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Rubrolone生物合成途径的相关研究

中文摘要第2-3页
Abstract第3页
中文文摘第4-7页
目录第7-11页
绪论第11-25页
    1 环庚三烯酚酮(tropolone)类化合物的研究进展第11-22页
        1.1 天然的环庚三烯酚酮第12-15页
            1.1.1 只有一个环庚三烯酚酮环的化合物第12-13页
            1.1.2 具有复杂多环的环庚三烯酚酮类化合物第13页
            1.1.3 含有氮元素的环庚三烯酚酮类化合物第13-15页
        1.2 环庚三烯酚酮类化合物的生物活性第15-18页
            1.2.1 抑菌作用第16页
            1.2.2 酶抑制剂第16-17页
            1.2.3 抗肿瘤活性第17-18页
        1.3 环庚三烯酚酮类化合物结构与功能的关系第18-19页
        1.4 环庚三烯酚酮类化合物的合成第19-22页
            1.4.1 化学合成第19-20页
            1.4.2 生物合成途径第20-22页
    2 rubrolone简介第22-24页
        2.1 rubrolone的发现第22页
        2.2 rubrolone的化学结构特征第22-23页
        2.3 rubrolone的理化特征第23页
        2.4 rubrolone的研究意义第23-24页
    3 本课题的研究内容与目标第24-25页
第一章 链霉菌Streptomyces echinoruber sp.nov的发酵及其代谢产物的分离纯化第25-39页
    第一节 材料与方法第25-30页
        1.1 实验材料第25-26页
            1.1.1 培养基第25页
            1.1.2 化学试剂第25-26页
            1.1.3 实验菌株第26页
            1.1.4 16S rRNA通用引物第26页
        1.2 实验方法第26-30页
            1.2.1 真空冷冻干燥链霉菌菌种的恢复培养第26-27页
            1.2.2 小量提取链霉菌的总DNA第27页
            1.2.3 琼脂糖凝胶DNA片段的回收第27-28页
            1.2.4 链霉菌及大肠杆菌的短期保藏方法第28页
            1.2.5 大肠杆菌感受态的制备第28-29页
            1.2.6 质粒转化大肠杆菌第29页
            1.2.7 大肠杆菌质粒的提取第29-30页
    第二节 实验内容第30-32页
        2.1 菌株鉴定第30页
        2.2 固体发酵链霉菌第30页
        2.3 液体发酵链霉菌第30-31页
        2.4 对发酵产物的分离纯化第31-32页
        2.5 LC-MS(液质联用)检测第32页
    第三节 实验结果与分析第32-38页
        3.1 菌株鉴定第32-34页
        3.2 固体发酵产物的检测与分析第34-36页
            3.2.1 固体发酵第34-35页
            3.2.2 分离纯化第35页
            3.2.3 LC-MS(液质联用)检测第35-36页
        3.3 液体发酵产物的结果与分析第36-38页
    第四节 小结第38-39页
第二章 rubrolone生物合成基因簇的挖掘第39-73页
    第一节 实验材料第39-42页
        1.1 培养基第39页
        1.2 化学试剂第39-40页
        1.3 实验菌株第40-41页
        1.4 本实验使用的主要仪器第41页
        1.5 本实验所用的PCR引物第41-42页
    第二节 实验方法第42-55页
        2.1 构建基因组文库第42-47页
            2.1.1 发酵链霉菌第42页
            2.1.2 提取基因组第42-43页
            2.1.3 基因组的片段化第43页
            2.1.4 割胶回收第43-44页
            2.1.5 载体DNA的制备第44-45页
            2.1.6 体外连接和包装第45-46页
            2.1.7 感受态细胞的准备第46页
            2.1.8 滴度测定第46-47页
            2.1.9 fosmid文库涂布第47页
        2.2 筛选基因组文库第47-49页
            2.2.1 逐板筛选第47-48页
            2.2.2 逐行筛选第48页
            2.2.3 逐个筛选第48页
            2.2.4 筛选的cosmid归类第48-49页
        2.3 异源表达第49-51页
            2.3.1 制备原生质体第49-50页
            2.3.2 原生质体转化第50-51页
            2.3.3 转化子产物的处理第51页
        2.4 基因敲除第51-55页
            2.4.1 敲除载体的构建第51-53页
            2.4.2 接合转移第53-55页
    第三节 实验结果与分析第55-72页
        3.1 基因文库的构建第55-57页
            3.1.1 基因组的提取结果第55页
            3.1.2 基因组片段化的结果第55-56页
            3.1.3 割胶回收的结果第56-57页
            3.1.4 滴度测定结果第57页
        3.2 基因文库的筛选第57-67页
            3.2.1 逐板筛选的结果第59-60页
            3.2.2 逐行筛选的结果第60-62页
            3.2.3 逐个筛选的结果第62-66页
            3.2.4 cosmid分类结果第66-67页
        3.3 异源表达第67-68页
            3.3.1 异源表达结果与分析第67-68页
            3.3.2 LC-MS检测结果与分析第68页
        3.4 基因敲除第68-72页
            3.4.1 敲除载体的构建第68-71页
            3.4.2 接合转移第71-72页
    第四节 小结第72-73页
第三章 链霉菌Streptomyces echinoruber sp.nov基因组序列分析第73-87页
    第一节 基因组测序及orf预测第73-82页
    第二节 几个重要基因的生物信息学分析第82-87页
        2.1 orf33的分析第83-84页
        2.2 orf35的分析第84-87页
第四章 总结与展望第87-89页
    第一节 总结第87页
    第二节 展望第87-89页
附录1第89-99页
附录2第99-101页
参考文献第101-107页
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果第107-109页
致谢第109-111页
个人简历第111-112页

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