| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 靶向抗癌药物的研究进展 | 第12-28页 |
| 1.1 癌症的引发 | 第12-13页 |
| 1.2 抗癌作用靶点 | 第13-18页 |
| 1.2.1 受体酪蛋白激酶(RTK) | 第14-16页 |
| 1.2.2 Ser/Thr蛋白激酶(STK) | 第16-18页 |
| 1.3 靶向抗癌药物 | 第18-22页 |
| 1.3.1 靶向抗癌药物的分类 | 第18-20页 |
| 1.3.2 靶向抗癌药物的现状 | 第20-22页 |
| 1.4 基于计算模拟的靶向抗癌药物分子设计 | 第22-23页 |
| 1.5 本文主要研究工作 | 第23-24页 |
| 参考文献 | 第24-28页 |
| 第二章 Chk1与三唑酮抑制剂作用机理的计算研究 | 第28-49页 |
| 2.1 研究背景 | 第28-29页 |
| 2.2 材料与方法 | 第29-32页 |
| 2.2.1 生物数据集 | 第29-30页 |
| 2.2.2 蛋白质预处理 | 第30页 |
| 2.2.3 配体预处理 | 第30页 |
| 2.2.4 分子对接 | 第30-31页 |
| 2.2.5 分子动力学研究 | 第31页 |
| 2.2.6 结合自由能计算 | 第31-32页 |
| 2.2.7 结合自由能分解 | 第32页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第32-43页 |
| 2.3.1 分子对接结果的评估 | 第32-33页 |
| 2.3.2 Chk1活性位点中的抑制剂的初始构型 | 第33-34页 |
| 2.3.3 MD模拟轨迹稳定性分析 | 第34-35页 |
| 2.3.4 结合自由能分析 | 第35-43页 |
| 2.4 小结 | 第43页 |
| 参考文献 | 第43-49页 |
| 第三章 CK2激酶的天然黄酮抑制剂作用机理的理论性研究与分子设计 | 第49-80页 |
| 3.1 研究背景 | 第49-50页 |
| 3.2 材料与方法 | 第50-54页 |
| 3.2.1 生物数据集 | 第50-52页 |
| 3.2.2 蛋白质准备 | 第52-53页 |
| 3.2.3 配体构建 | 第53页 |
| 3.2.4 分子对接 | 第53页 |
| 3.2.5 分子动力学 | 第53-54页 |
| 3.2.6 结合自由能计算 | 第54页 |
| 3.2.7 结合自由能分解 | 第54页 |
| 3.3 结果与分析 | 第54-75页 |
| 3.3.1 分子对接 | 第54-60页 |
| 3.3.1.1 对接结果的评估 | 第54-58页 |
| 3.3.1.2 对接结构的比较 | 第58-60页 |
| 3.3.2 分子动力学 | 第60-72页 |
| 3.3.2.1 整体模拟结构的稳定性与柔性 | 第60-62页 |
| 3.3.2.2 结合自由能分析 | 第62-64页 |
| 3.3.2.3 配体结合的重要结构特征 | 第64-72页 |
| 3.3.3 设计出更高活性的抑制剂的独特结构见解 | 第72-75页 |
| 3.4 小结 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-80页 |
| 第四章 双靶向CK2和PIM1激酶抑制剂选择性作用机制的研究 | 第80-94页 |
| 4.1 研究背景 | 第80-81页 |
| 4.2 材料与方法 | 第81-83页 |
| 4.2.1 模拟体系的形成 | 第81-82页 |
| 4.2.2 分子动力学运行 | 第82页 |
| 4.2.3 结合自由能的MM/GBSA计算 | 第82页 |
| 4.2.4 自由能的MM/GBSA残基分解 | 第82-83页 |
| 4.3 结果与分析 | 第83-90页 |
| 4.3.1 分子轨迹的稳定性 | 第83页 |
| 4.3.2 结合自由能分析 | 第83-84页 |
| 4.3.3 结合自由能残基分解分析 | 第84-86页 |
| 4.3.4 结合模式分析 | 第86-90页 |
| 4.4 小结 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-94页 |
| 在学期间的研究成果 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95页 |