
    2.8 转运蛋白Mgt05196p的同源模建和木糖分子对接第42-43页
第三章 实验结果与讨论第43-113页
    第一部分 木糖转运蛋白高通量筛选方法的建立与应用第43-58页
        3.1 基于pNPX的木糖转运蛋白筛选模型的建立第46-55页
            3.1.1 木糖苷酶基因的克隆和表达载体的构建第46-48页
            3.1.2 木糖苷酶酶活的测定第48页
            3.1.3 全细胞测定条件下胞内外pNP含量的测定第48-50页
            3.1.4 木糖苷酶酶活与孵育时间的关系第50页
            3.1.5 pNPX与木糖、葡萄糖转运关系的测定第50-52页
            3.1.6 超表达转运蛋白AraEp、HXT7p和Gal2p对菌株转运能力的影响第52-55页
        3.2 AraEp突变子的高通量筛选第55-57页
        本部分小结第57-58页
    第二部分 异源戊糖转运蛋白的筛选与功能研究第58-100页
        3.3 葡萄糖和戊糖同步利用菌株的特性研究第72-74页
            3.3.1 T. cutaneum的糖同步代谢能力验证第72-73页
            3.3.2 M. guilliermondii的糖同步代谢能力验证第73-74页
        3.4 异源戊糖转运蛋白的克隆和表达第74-78页
        3.5 戊糖转运蛋白的进化树分析第78-80页
        3.6 转运蛋白的戊糖和己糖转运能力测试第80-82页
        3.7 木糖转运蛋白对hxt null木糖代谢菌株的木糖生长能力的影响第82-84页
        3.8 转运蛋白Mgt05196p的细胞膜定位第84-85页
        3.9 木糖转运蛋白类型的测定第85-86页
        3.10 Mgt05196p表达菌株的高密度摇瓶测试第86-89页
        3.11 转运蛋白Mgt05196p的木糖转运功能位点分析第89-97页
            3.11.1 Mgt05196p转运蛋白的同源模建和木糖分子对接第89-90页
            3.11.2 Mgt05196p糖转运相关保守氨基酸位点的选择第90页
            3.11.3 Mgt05196p上木糖转运活性位点的验证第90-97页
        本部分小结第97-100页
    第三部分 L-阿拉伯糖代谢途径的构建与优化第100-113页
        3.12 L-阿拉伯糖代谢菌株的获得第103-105页
        3.13 基因工程改造并结合适应性进化策略提高菌株的L-阿拉伯糖代谢能力第105-109页
        3.14 超表达内源转运蛋白Gal2p显著提高菌株的L-阿拉伯糖发酵能力第109-111页
        本部分小结第111-113页
全文总结与展望第113-116页
附录第116-126页
参考文献第126-135页
致谢第135-137页
攻读学位期间的学术成果第137-139页
附件第139-165页
学位论文评阅及答辩情况表第165页

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