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天女木兰种子萌发过程microRNA挖掘及其表达

摘要第9-10页
Abstract第10-11页
第一章 前言第12-21页
    1.1 植物microRNA的形成及调控机制第12-13页
    1.2 种子发育中microRNA的作用第13-15页
        1.2.1 种胚发育中microRNA的调控作用第13-14页
        1.2.2 胚乳发育中microRNA的调控作用第14-15页
        1.2.3 种皮发育中microRNA的调控作用第15页
        1.2.4 储藏物质积累中microRNA的调控作用第15页
    1.3 种子休眠与萌发中microRNA的调控作用第15-17页
        1.3.1 microRNA参与植物激素信号传导调控第15-16页
        1.3.2 microRNA参与其它关键转录因子调控第16-17页
        1.3.3 microRNA介导的胁迫响应及各种环境因子诱导的表达调控第17页
    1.4 植物RNA的提取第17-18页
    1.5 内参基因筛选第18-19页
    1.6 本研究目的意义第19-21页
第二章 天女木兰种子总RNA提取方法的建立与优化第21-30页
    2.1 试验材料与样品制备第21页
        2.1.1 植物材料第21页
        2.1.2 主要试剂第21页
        2.1.3 RNase的去除第21页
    2.2 RNA提取方法第21-23页
    2.3 总RNA质量检测第23页
    2.4 PCR检测第23-24页
        2.4.1 逆转录(RT-PCR)体系第23页
        2.4.2 PCR扩增体系第23-24页
    2.5 结果与分析第24-28页
        2.5.1 不同方法提取的总RNA质量分析第24-25页
        2.5.2 改良TRIzol法的优化第25页
        2.5.3 PCR质量检测第25-26页
        2.5.4 天女木兰其它组织总RNA提取效果比较第26-28页
    2.6 讨论第28-29页
    2.7 小结第29-30页
第三章 基于转录组数据的天女木兰内参基因筛选第30-37页
    3.1 试验材料及样品制备第30页
    3.2 试验方法第30-31页
        3.2.1 候选内参基因的筛选第30页
        3.2.2 RNA提取及cDNA合成第30页
        3.2.3 PCR引物设计第30页
        3.2.4 内参基因qRT-PCR第30-31页
        3.2.5 引物扩增效率计算第31页
        3.2.6 内参基因表达稳定性评价第31页
    3.3 结果与分析第31-35页
        3.3.1 候选内参基因筛选第31页
        3.3.2 候选内参基因扩增特异性及效率分析第31-32页
        3.3.3 候选内参基因表达水平分析第32-33页
        3.3.4 候选内参基因表达稳定性分析第33-34页
        3.3.5 候选内参基因表达稳定性综合评价第34-35页
    3.4 讨论第35-36页
    3.5 小结第36-37页
第四章 天女木兰种子microRNA鉴定及萌发过程中表达模式分析第37-59页
    4.1 试验材料与样品制备第37页
    4.2 试验方法第37-38页
        4.2.1 总RNA提取及sRNA文库构建第37页
        4.2.2 sRNA分析与microRNA预测第37页
        4.2.3 microRNA靶基因的预测及功能注释第37-38页
        4.2.4 microRNA差异表达分析第38页
        4.2.5 qRT-PCR及qPCR分析靶基因表达第38页
    4.3 结果与分析第38-56页
        4.3.1 sRNA文库序列分析第38-39页
        4.3.2 microRNA的鉴定及序列特征第39-41页
        4.3.3 天女木兰种子保守microRNA的鉴定及特征第41-42页
        4.3.4 天女木兰种子新的microRNA鉴定及特征第42页
        4.3.5 天女木兰种子萌发过程中microRNA差异表达分析第42-46页
        4.3.6 microRNA靶基因预测及注释第46-49页
        4.3.7 microRNA及其靶基因表达分析第49-56页
    4.4 讨论第56-57页
    4.5 小结第57-59页
第五章 结论第59-61页
参考文献第61-69页
附录第69-79页
致谢第79-80页
攻读硕士期间发表论文第80-81页

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