摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
第1章 绪论 | 第11-19页 |
1.1 课题的目的和意义 | 第11-13页 |
1.2 国内外研究现状 | 第13-15页 |
1.3 选择性剪接研究领域存在的主要问题 | 第15-16页 |
1.4 本文主要研究内容和章节安排 | 第16-19页 |
第2章 选择性剪接事件的数据处理 | 第19-31页 |
2.1 引言 | 第19页 |
2.2 选择性剪接事件概述 | 第19-24页 |
2.2.1 选择性剪接事件 | 第19-20页 |
2.2.2 选择性剪接事件基本形式 | 第20-22页 |
2.2.3 选择性剪接事件数据库 | 第22-24页 |
2.3 选择性剪接事件数据分析与处理方法 | 第24-26页 |
2.3.1 MISO数据库 | 第24页 |
2.3.2 UCSC Genome数据库 | 第24-25页 |
2.3.3 选择性剪接事件数据分析与处理模型设计 | 第25-26页 |
2.4 基于MISO的选择性剪接事件数据处理结果及分析 | 第26-30页 |
2.4.1 实验数据 | 第26-27页 |
2.4.2 选择性剪接事件数据处理结果及分析 | 第27-30页 |
2.5 本章小结 | 第30-31页 |
第3章 选择性剪接事件的基因功能分析 | 第31-43页 |
3.1 引言 | 第31页 |
3.2 基因概述 | 第31-35页 |
3.2.1 基因定义 | 第31-32页 |
3.2.2 基因功能 | 第32-33页 |
3.2.3 基因数据库 | 第33页 |
3.2.4 基于基因层面的选择性剪接事件作用原理 | 第33-35页 |
3.3 基于选择性剪接事件的基因功能分析模型的构建 | 第35-37页 |
3.3.1 富集分析 | 第36页 |
3.3.2 基于基因层面的选择性剪接事件分析模型的构建 | 第36-37页 |
3.4 选择性剪接事件基因功能分析结果 | 第37-42页 |
3.5 本章小结 | 第42-43页 |
第4章 选择性剪接事件中蛋白翻译模型的构建 | 第43-57页 |
4.1 引言 | 第43页 |
4.2 遗传信息的翻译过程概述 | 第43-45页 |
4.2.1 遗传信息的翻译过程 | 第43-44页 |
4.2.2 遗传密码表 | 第44-45页 |
4.3 常用的基因到氨基酸翻译软件分析 | 第45-49页 |
4.3.1 开放阅读框法 | 第45-47页 |
4.3.2 常用的翻译软件分析 | 第47-49页 |
4.4 选择性剪接事件中基因到氨基酸的翻译 | 第49-52页 |
4.4.1 基因序列数据的预处理 | 第49-50页 |
4.4.2 选择性剪接事件的翻译模型的构建 | 第50-51页 |
4.4.3 选择性剪接事件翻译模型的软件设计 | 第51-52页 |
4.5 选择性剪接事件基因到氨基酸的翻译结果 | 第52-55页 |
4.5.1 翻译结果对比 | 第53-54页 |
4.5.2 课题中翻译模型的翻译结果 | 第54-55页 |
4.6 本章小结 | 第55-57页 |
第5章 选择性剪接事件的蛋白结构预测 | 第57-65页 |
5.1 引言 | 第57页 |
5.2 蛋白质结构 | 第57-60页 |
5.2.1 蛋白质结构层次 | 第57-58页 |
5.2.2 蛋白质的无序结构 | 第58-59页 |
5.2.3 无序蛋白质的功能 | 第59-60页 |
5.3 基于VSL2预测选择性剪接事件中蛋白无序结构 | 第60-61页 |
5.3.1 VSL2无序蛋白预测模型原理 | 第60-61页 |
5.3.2 基于VSL2预测蛋白无序结构 | 第61页 |
5.4 选择性剪接事件中蛋白质结构预测结果及分析 | 第61-64页 |
5.5 本章小结 | 第64-65页 |
结论 | 第65-67页 |
参考文献 | 第67-73页 |
攻读硕士学位期间发表的论文和取得的科研成果 | 第73-75页 |
致谢 | 第75页 |