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亚洲玉米螟几丁质酶的晶体结构与抑制剂设计

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-9页
1 绪论第21-43页
    1.1 糖基水解酶18家族几丁质酶第22-33页
        1.1.1 GH18家族几丁质酶的分布与功能第22-25页
        1.1.2 GH18家族几丁质酶结构与功能关系第25-30页
        1.1.3 GH18家族几丁质酶的催化机理第30-33页
    1.2 GH18家族几丁质酶抑制剂第33-41页
        1.2.1 Allosamidin第33-34页
        1.2.2 Argifm和argadin第34-37页
        1.2.3 甲基黄嘌呤衍生物第37-39页
        1.2.4 其他抑制剂第39-41页
    1.3 本论文的选题依据和研究策略第41-43页
        1.3.1 选题依据第41页
        1.3.2 研究策略第41-43页
2 OfChtI-CAD的重组表达与纯化第43-51页
    2.1 引言第43页
    2.2 实验材料与方法第43-46页
        2.2.1 OfChtI蛋白稳定性的检测第43页
        2.2.2 蛋白序列分析与催化域位置的确定第43-44页
        2.2.3 OfChtI-CAD的基因克隆第44-45页
        2.2.4 两种OfChtI-CAD蛋白的诱导表达第45页
        2.2.5 两种OfChtI-CAD蛋白的分离纯化第45-46页
        2.2.6 OfChtI-CAD蛋白纯度的HPLC检测第46页
    2.3 实验结果第46-49页
        2.3.1 OfChtI蛋白稳定性的研究第46页
        2.3.2 OfChtI蛋白序列分析与催化域位置的确定第46-48页
        2.3.3 两种OfChtI-CAD蛋白的获得第48页
        2.3.4 HPLC检测OfhtI-CAD_(19-407)蛋白的纯度第48-49页
    2.4 分析讨论第49-50页
    2.5 小结第50-51页
3 OfChtI-CAD晶体结构的研究第51-66页
    3.1 引言第51页
    3.2 实验材料与方法第51-54页
        3.2.1 OflChtI-CAD结晶条件的筛选第51-52页
        3.2.2 X-射线衍射数据收集第52页
        3.2.3 OfChtI-CAD晶体结构解析第52页
        3.2.4 OfChtI-CAD与其他几丁质酶的蛋白结构比对第52页
        3.2.5 OfChtI-CAD突变体的克隆、表达与纯化第52-53页
        3.2.6 酶学活性测定方法第53-54页
        3.2.7 几丁质结合测定方法第54页
    3.3 实验结果第54-63页
        3.3.1 OfChtI-CAD晶体生长、衍射数据收集和结构解析第54-56页
        3.3.2 OfChtI-CAD的整体结构分析第56-57页
        3.3.3 OfChtI-CAD的底物结合裂缝第57-58页
        3.3.4 OfChtI-CAD与其他GH18几丁质酶催化域的结构比较第58-60页
        3.3.5 Phe159、Phe194、Trp241和Tyr290对几丁质结合的作用第60-63页
    3.4 分析讨论第63-65页
    3.5 小结第65-66页
4 OfChtI-CAD与寡糖底物结合的热力学和晶体学分析第66-81页
    4.1 引言第66页
    4.2 实验材料与方法第66-69页
        4.2.1 OfChtI-CAD突变体E148Q和E148A的克隆、表达与纯化第66-67页
        4.2.2 OfChtI-CAD及突变体与底物的复合物晶体的制备第67-68页
        4.2.3 X射线衍射数据收集和结构解析第68页
        4.2.4 等温量热滴定实验测定OfChtI-CAD对寡糖底物的结合能力第68-69页
    4.3 实验结果第69-77页
        4.3.1 寡糖底物与OfChtI-CAD结合的热力学分析第69-72页
        4.3.2 OfChtI-CAD与寡糖底物复合物晶体的结构分析第72-77页
    4.4 分析讨论第77-79页
        4.4.1 OfChtI-CAD的底物结合位点分析第77-78页
        4.4.2 OfChtI-CAD具有内切酶的性质第78-79页
    4.5 小结第79-81页
5 寡聚葡萄糖胺作为18家族几丁质酶抑制剂的研究第81-106页
    5.1 引言第81-82页
    5.2 实验材料与方法第82-85页
        5.2.1 寡聚葡萄糖胺的来源第82页
        5.2.2 四种几丁质酶的克隆、表达与纯化第82-84页
        5.2.3 与寡聚葡萄糖胺结合相关的氨基酸残基的定点突变第84页
        5.2.4 寡聚葡萄糖胺对几丁质酶的抑制活性测定第84页
        5.2.5 等温量热滴定实验测定OfChtI与寡聚葡萄糖胺的结合能力第84-85页
        5.2.6 蛋白结晶和数据采集第85页
        5.2.7 寡聚葡萄糖胺抑制剂在昆虫体内的生物学评价第85页
    5.3 实验结果第85-100页
        5.3.1 四种几丁质酶的表达与纯化第85-86页
        5.3.2 寡聚葡萄糖胺对几丁质酶的抑制活性第86-89页
        5.3.3 寡聚葡萄糖胺对昆虫生长发育的影响第89-90页
        5.3.4 寡聚葡萄糖胺与OfChtI结合的热力学分析第90-94页
        5.3.5 寡聚葡萄糖胺与OfChtI-CAD的复合物晶体结构分析第94-97页
        5.3.6 催化氨基酸残基Glu148对抑制剂结合的作用第97-98页
        5.3.7 氨基酸残基Phe309和Trp372对底物和抑制剂结合的作用第98-99页
        5.3.8 OfChtI中-5结合位点的推测第99-100页
    5.4 分析讨论第100-104页
        5.4.1 寡聚葡萄糖胺结合模式的分析及抑制机理的提出第100-102页
        5.4.2 GlcN的乙酰化影响-2位点的结合亲和力第102页
        5.4.3 昆虫、人和细菌几丁质酶的结构差异第102页
        5.4.4 寡聚葡萄糖胺体内活性评价的分析第102-104页
    5.5 小结第104-106页
6 结论与展望第106-109页
    6.1 本文的结论第106-107页
    6.2 创新点摘要第107页
    6.3 未来工作设想第107-109页
参考文献第109-118页
附录A (GlcNAc)_(3-6)的高效液相色谱分析谱图和质谱谱图第118-119页
附录B (GlcN)_(2-7)的高效液相色谱分析谱图和质谱谱图第119-122页
作者简介第122页
攻读博士学位期间科研项目及科研成果第122-124页
致谢第124页

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