| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 1.前言 | 第11-25页 |
| 1.1 线虫的危害与生物防治方法 | 第11-12页 |
| 1.2 杀线虫细菌的类型、特点及机制 | 第12-15页 |
| 1.2.1 巴氏杆菌杀线虫特点及机制 | 第13页 |
| 1.2.2 芽孢杆菌属杀线虫特点及机制 | 第13-14页 |
| 1.2.3 假单胞菌杀线虫特点及机制 | 第14-15页 |
| 1.3 不动杆菌与秀丽隐杆线虫 | 第15-17页 |
| 1.3.1 秀丽隐杆线虫简介 | 第15-16页 |
| 1.3.2 不动杆菌属简介 | 第16页 |
| 1.3.3 不动杆菌属与线虫的关系 | 第16-17页 |
| 1.3.4 约氏不动杆菌MB44背景介绍 | 第17页 |
| 1.4 测序方法介绍 | 第17-21页 |
| 1.4.1 第一代测序 | 第18页 |
| 1.4.2 第二代测序 | 第18-20页 |
| 1.4.3 第三代测序 | 第20-21页 |
| 1.5 细菌基因组学研究 | 第21-23页 |
| 1.5.1 细菌比较基因组学简介 | 第22页 |
| 1.5.2 预测毒性蛋白基因软件MP3简介 | 第22-23页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第23-25页 |
| 2.材料与方法 | 第25-36页 |
| 2.1 实验材料 | 第25-28页 |
| 2.1.1 菌株 | 第25页 |
| 2.1.2 线虫 | 第25页 |
| 2.1.3 培养基 | 第25页 |
| 2.1.4 实验所用试剂 | 第25-27页 |
| 2.1.5 实验主要仪器 | 第27-28页 |
| 2.2 实验方法 | 第28-36页 |
| 2.2.1 细菌革兰氏染色 | 第28页 |
| 2.2.2 细菌扫描电镜观察 | 第28-29页 |
| 2.2.3 细菌生长曲线测定方法 | 第29页 |
| 2.2.4 系统进化树构建 | 第29-31页 |
| 2.2.5 MB44发酵上清液粗蛋白的提取与浓度测定 | 第31-32页 |
| 2.2.6 秀丽隐杆线虫生测实验 | 第32-33页 |
| 2.2.7 MB44基因组测序与分析方法 | 第33-36页 |
| 3.结果与分析 | 第36-60页 |
| 3.1 MB44的形态特征和生理生化特性 | 第36-38页 |
| 3.1.1 MB44的形态特征 | 第36-37页 |
| 3.1.2 MB44的生理生化特征 | 第37-38页 |
| 3.2 MB44的 16S rDNA的测序与系统进化树的构建 | 第38-40页 |
| 3.2.1 MB44的 16S rDNA的扩增和测序 | 第38-39页 |
| 3.2.2 MB44的系统进化树的构建 | 第39-40页 |
| 3.3 约氏不动杆菌MB44的生长曲线 | 第40-41页 |
| 3.4 约氏不动杆菌MB44的杀线虫活性 | 第41-45页 |
| 3.4.1 MB44菌体杀线虫活性 | 第41-43页 |
| 3.4.2 MB44发酵液上清粗蛋白杀线虫活性 | 第43-45页 |
| 3.5 MB44基因组分析 | 第45-51页 |
| 3.5.1 MB44基因组基本组分 | 第45-46页 |
| 3.5.2 MB44基因注释 | 第46-49页 |
| 3.5.3 MB44基因组岛分析 | 第49-51页 |
| 3.6 MB44比较基因组分析 | 第51-54页 |
| 3.7 MB44的毒性蛋白基因预测与分析 | 第54-56页 |
| 3.7.1 MP3预测MB44毒性蛋白基因 | 第54-55页 |
| 3.7.2 预测的毒性蛋白同源性分析 | 第55-56页 |
| 3.8 铁载体合成和转运相关基因 | 第56-58页 |
| 3.9 荚膜多糖基因簇分析 | 第58-60页 |
| 4.总结与讨论 | 第60-63页 |
| 4.1 总结 | 第60-62页 |
| 4.2 讨论 | 第62-63页 |
| 5.展望 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 附录一 | 第72-73页 |
| 附录二 | 第73-77页 |
