| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-26页 |
| 1.1 膜蛋白的结构和分类 | 第10页 |
| 1.2 线粒体呼吸链复合物Ⅱ的研究概况 | 第10-22页 |
| 1.2.1 线粒体及线粒体呼吸链 | 第10-11页 |
| 1.2.2 线粒体呼吸链复合物Ⅱ的组成及生物学功能 | 第11-15页 |
| 1.2.3 线粒体呼吸链复合物Ⅱ的结构生物学研究 | 第15-19页 |
| 1.2.4 线粒体呼吸链复合物Ⅱ类杀菌剂的研究进展 | 第19-22页 |
| 1.3 理论研究方法 | 第22-25页 |
| 1.3.1 量子化学方法 | 第22页 |
| 1.3.2 分子对接方法 | 第22-23页 |
| 1.3.3 分子动力学方法 | 第23-24页 |
| 1.3.4 结合自由能计算 | 第24-25页 |
| 1.4 课题的提出和本文研究的内容 | 第25-26页 |
| 第二章 线粒体呼吸链复合物Ⅱ和抑制剂分子对接研究 | 第26-32页 |
| 2.1 前言 | 第26-27页 |
| 2.2 分子对接 | 第27-30页 |
| 2.3 MM/PBSA结合自由能的计算 | 第30-31页 |
| 2.4 本章小结 | 第31-32页 |
| 第三章 线粒体呼吸链复合物Ⅱ和抑制剂的膜动力学研究 | 第32-45页 |
| 3.1 前言 | 第32-33页 |
| 3.2 实验过程及计算方法 | 第33-35页 |
| 3.2.1 抑制剂小分子的预处理及其参数的计算 | 第33页 |
| 3.2.2 [Fe-S]cluster参数的计算 | 第33-34页 |
| 3.2.3 分子对接方法 | 第34-35页 |
| 3.3 联合原子力场中DPPC膜的优化 | 第35-36页 |
| 3.4 动力学模拟中参数的介绍 | 第36-38页 |
| 3.4.1 蛋白力场 | 第36页 |
| 3.4.2 水分子力场 | 第36页 |
| 3.4.3 简单点电荷力场 | 第36页 |
| 3.4.4 脂分子力场 | 第36-37页 |
| 3.4.5 分子动力学模拟中的系综 | 第37页 |
| 3.4.6 分子动力学-DPPC膜的优化 | 第37页 |
| 3.4.7 实验结果分析-DPPC膜的优化 | 第37-38页 |
| 3.5 分子动力学方法 | 第38-43页 |
| 3.5.1 分子动力学模拟 | 第39页 |
| 3.5.2 萎秀灵(Carboxin)动力学结果分析 | 第39-41页 |
| 3.5.3 噻呋酰胺(Thifluzamide)-动力学结果分析 | 第41-43页 |
| 3.6 MM/PBSA结合自由能计算 | 第43-44页 |
| 3.7 本章小节 | 第44-45页 |
| 全文总结 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-50页 |
| 致谢 | 第50页 |
