| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 第一章 引言 | 第17-27页 |
| 1.1 虾夷扇贝定居群体背景介绍 | 第17-19页 |
| 1.1.1 虾夷扇贝的分类学地位 | 第17页 |
| 1.1.2 虾夷扇贝的生物学特征 | 第17-18页 |
| 1.1.3 虾夷扇贝的引入及其养殖 | 第18页 |
| 1.1.4 虾夷扇贝养殖中存在的问题 | 第18-19页 |
| 1.2 虾夷扇贝群体遗传学研究进展 | 第19-23页 |
| 1.2.1 种群遗传结构(population genetic structure) | 第19-20页 |
| 1.2.2 种群遗传结构研究方法 | 第20页 |
| 1.2.3 分子标记技术 | 第20-21页 |
| 1.2.4 基于生化标记技术的虾夷扇贝群体遗传学研究进展 | 第21-22页 |
| 1.2.5 基于分子标记技术的虾夷扇贝群体遗传学研究进展 | 第22-23页 |
| 1.3.基于形态学和遗传学的虾夷扇贝种贝研究进展 | 第23-24页 |
| 1.3.1 基于形态学的虾夷扇贝种贝研究进展 | 第24页 |
| 1.3.2 基于遗传学的虾夷扇贝种贝研究进展 | 第24页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第24-26页 |
| 1.5 本研究技术路线图 | 第26-27页 |
| 第二章 虾夷扇贝定居群种质特性分析 | 第27-34页 |
| 2.1 材料与方法 | 第28页 |
| 2.2 结果 | 第28-32页 |
| 2.2.1 虾夷扇贝定居群基础生物学 | 第28-31页 |
| 2.2.1.1 虾夷扇贝定居群形态 | 第28-29页 |
| 2.2.1.2 虾夷扇贝定居群生活史 | 第29-30页 |
| 2.2.1.3 虾夷扇贝定居群的生态位 | 第30-31页 |
| 2.2.2 虾夷扇贝定居群遗传学 | 第31-32页 |
| 2.3 讨论 | 第32-34页 |
| 第三章 基于二代测序的虾夷扇贝SSR标记的开发和筛选 | 第34-51页 |
| 3.1 材料与方法 | 第34-40页 |
| 3.1.1 材料 | 第34-35页 |
| 3.1.2 基因组DNA提取 | 第35-36页 |
| 3.1.3 微卫星位点的搜索 | 第36-37页 |
| 3.1.4 微卫星引物的设计及合成 | 第37页 |
| 3.1.5 微卫星引物的筛选及遗传多样性分析 | 第37-39页 |
| 3.1.5.1 微卫星引物的筛选 | 第37-38页 |
| 3.1.5.2 微卫星引物遗传多样性分析 | 第38-39页 |
| 3.1.6 引物跨种扩增分析 | 第39页 |
| 3.1.7 数据统计与分析 | 第39-40页 |
| 3.2 结果 | 第40-48页 |
| 3.2.1 高通量测序结果 | 第40-41页 |
| 3.2.2 虾夷扇贝SSR位点的分布特征分析 | 第41-43页 |
| 3.2.3 SSR标记的筛选及种群遗传学评价结果 | 第43-48页 |
| 3.3 讨论 | 第48-51页 |
| 3.3.1 高通量测序获取微卫星标记的优越性 | 第48-49页 |
| 3.3.2 虾夷扇贝微卫星标记的种群遗传学特征 | 第49-51页 |
| 第四章 基于线粒体Cyt b基因的虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)群体遗传结构分析 | 第51-60页 |
| 4.1 材料与方法 | 第51-53页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第51-52页 |
| 4.1.2 基因组DNA提取 | 第52页 |
| 4.1.3 PCR扩增与电泳检测 | 第52-53页 |
| 4.1.4 数据分析 | 第53页 |
| 4.2 结果与分析 | 第53-58页 |
| 4.2.1 虾夷扇贝线粒体Cyt b基因序列特征 | 第53-54页 |
| 4.2.2 虾夷扇贝群体遗传多样性 | 第54-55页 |
| 4.2.3 虾夷扇贝群体遗传结构 | 第55-57页 |
| 4.2.4 系统进化树 | 第57-58页 |
| 4.3 讨论 | 第58-59页 |
| 4.3.1 虾夷扇贝日本群体与中国群体之间的遗传分化 | 第58页 |
| 4.3.2 虾夷扇贝中国群体的遗传多样性 | 第58-59页 |
| 4.4 小结 | 第59-60页 |
| 第五章 基于GBS测序虾夷扇贝种群分析 | 第60-75页 |
| 5.1 材料和方法 | 第60-64页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第60-61页 |
| 5.1.2 实验方法 | 第61-63页 |
| 5.1.2.1 基因组DNA提取 | 第61页 |
| 5.1.2.2 基因组文库的构建及测序 | 第61页 |
| 5.1.2.3 测序数据统计及质量控制 | 第61-62页 |
| 5.1.2.4 SNP检测及过滤 | 第62-63页 |
| 5.1.3 群体遗传多样性分析 | 第63-64页 |
| 5.1.3.1 群体进化树分析 | 第63页 |
| 5.1.3.2 群体主成分分析 | 第63-64页 |
| 5.1.3.3 群体遗传结构 | 第64页 |
| 5.2 结果 | 第64-72页 |
| 5.2.1 简化基因组测序结果以及质量评估 | 第64-65页 |
| 5.2.2 聚类检测SNP结果 | 第65页 |
| 5.2.3 群体遗传多样性分析结果 | 第65-72页 |
| 5.2.3.1 群体系统进化树 | 第65-68页 |
| 5.2.3.2 群体主成分分析结果 | 第68-69页 |
| 5.2.3.3 群体遗传结构分析结果 | 第69-72页 |
| 5.3 讨论 | 第72-74页 |
| 5.3.1 虾夷扇贝日本群体与中国群体的关系 | 第72-73页 |
| 5.3.2 虾夷扇贝中国各群体间的相互关系 | 第73页 |
| 5.3.3 虾夷扇贝中国旅顺自然群体的来源 | 第73-74页 |
| 5.3.4“獐子岛红”人工繁育品种养殖群体与獐子岛群的相互关系 | 第74页 |
| 5.4 小结 | 第74-75页 |
| 第六章 结论 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-85页 |
| 参与的课题及论文完成情况 | 第85-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
