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油酸对HepG2细胞转录因子DNA结合活性影响的蛋白质组学分析

英文缩写词对照表第9-10页
中文摘要第10-12页
Abstract第12-13页
引言第14-16页
第一章 油酸诱导的HepG2细胞脂肪变性模型的建立第16-21页
    1. 材料与方法第16-17页
        1.1 实验材料第16页
        1.2 试剂第16页
        1.3 仪器第16-17页
        1.4 实验方法第17页
            1.4.1 HepG2细胞培养第17页
            1.4.2 HepG2细胞脂肪变性鉴定第17页
            1.4.3 HepG2细胞活力鉴定第17页
    2. 实验结果与分析第17-20页
        2.1 不同浓度油酸引起的HepG2细胞内脂滴的积聚第18页
        2.2 不同浓度油酸处理后HepG2细胞不同时间后,细胞活力鉴定第18-20页
    3. 讨论第20-21页
第二章 脂肪变性前后HepG2细胞蛋白样品制备以及质谱鉴定第21-42页
    1. HepG2细胞脂肪变性前后转录因子的富集及预分离第21-29页
        1.1. 实验材料第21-24页
        1.2 提取核蛋白试剂及配方第24页
        1.3 转录因子富集试剂及配方第24-25页
        1.4 仪器第25-26页
        1.5 实验方法第26-29页
            1.5.1 高盐低盐法提取细胞核蛋白第26页
            1.5.2 Thermo Kit法提取细胞核蛋白第26-27页
            1.5.3 Biotin标记的TFRE扩增和获得第27-28页
            1.5.4 转录因子富集及预分离第28-29页
    2. HepG2细胞脂肪变性前后全蛋白、脂滴蛋白的提取及预分离第29-33页
        2.1. 实验材料第29页
        2.2 试剂第29-30页
            2.2.1 全蛋白提取试剂及配方第29页
            2.2.2 脂滴蛋白提取试剂及配方第29-30页
            2.2.3 还原烷基化及溶液内酶解所用试剂及配方第30页
            2.2.4 sRP所用试剂及配方第30页
        2.3 仪器第30-31页
        2.4 实验方法第31-33页
            2.4.1 HepG2细胞全蛋白提取第31页
            2.4.2 HepG2细胞脂滴蛋白提取第31-32页
            2.4.3 还原烷基化及溶液内酶解第32页
            2.4.4 sRP对油酸处理组和对照组的细胞全蛋白、脂滴蛋白进行预分离第32-33页
    3. 蛋白样品的质谱鉴定第33-34页
        3.1 实验材料第33页
        3.2 试剂及配方第33页
        3.3 仪器第33页
        3.4 实验方法第33-34页
    4. 实验结果与分析第34-40页
        4.1 Biotin-TFRE的质控第35页
        4.2 两种不同方法提取核蛋白的比较第35页
        4.3 转录因子富集及SDS-PAGE预分离第35-36页
        4.4 TFRE对转录因子富集作用的质谱鉴定结果第36-39页
            4.4.1 TFRE对转录因子富集作用第36-38页
            4.4.2 转录因子DNA结合活性差异分析第38-39页
        4.5 全蛋白、脂滴蛋白获取与预分离结果第39页
        4.6 HepG2细胞全蛋白质谱鉴定结果第39-40页
        4.7 HepG2细胞脂相关蛋白质谱鉴定结果第40页
    5. 讨论第40-42页
第三章 生物信息学分析第42-50页
    1. 材料与方法第42-43页
        1.1 实验材料第42页
        1.2 软件第42页
        1.3 实验方法第42-43页
            1.3.1 聚类分析第42页
            1.3.2 利用Cytoscape_3.2.0进行基因的GO分类分析以及蛋白的Reactome分析第42页
            1.3.3 利用IPA对分析变化的蛋白所反应的油酸对HepG2的毒性作用以及变化的生物功能第42-43页
    2. 实验结果与分析第43-48页
        2.1 生物信息学分析DNA结合活性变化的转录因子的作用第43-46页
        2.2 生物信息学分析油酸处理后HepG2细胞内表达量变化的蛋白的作用第46-48页
    3. 讨论第48-50页
结论第50-52页
参考文献第52-56页
附录1第56-57页
附录2第57-58页
致谢第58-60页
相关文献综述 肝脏内脂肪酸对基因表达调控研究现状第60-72页
    中文摘要第60页
    Abstract第60-61页
    1. 脂肪酸的来源和对基因表达的控制第61-62页
        1.1 外源摄入的脂肪酸及其对基因表达的调控第61-62页
        1.2 内源性脂肪酸及其对基因表达的调控第62页
    2. 脂肪酸对肝脏转录因子的调控第62-64页
        2.1 脂肪酸对核受体的调控第62-63页
        2.2 脂肪酸对其他转录因子的调控第63-64页
    3. 源自膜结构的脂肪酸对基因表达的调控第64-65页
        3.1 细胞的膜结构第65页
        3.2 G蛋白偶联的脂肪酸受体第65页
        3.3 异前列腺素与氧化应激第65页
    4. 脂肪酸控制的基因表达与疾病的关系第65-66页
    5. 总结与展望第66-67页
    参考文献第67-72页

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