| 摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 第一章 药物吸收、分布、代谢、排泄及毒性性质的计算预测研究进展 | 第14-44页 |
| 1.1 引言 | 第14-15页 |
| 1.2 化合物ADME/T相关性质的预测模型 | 第15-30页 |
| 1.2.1 吸收 | 第15-18页 |
| 1.2.2 分布 | 第18-22页 |
| 1.2.3 代谢 | 第22-26页 |
| 1.2.4 排泄 | 第26-28页 |
| 1.2.5 毒性 | 第28-29页 |
| 1.2.6 转运体的计算预测 | 第29-30页 |
| 1.3 ADME/T预测软件及工具 | 第30-34页 |
| 1.4 小结与论文安排 | 第34-37页 |
| 参考文献 | 第37-44页 |
| 第二章 人醛基氧化酶 1（h AOX1）代谢位点预测模型的发展 | 第44-64页 |
| 2.1 引言 | 第44-47页 |
| 2.2 材料与方法 | 第47-51页 |
| 2.2.1 潜在代谢位点（SOM）及四面体中间体（TI）的定义 | 第47-48页 |
| 2.2.2 数据集 | 第48页 |
| 2.2.3 ΔEinter的计算 | 第48页 |
| 2.2.4 Stericdistance的计算 | 第48-49页 |
| 2.2.5 预测模型的发展 | 第49页 |
| 2.2.6 实验部分 | 第49-51页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第51-60页 |
| 2.3.1 AOX1代谢位点预测决策树模型 | 第51-54页 |
| 2.3.2 DTAOX1对多代谢位点底物的预测 | 第54-56页 |
| 2.3.3 代谢选择性 | 第56-57页 |
| 2.3.4 利用DTAOX1虚拟筛选AOX1底物 | 第57-60页 |
| 2.4 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-64页 |
| 第三章 有机阳离子转运体（OCT2）抑制剂组合药效团模型 | 第64-82页 |
| 3.1 引言 | 第64-66页 |
| 3.2 材料与方法 | 第66-68页 |
| 3.2.1 数据集收集及处理 | 第66页 |
| 3.2.2 药效团假设的生成 | 第66-67页 |
| 3.2.3 组合药效团模型的构建 | 第67-68页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第68-76页 |
| 3.3.1 OCT2组合药效团的预测性能及药效特征分析 | 第68-72页 |
| 3.3.2 抑制率与所匹配药效团假设数目之间的关系 | 第72页 |
| 3.3.3 药效团假设与抑制机制 | 第72-75页 |
| 3.3.4 OCT2多重抑制机制的理论模型 | 第75-76页 |
| 3.4 结论 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-82页 |
| 第四章 多药和毒物外排转运体 1（MATE1）抑制剂组合药效团模型 | 第82-102页 |
| 4.1 引言 | 第82-83页 |
| 4.2 材料与方法 | 第83-85页 |
| 4.2.1 数据收集及处理 | 第83-84页 |
| 4.2.2 组合药效团模型的建立 | 第84页 |
| 4.2.3 MATE1同源模型的建立 | 第84-85页 |
| 4.2.4 分子对接 | 第85页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第85-98页 |
| 4.3.1 MATE1组合药效团的预测性能 | 第85-87页 |
| 4.3.2 组成CP模型药效团假设的进一步分析 | 第87-90页 |
| 4.3.3 MATE1抑制剂与OCT2抑制剂药效特征的比较 | 第90-91页 |
| 4.3.4 匹配不同药效团的MATE1抑制剂的分子对接 | 第91-97页 |
| 4.3.5 MATE1多重抑制机制的理论模型 | 第97-98页 |
| 4.4 结论 | 第98-100页 |
| 参考文献 | 第100-102页 |
| 第五章 menin-MLL相互作用界面先导化合物的发现 | 第102-116页 |
| 5.1 引言 | 第102-104页 |
| 5.2 材料和方法 | 第104-107页 |
| 5.2.1 配体数据集 | 第104-105页 |
| 5.2.2 基于受体结构的方法：靶向menin-MLL作用界面的分子对接 | 第105页 |
| 5.2.3 基于配体结构的方法：menin-MLL抑制剂的定量药效团模型 | 第105-106页 |
| 5.2.4 menin蛋白的表达及纯化 | 第106页 |
| 5.2.5 荧光偏振实验 | 第106页 |
| 5.2.6 蛋白热稳定性实验 | 第106页 |
| 5.2.7 细胞存活率实验 | 第106-107页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第107-113页 |
| 5.3.1 靶向menin-MLL作用界面的分子对接 | 第107-108页 |
| 5.3.2 menin-MLL抑制剂 3D-QSAR模型 | 第108-109页 |
| 5.3.3 menin-MLL相互作用界面小分子抑制剂的虚拟筛选 | 第109-113页 |
| 5.4 结论 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-116页 |
| 作者简历 | 第116页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第116-118页 |
| 附录 | 第118-122页 |
| 致谢 | 第122-124页 |
