基于分子网络的疾病演化分析
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 缩略语对照表 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-18页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第14-15页 |
| 1.2 研究现状 | 第15-16页 |
| 1.3 本文工作及组织结构 | 第16-18页 |
| 第二章 相关理论基础 | 第18-26页 |
| 2.1 复杂网络分析 | 第18-23页 |
| 2.1.1 复杂网络概述 | 第18-19页 |
| 2.1.2 中心性分析 | 第19页 |
| 2.1.3 模块分析 | 第19-20页 |
| 2.1.4 动态网络演化分析简介 | 第20-23页 |
| 2.2 相关生物数据 | 第23-25页 |
| 2.2.1 蛋白质相互作用网络 | 第23页 |
| 2.2.2 基因表达数据 | 第23-25页 |
| 2.2.3 生物通路数据 | 第25页 |
| 2.3 本章小结 | 第25-26页 |
| 第三章 分子网络演化分析及疾病基因预测 | 第26-38页 |
| 3.1 方法概述 | 第26页 |
| 3.2 疾病基因收集和疾病网络构建 | 第26-28页 |
| 3.2.1 已知疾病基因集合收集 | 第26-27页 |
| 3.2.2 疾病基因网络构建 | 第27-28页 |
| 3.3 疾病基因模块的识别 | 第28-31页 |
| 3.3.1 MCL算法简介 | 第28-30页 |
| 3.3.2 模块识别 | 第30-31页 |
| 3.4 演化分析 | 第31-37页 |
| 3.4.1 重要基因在动态网络上的演化分析 | 第31-32页 |
| 3.4.2 生物通路在动态网络上的演化分析 | 第32-33页 |
| 3.4.3 功能模块在动态网络上的演化分析 | 第33-36页 |
| 3.4.4 总体演化规律分析 | 第36-37页 |
| 3.5 疾病基因预测 | 第37页 |
| 3.5.1 基因得分算法 | 第37页 |
| 3.5.2 疾病基因预测 | 第37页 |
| 3.6 本章小结 | 第37-38页 |
| 第四章 实验结果与分析 | 第38-64页 |
| 4.1 实验数据说明和疾病网络构建 | 第38-41页 |
| 4.1.1 已知疾病基因 | 第38页 |
| 4.1.2 疾病基因网络 | 第38-41页 |
| 4.2 演化分析结果验证 | 第41-56页 |
| 4.2.1 重要基因的演化结果分析 | 第41-44页 |
| 4.2.2 生物通路的演化结果分析 | 第44-48页 |
| 4.2.3 功能模块的演化结果分析 | 第48-55页 |
| 4.2.4 总体演化结果分析 | 第55-56页 |
| 4.3 疾病基因的验证与分析 | 第56-63页 |
| 4.3.1 统计方法分析 | 第56-57页 |
| 4.3.2 生物意义分析 | 第57-61页 |
| 4.3.3 分类性能分析 | 第61-63页 |
| 4.4 本章小结 | 第63-64页 |
| 第五章 总结与展望 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-70页 |
| 致谢 | 第70-72页 |
| 作者简介 | 第72-73页 |
