| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-21页 |
| 1.1 鱼类肠道菌群的研究现状与进展 | 第10-14页 |
| 1.1.1 鱼类肠道菌群的数量及其组成 | 第10-11页 |
| 1.1.2 肠道菌群的作用 | 第11-13页 |
| 1.1.3 影响鱼类肠道菌群的因素 | 第13-14页 |
| 1.2 肠道微生物多样性的研究方法 | 第14-15页 |
| 1.2.1 传统方法在肠道微生物多样性研究中的应用 | 第14-15页 |
| 1.2.2 分子生物学方法在肠道微生物多样性研究中的应用 | 第15页 |
| 1.3 PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳) | 第15-19页 |
| 1.3.1 变性梯度凝胶电泳技术简介 | 第15-16页 |
| 1.3.2 变性梯度凝胶电泳技术基本原理 | 第16-17页 |
| 1.3.3 PCR-DGGE在菌群多样性研究中的应用 | 第17-18页 |
| 1.3.4 PCR-DGGE技术的优缺点与对策 | 第18-19页 |
| 1.4 本研究的立题背景及研究意义 | 第19-21页 |
| 第二章 不同饲喂模式下草鱼肠道菌群的PCR-DGGE分析 | 第21-48页 |
| 2.1 材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 饲喂模式与实验动物 | 第21-22页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第22页 |
| 2.2 方法 | 第22-33页 |
| 2.2.1 肠道样品的制备 | 第22-23页 |
| 2.2.1.1 肠道内容物的采集 | 第23页 |
| 2.2.1.2 肠道壁的采集 | 第23页 |
| 2.2.1.3 水样与底泥的采集 | 第23页 |
| 2.2.2 样品总DNA的提取 | 第23-27页 |
| 2.2.2.1 肠道细菌总DNA的提取 | 第23-24页 |
| 2.2.2.2 水样细菌总DNA的提取 | 第24-25页 |
| 2.2.2.3 底泥细菌总DNA的提取 | 第25-27页 |
| 2.2.3 细菌16S rDNA-V3片段的PCR扩增 | 第27-28页 |
| 2.2.4 DNA片段的纯化 | 第28-29页 |
| 2.2.5 变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第29-31页 |
| 2.2.5.1 DGGE分析中所用到的试剂配方 | 第29-30页 |
| 2.2.5.2 DGGE分析的实验步骤 | 第30-31页 |
| 2.2.6 优势条带的回收 | 第31页 |
| 2.2.7 优势条带的克隆与测序 | 第31-32页 |
| 2.2.7.1 优势条带DNA的PCR扩增 | 第31-32页 |
| 2.2.7.2 优势条带的克隆与测序 | 第32页 |
| 2.2.8 数据分析 | 第32-33页 |
| 2.2.9 构建系统发育树 | 第33页 |
| 2.3 结果与分析 | 第33-44页 |
| 2.3.1 微生物总DNA的提取 | 第33-34页 |
| 2.3.1.1 肠道细菌总DNA的提取 | 第33页 |
| 2.3.1.2 水样及底泥细菌总DNA的提取 | 第33-34页 |
| 2.3.2 细菌16S rDNA-V3片段的PCR扩增 | 第34-35页 |
| 2.3.2.1 肠道细菌16S rDNA-V3片段的PCR扩增 | 第34页 |
| 2.3.2.2 水样及底泥细菌16S rDNA-V3片段的PCR扩增 | 第34-35页 |
| 2.3.3 DGGE指纹图谱及肠道菌群群落差异 | 第35-40页 |
| 2.3.4 优势条带的克隆、测序及系统发育分析 | 第40-44页 |
| 2.4 讨论 | 第44-48页 |
| 2.4.1 PCR-DGGE技术可有效的研究肠道微生物区系 | 第44-45页 |
| 2.4.2 不同饲喂模式下草鱼肠道菌群结构的PCR-DGGE分析 | 第45-46页 |
| 2.4.3 水样和底泥微生物与草鱼肠道菌群的关系 | 第46页 |
| 2.4.4 投喂牧草可提高草鱼肠道菌的多样性 | 第46-47页 |
| 2.4.5 饲喂牧草的草鱼体内含分解消化纤维素的细菌 | 第47-48页 |
| 结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 作者简介 | 第58页 |
