| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 一 引言 | 第11-18页 |
| 1.1 甜瓜 | 第11页 |
| 1.2 乙烯的生物合成与转录调控 | 第11-14页 |
| 1.3 乙烯的信号转导 | 第14页 |
| 1.4 乙烯与肉质果实成熟 | 第14-16页 |
| 1.5 高通量测序与生物信息学 | 第16页 |
| 1.6 部分生物信息学数据库与工具 | 第16-18页 |
| 1.6.1 MELONOMICS数据库 | 第16页 |
| 1.6.2 InterPro数据库 | 第16-17页 |
| 1.6.3 R语言 | 第17页 |
| 1.6.4 基因本体 | 第17-18页 |
| 二 材料与方法 | 第18-25页 |
| 2.1 植物材料与试剂 | 第18-19页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第18-19页 |
| 2.1.2 试剂 | 第19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-25页 |
| 2.2.1 M9品系与原种河套蜜瓜的转录组测序 | 第19-20页 |
| 2.2.1.1 样品总RNA的提取 | 第19页 |
| 2.2.1.2 总RNA样品检测 | 第19-20页 |
| 2.2.1.3 测序文库的构建 | 第20页 |
| 2.2.1.4 转录组生物信息学分析 | 第20页 |
| 2.2.2 部分乙烯合成转录调控与信号通路关键基因的鉴定与转录组分析 | 第20-23页 |
| 2.2.2.1 乙烯信号通路关键基因家族的全基因组鉴定 | 第21-22页 |
| 2.2.2.2 基于转录组和R语言的基因表达水平分析 | 第22-23页 |
| 2.2.3 果实发育过程中的GO富集分析 | 第23-24页 |
| 2.2.4 基于Log2Foldchange差值的转录组筛选 | 第24-25页 |
| 三 实验结果 | 第25-50页 |
| 3.1 转录组测序结果与质量报告 | 第25-29页 |
| 3.1.1 总RNA样本提取质量检测 | 第25页 |
| 3.1.2 转录组测序质量报告 | 第25-27页 |
| 3.1.3 差异基因表达分析 | 第27-29页 |
| 3.2 部分乙烯合成调控与信号通路关键基因的转录组分析 | 第29-35页 |
| 3.3 甜瓜果实发育过程中的GO富集分析 | 第35-48页 |
| 3.3.1 生物学过程 | 第43页 |
| 3.3.2 细胞组分 | 第43页 |
| 3.3.3 分子功能 | 第43-48页 |
| 3.4 基于Log2Foldchange的转录组分析 | 第48-50页 |
| 四 讨论 | 第50-53页 |
| 4.1 部分乙烯合成调控与信号通路关键基因的转录组分析 | 第50页 |
| 4.2 基于基因本体富集的转录组对比分析 | 第50-51页 |
| 4.3 基于Log2Foldechange差值的转录组筛选 | 第51-53页 |
| 五 结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-58页 |
| 附录 | 第58-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
